Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2HCV7

Protein Details
Accession Q2HCV7    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-65QLFHDPVGSRGKKRKRRRGAQDDEPEGDBasic
132-171AEEPASKKKSSKKKKKETEGKDKKDKKDEHKKQIFPQPLTBasic
617-658KATITTKSSWERRREHNRAQAVEASKRRKRQRREEGPAAGEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-56SRGKKRKRRRG
137-163SKKKSSKKKKKETEGKDKKDKKDEHKK
597-650AKEDKRKLKVRGVESRRTGGKATITTKSSWERRREHNRAQAVEASKRRKRQRRE
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 5, cyto 5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044764  DDX52/Rok1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17957  DEADc_DDX52  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDILRVLSRGIKPNPKSKAQAGGATTQLPSAGALPRPQLFHDPVGSRGKKRKRRRGAQDDEPEGDDQELSDVDYFAPKKAAPEAAPTDVEESPKKRKIKLLDEDECRQILRSHRLKLTILSDQPQAEAKTEAEEPASKKKSSKKKKKETEGKDKKDKKDEHKKQIFPQPLTSFGELRHTYDVSPQLAANIAAQGFRVPTEVQMASLPLLLQPTTALKKSEGADIPNIDNGADFLAVAPTGSGKTITFLIPAIDGVLRRRAEEGRDTDQHVLEAVVVAPTRELATQIVNEGRKLAIGTGVRVVLMKRALKLDVEEVADEKSKDLEEGSGSEQGSGDEESEGEEESEGEEGKTSKEAKPLARVDILVTTPKILLNFLSGKAGARRLLPSVRSLILDEADVLLDPLFRKQTMAICRACTHPNVALTCWSATMASNVEALVTKHLLQARQEDRQPTPALHDELKYDIPLEAGGSARVAVLHSSMADSARSKIMARFRAGEVWVLVTTDVLARGVDFAGVNGVVNYDVPTSAAAYVHRAGRTGRAGREGGVAVTFYTKDDIPFVKSVANVIAASEKQAGVQADGGGGGTVQKWLLDALPKVAKEDKRKLKVRGVESRRTGGKATITTKSSWERRREHNRAQAVEASKRRKRQRREEGPAAGEAEGEWGGLED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.67
3 0.69
4 0.65
5 0.67
6 0.61
7 0.61
8 0.55
9 0.52
10 0.47
11 0.43
12 0.38
13 0.28
14 0.23
15 0.17
16 0.14
17 0.13
18 0.15
19 0.15
20 0.18
21 0.22
22 0.25
23 0.27
24 0.29
25 0.33
26 0.33
27 0.34
28 0.38
29 0.35
30 0.38
31 0.47
32 0.5
33 0.51
34 0.57
35 0.65
36 0.68
37 0.78
38 0.83
39 0.84
40 0.9
41 0.93
42 0.94
43 0.93
44 0.93
45 0.92
46 0.87
47 0.79
48 0.7
49 0.59
50 0.49
51 0.39
52 0.28
53 0.18
54 0.13
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.14
61 0.15
62 0.15
63 0.17
64 0.16
65 0.18
66 0.21
67 0.26
68 0.21
69 0.28
70 0.32
71 0.33
72 0.34
73 0.32
74 0.32
75 0.28
76 0.31
77 0.29
78 0.29
79 0.35
80 0.42
81 0.45
82 0.46
83 0.52
84 0.58
85 0.63
86 0.68
87 0.7
88 0.71
89 0.73
90 0.73
91 0.69
92 0.6
93 0.5
94 0.41
95 0.34
96 0.33
97 0.36
98 0.4
99 0.43
100 0.47
101 0.5
102 0.5
103 0.5
104 0.48
105 0.45
106 0.41
107 0.37
108 0.36
109 0.33
110 0.33
111 0.32
112 0.28
113 0.22
114 0.21
115 0.18
116 0.17
117 0.18
118 0.17
119 0.15
120 0.18
121 0.2
122 0.28
123 0.32
124 0.31
125 0.36
126 0.45
127 0.54
128 0.61
129 0.7
130 0.71
131 0.78
132 0.87
133 0.93
134 0.95
135 0.94
136 0.94
137 0.94
138 0.93
139 0.93
140 0.91
141 0.88
142 0.87
143 0.85
144 0.84
145 0.85
146 0.85
147 0.86
148 0.87
149 0.85
150 0.83
151 0.83
152 0.81
153 0.72
154 0.7
155 0.61
156 0.56
157 0.53
158 0.47
159 0.39
160 0.3
161 0.36
162 0.28
163 0.28
164 0.26
165 0.23
166 0.21
167 0.25
168 0.28
169 0.21
170 0.21
171 0.19
172 0.16
173 0.16
174 0.16
175 0.12
