Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3LBD2

Protein Details
Accession E3LBD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-222QPSRPATPSRSPKSRKKSNSASKSHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
206-216RSPKSRKKSNS
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031398  She3  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048309  P:endoplasmic reticulum inheritance  
GO:0051028  P:mRNA transport  
KEGG pgr:PGTG_19754  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17078  SHE3  
Amino Acid Sequences MDSKPASSSSSSRAHPSSRKTSISADSRRSLSISPTNPRTTHQKSQLPLPLRTQESNILSPSSTKFSQLKAFHRSVSSSSADQLAQRPPRTLSRKPSSTKTLPTKNSNCNFKSAQSTPPTPNGQPTHQNHQVTMLKEQLAKLQSELRIARGQVATLDNQLTRSKTPPSKTPPFGSSLNSSQRLQQQQQQQHSSHSTQPSRPATPSRSPKSRKKSNSASKSHSLRKSSSSANSEQTDGLSIRFISGPGIHSSRSPQPSSIMDDSSLPISDSGYIKDPDGVWVPLNSPPAHSPSLNLSSSARYKSPSPSEAPRGISRIPISAVALGRVLAGDPLVPDHQSFQADIAEEQEPAEDHCDSVPRNSEYSSGASLSSPQIDDQNTTASTEPPGSHPPAVSRQPRGNPFFSSGGGRDRGAMIHQNSNADRTTNGGNTGKVITTLQSDLLYARTALDQSKSQLRLSQRAVESLNRQTEDLKESMSRLRLENEGLSKMLSRKERTVSELMDRLKRSEAELSTLKQEKKELDVNFKKISKETDEVVKDSVRRRDRAETQYEAVRSGVKSLSEGWKRDVTTLKQDICRLEEKHRKEMEDSRLKYNTLAKLHASRSGALSRIETDLNNLQSSKEGFIAKYTSELSGLRAHLEEEEKKSSEGLQLAKEVSDECARFKRILRNHSTGSSSSAAAAPGPPHPKLKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.5
3 0.56
4 0.59
5 0.59
6 0.61
7 0.58
8 0.6
9 0.6
10 0.63
11 0.62
12 0.6
13 0.58
14 0.56
15 0.54
16 0.51
17 0.43
18 0.4
19 0.41
20 0.41
21 0.45
22 0.5
23 0.55
24 0.53
25 0.56
26 0.59
27 0.58
28 0.61
29 0.62
30 0.61
31 0.58
32 0.66
33 0.71
34 0.67
35 0.62
36 0.59
37 0.57
38 0.55
39 0.55
40 0.48
41 0.47
42 0.46
43 0.45
44 0.4
45 0.34
46 0.29
47 0.3
48 0.3
49 0.28
50 0.23
51 0.26
52 0.27
53 0.29
54 0.38
55 0.43
56 0.47
57 0.5
58 0.52
59 0.5
60 0.5
61 0.48
62 0.42
63 0.4
64 0.36
65 0.29
66 0.28
67 0.27
68 0.25
69 0.25
70 0.27
71 0.3
72 0.34
73 0.35
74 0.36
75 0.37
76 0.46
77 0.51
78 0.55
79 0.57
80 0.6
81 0.67
82 0.69
83 0.73
84 0.73
85 0.72
86 0.73
87 0.73
88 0.73
89 0.71
90 0.76
91 0.76
92 0.77
93 0.79
94 0.79
95 0.7
96 0.66
97 0.61
98 0.54
99 0.54
100 0.47
101 0.47
102 0.44
103 0.48
104 0.46
105 0.5
106 0.52
107 0.45
108 0.51
109 0.47
110 0.45
111 0.5
112 0.51
113 0.53
114 0.56
115 0.56
116 0.48
117 0.52
118 0.51
119 0.44
120 0.41
121 0.36
122 0.31
123 0.31
124 0.32
125 0.29
126 0.27
127 0.25
128 0.23
129 0.25
130 0.24
131 0.28
132 0.29
133 0.26
134 0.27
135 0.27
136 0.3
137 0.25
138 0.24
139 0.21
140 0.22
141 0.19
142 0.18
143 0.2
144 0.15
145 0.17
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.21
150 0.27
151 0.32
152 0.35
153 0.42
154 0.49
155 0.56
156 0.59
157 0.61
158 0.55
159 0.53
160 0.51
161 0.46
162 0.42
163 0.4
164 0.41
165 0.4
166 0.38
167 0.38
168 0.43
169 0.46
170 0.44
171 0.44
172 0.46
173 0.51
174 0.59
175 0.6
176 0.54
177 0.52
178 0.54
179 0.5
180 0.47
181 0.47
182 0.44
183 0.4
184 0.48
185 0.48
186 0.46
187 0.46
188 0.46
189 0.45
190 0.5
191 0.57
192 0.56
193 0.61
194 0.66
195 0.73
196 0.77
197 0.81
198 0.79
199 0.79
200 0.82
201 0.83
202 0.85
203 0.82
204 0.79
205 0.77
206 0.76
207 0.76
208 0.71
209 0.64
210 0.57
211 0.54
212 0.51
213 0.47
214 0.46
215 0.42
216 0.39
217 0.4
218 0.39
219 0.35
220 0.31
221 0.27
222 0.22
223 0.18
224 0.14
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.17
238 0.23
239 0.26
240 0.26
241 0.23
242 0.25
243 0.27
244 0.32
245 0.3
246 0.24
247 0.2
248 0.2
249 0.2
