Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JQ72

Protein Details
Accession E3JQ72    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-87STAPEPPPTERKRKSRWGAESEKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
215-226RGRGSVKEGKGR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR004087  KH_dom  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0048024  P:regulation of mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pgr:PGTG_00318  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00013  KH_1  
PF16275  SF1-HH  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50084  KH_TYPE_1  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd02395  KH-I_BBP  
Amino Acid Sequences MWRNGNKVTGTNDAPLGAPRRWGGSQSDSKDSGAFGGLGAPTSYTSAPTTNRDDAPPPPPPPASTAPEPPPTERKRKSRWGAESEKVNVAGLPVAINGTIDAADLDRYAATLRLEQVNNKLRNGDVVPPEKERSPSPPPTYDGQGRRTNTREFRYRRKLEDERTKLIERSGRPSEKVYIPIKEFPEIKFFGLLVGPRGNSLKKMEGESGAKISIRGRGSVKEGKGRKEEFAGDDDDEMHCLVTADTQDKVDKCVRLINKVIETACSVPESQNEQKLNQLRELAQLNGTFRDFENQVCQNCGNPGHRKYDCPEQRNFSAGIICRICGGAGHMARDCTQRRGFNSGSSAAGGGVAQAFDSEYASLMAELGETSKVAPISEEGQNGQSDTPKHQSNWAGPPGSSTPARNGDSGAPSNTVPPWRVASNWHPPQPPQHHGGPYGQRNAYVFNAAQHGHHNHNHHNHHGHPHQHHYHGQHAHHHPQQHQQHIHQHQPAQPIMPTGAPGTEAGLASAAPSFVPQGAYAGYYGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.29
4 0.23
5 0.24
6 0.22
7 0.27
8 0.27
9 0.29
10 0.3
11 0.34
12 0.43
13 0.44
14 0.5
15 0.46
16 0.46
17 0.44
18 0.38
19 0.3
20 0.22
21 0.17
22 0.11
23 0.12
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.12
33 0.16
34 0.19
35 0.24
36 0.3
37 0.33
38 0.35
39 0.36
40 0.38
41 0.39
42 0.42
43 0.44
44 0.4
45 0.4
46 0.4
47 0.38
48 0.41
49 0.42
50 0.42
51 0.39
52 0.44
53 0.44
54 0.5
55 0.52
56 0.5
57 0.54
58 0.56
59 0.62
60 0.64
61 0.68
62 0.69
63 0.77
64 0.82
65 0.83
66 0.85
67 0.83
68 0.83
69 0.79
70 0.77
71 0.7
72 0.63
73 0.53
74 0.44
75 0.34
76 0.26
77 0.2
78 0.13
79 0.09
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.08
97 0.08
98 0.1
99 0.13
100 0.18
101 0.2
102 0.22
103 0.31
104 0.39
105 0.4
106 0.39
107 0.38
108 0.31
109 0.34
110 0.34
111 0.32
112 0.29
113 0.33
114 0.35
115 0.37
116 0.4
117 0.38
118 0.38
119 0.33
120 0.33
121 0.36
122 0.41
123 0.43
124 0.45
125 0.46
126 0.47
127 0.5
128 0.51
129 0.49
130 0.47
131 0.49
132 0.47
133 0.5
134 0.51
135 0.53
136 0.52
137 0.54
138 0.57
139 0.56
140 0.65
141 0.7
142 0.72
143 0.69
144 0.71
145 0.73
146 0.73
147 0.77
148 0.73
149 0.68
150 0.68
151 0.64
152 0.55
153 0.51
154 0.47
155 0.38
156 0.38
157 0.42
158 0.39
159 0.38
160 0.4
161 0.41
162 0.38
163 0.42
164 0.39
165 0.34
166 0.35
167 0.38
168 0.37
169 0.36
170 0.35
171 0.29
172 0.31
173 0.28
174 0.25
175 0.21
176 0.19
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.11
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.16