250 0.17
251 0.15
252 0.09
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.14
265 0.13
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.16
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.17
275 0.19
276 0.18
277 0.16
278 0.18
279 0.23
280 0.22
281 0.21
282 0.18
283 0.19
284 0.22
285 0.23
286 0.19
287 0.16
288 0.17
289 0.22
290 0.25
291 0.25
292 0.27
293 0.3
294 0.35
295 0.37
296 0.38
297 0.34
298 0.33
299 0.3
300 0.29
301 0.24
302 0.2
303 0.17
304 0.14
305 0.13
306 0.12
307 0.12
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.08
338 0.06
339 0.05
340 0.06
341 0.08
342 0.08
343 0.1
344 0.14
345 0.13
346 0.14
347 0.15
348 0.16
349 0.15
350 0.17
351 0.16
352 0.12
353 0.11
354 0.1
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.14
374 0.15
375 0.16
376 0.16
377 0.17
378 0.22
379 0.29
380 0.3
381 0.31
382 0.35
383 0.4
384 0.46
385 0.48
386 0.45
387 0.39
388 0.39
389 0.36
390 0.32
391 0.28
392 0.22
393 0.21
394 0.2
395 0.18
396 0.15
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.17
401 0.16
402 0.19
403 0.19
404 0.22
405 0.22
406 0.24
407 0.22
408 0.18
409 0.15
410 0.13
411 0.15
412 0.12
413 0.16
414 0.15
415 0.15
416 0.16
417 0.17
418 0.14
419 0.12
420 0.12
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.11
437 0.13
438 0.2
439 0.21
440 0.21
441 0.25
442 0.27
443 0.32
444 0.34
445 0.39
446 0.33
447 0.34
448 0.35
449 0.34
450 0.35
451 0.35
452 0.36
453 0.29
454 0.29
455 0.27
456 0.27
457 0.28
458 0.23
459 0.19
460 0.15
461 0.16
462 0.2
463 0.22
464 0.22
465 0.19
466 0.21
467 0.21
468 0.22
469 0.23
470 0.22
471 0.2
472 0.18
473 0.18
474 0.17
475 0.18
476 0.22
477 0.25
478 0.26
479 0.29
480 0.34
481 0.36
482 0.39
483 0.41
484 0.38
485 0.37
486 0.4
487 0.39
488 0.4
489 0.38
490 0.35
491 0.33
492 0.31
493 0.28
494 0.29
495 0.26
496 0.25
497 0.27
498 0.27
499 0.31
500 0.37
501 0.36
502 0.31
503 0.34
504 0.3
505 0.32
506 0.38
507 0.35
508 0.39
509 0.45
510 0.49
511 0.53
512 0.54
513 0.5
514 0.45
515 0.46
516 0.41
517 0.36
518 0.33
519 0.36
520 0.36
521 0.35
522 0.35
523 0.33
524 0.32
525 0.35
526 0.42
527 0.4
528 0.4
529 0.43
530 0.5
531 0.56
532 0.6
533 0.61
534 0.56
535 0.53
536 0.55
537 0.51
538 0.43
539 0.35
540 0.3
541 0.23
542 0.21
543 0.19
544 0.14
545 0.15
546 0.18
547 0.27
548 0.3
549 0.32
550 0.33
551 0.37
552 0.37
553 0.4
554 0.44
555 0.39
556 0.42
557 0.48
558 0.49
559 0.48
560 0.51
561 0.49
562 0.46
563 0.48
564 0.42
565 0.45
566 0.49
567 0.51
568 0.58
569 0.6
570 0.58
571 0.57
572 0.62
573 0.62
574 0.63
575 0.61
576 0.58
577 0.57
578 0.55
579 0.53
580 0.51
581 0.48
582 0.41
583 0.4
584 0.37
585 0.41
586 0.42
587 0.44
588 0.39
589 0.33
590 0.34
591 0.34
592 0.32
593 0.27
594 0.26
595 0.23
596 0.23
597 0.23
598 0.19
599 0.21
600 0.24
601 0.26
602 0.26
603 0.24
604 0.22
605 0.24
606 0.26
607 0.22
608 0.2
609 0.2
610 0.18
611 0.21
612 0.23
613 0.2
614 0.21
615 0.21
616 0.18
617 0.18
618 0.18
619 0.18
620 0.21
621 0.21
622 0.2
623 0.19
624 0.19
625 0.2
626 0.25
627 0.28
628 0.28
629 0.33
630 0.32
631 0.33
632 0.33
633 0.31
634 0.3
635 0.3
636 0.28
637 0.25
638 0.27
639 0.27
640 0.26
641 0.25
642 0.21
643 0.2
644 0.23
645 0.21
646 0.23
647 0.29
648 0.32
649 0.34
650 0.4
651 0.46
652 0.49
653 0.58
654 0.62
655 0.62
656 0.65
657 0.66
658 0.64
659 0.55
660 0.52
661 0.43
662 0.35
663 0.29
664 0.25
665 0.21
666 0.17
667 0.19
668 0.15
669 0.2
670 0.25
671 0.26