188 0.19
189 0.18
190 0.21
191 0.21
192 0.23
193 0.24
194 0.23
195 0.21
196 0.18
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.16
201 0.15
202 0.16
203 0.17
204 0.18
205 0.24
206 0.29
207 0.3
208 0.33
209 0.36
210 0.38
211 0.43
212 0.43
213 0.39
214 0.35
215 0.35
216 0.28
217 0.27
218 0.24
219 0.18
220 0.16
221 0.16
222 0.13
223 0.12
224 0.1
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.1
235 0.1
236 0.14
237 0.17
238 0.16
239 0.16
240 0.21
241 0.22
242 0.23
243 0.26
244 0.26
245 0.24
246 0.25
247 0.25
248 0.2
249 0.2
250 0.16
251 0.14
252 0.12
253 0.1
254 0.09
255 0.11
256 0.16
257 0.17
258 0.22
259 0.23
260 0.22
261 0.27
262 0.33
263 0.32
264 0.27
265 0.27
266 0.22
267 0.24
268 0.25
269 0.21
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.14
275 0.12
276 0.1
277 0.13
278 0.11
279 0.11
280 0.15
281 0.18
282 0.19
283 0.2
284 0.2
285 0.17
286 0.19
287 0.22
288 0.22
289 0.25
290 0.28
291 0.34
292 0.35
293 0.37
294 0.38
295 0.46
296 0.48
297 0.46
298 0.47
299 0.45
300 0.45
301 0.45
302 0.42
303 0.32
304 0.28
305 0.24
306 0.25
307 0.2
308 0.18
309 0.16
310 0.15
311 0.14
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.14
317 0.14
318 0.15
319 0.17
320 0.23
321 0.23
322 0.23
323 0.28
324 0.3
325 0.32
326 0.38
327 0.37
328 0.34
329 0.36
330 0.31
331 0.27
332 0.23
333 0.21
334 0.14
335 0.13
336 0.1
337 0.06
338 0.05
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.11
364 0.14
365 0.15
366 0.14
367 0.16
368 0.16
369 0.17
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.18
374 0.22
375 0.24
376 0.25
377 0.3
378 0.34
379 0.36
380 0.42
381 0.43
382 0.4
383 0.36
384 0.39
385 0.36
386 0.34
387 0.3
388 0.24
389 0.24
390 0.29
391 0.31
392 0.28
393 0.27
394 0.27
395 0.31
396 0.32
397 0.28
398 0.23
399 0.21
400 0.23
401 0.23
402 0.23
403 0.19
404 0.18
405 0.2
406 0.19
407 0.2
408 0.24
409 0.3
410 0.38
411 0.44
412 0.49
413 0.48
414 0.49
415 0.58
416 0.6
417 0.57
418 0.51
419 0.5
420 0.47
421 0.47
422 0.53
423 0.51
424 0.5
425 0.53
426 0.48
427 0.43
428 0.41
429 0.41
430 0.35
431 0.3
432 0.23
433 0.18
434 0.21
435 0.2
436 0.21
437 0.24
438 0.27
439 0.29
440 0.34
441 0.37
442 0.42
443 0.51
444 0.55
445 0.56
446 0.57
447 0.56
448 0.6
449 0.61
450 0.62
451 0.58
452 0.63
453 0.61
454 0.62
455 0.63
456 0.58
457 0.6
458 0.58
459 0.56
460 0.56
461 0.57
462 0.61
463 0.59
464 0.61
465 0.56
466 0.59
467 0.64
468 0.64
469 0.63
470 0.62
471 0.68
472 0.69
473 0.73
474 0.69
475 0.67
476 0.62
477 0.62
478 0.57
479 0.49
480 0.43
481 0.37
482 0.32
483 0.27
484 0.23
485 0.17
486 0.16
487 0.14
488 0.13
489 0.12
490 0.13
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.09
496 0.09
497 0.08
498 0.05
499 0.06
500 0.07
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.1
505 0.1
506 0.11