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.1
200 0.12
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.18
205 0.19
206 0.25
207 0.23
208 0.22
209 0.24
210 0.25
211 0.25
212 0.22
213 0.21
214 0.14
215 0.12
216 0.11
217 0.08
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.17
246 0.17
247 0.19
248 0.25
249 0.28
250 0.28
251 0.3
252 0.32
253 0.32
254 0.31
255 0.28
256 0.22
257 0.17
258 0.11
259 0.09
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.07
271 0.07
272 0.09
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.08
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.09
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.07
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.08
338 0.1
339 0.11
340 0.15
341 0.19
342 0.2
343 0.28
344 0.29
345 0.29
346 0.28
347 0.27
348 0.23
349 0.21
350 0.2
351 0.14
352 0.12
353 0.1
354 0.09
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.14
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.14
371 0.17
372 0.17
373 0.18
374 0.18
375 0.18
376 0.17
377 0.17
378 0.15
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.07
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.09
394 0.15
395 0.2
396 0.26
397 0.26
398 0.28
399 0.29
400 0.32
401 0.32
402 0.27
403 0.24
404 0.21
405 0.23
406 0.22
407 0.21
408 0.2
409 0.2
410 0.19
411 0.16
412 0.13
413 0.1
414 0.09
415 0.1
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.11
427 0.14
428 0.15
429 0.16
430 0.24
431 0.27
432 0.31
433 0.34
434 0.35
435 0.35
436 0.38
437 0.38
438 0.3
439 0.31
440 0.29
441 0.29
442 0.27
443 0.26
444 0.22
445 0.23
446 0.24
447 0.19
448 0.15
449 0.12
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.09
470 0.1
471 0.11
472 0.12
473 0.12
474 0.16
475 0.23
476 0.27
477 0.29
478 0.3
479 0.31
480 0.33
481 0.33
482 0.3
483 0.23
484 0.2
485 0.17
486 0.14
487 0.12
488 0.09
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.11
517 0.14
518 0.17
519 0.17
520 0.18
521 0.18
522 0.22
523 0.3
524 0.32
525 0.32
526 0.33
527 0.33
528 0.33
529 0.35
530 0.3
531 0.23
532 0.18
533 0.15
534 0.11
535 0.12
536 0.11
537 0.09
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.13
542 0.15
543 0.18
544 0.19
545 0.19
546 0.19
547 0.19
548 0.19
549 0.17
550 0.17
551 0.13
552 0.13
553 0.15
554 0.13
555 0.15
556 0.16
557 0.14
558 0.12
559 0.16
560 0.16
561 0.13
562 0.14
563 0.12
564 0.11
565 0.11
566 0.1
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.06
575 0.06
576 0.09
577 0.13
578 0.14
579 0.19
580 0.24
581 0.25
582 0.28
583 0.35
584 0.4
585 0.45
586 0.55
587 0.59
588 0.64
589 0.72
590 0.76
591 0.78
592 0.79
593 0.79
594 0.8
595 0.77
596 0.77
597 0.74
598 0.74
599 0.68
600 0.62
601 0.55
602 0.47
603 0.45
604 0.43
605 0.42
606 0.41
607 0.4
608 0.39
609 0.43
610 0.48
611 0.51
612 0.53
613 0.58
614 0.58
615 0.67
616 0.77
617 0.81
618 0.82
619 0.83
620 0.83
621 0.77
622 0.75
623 0.71
624 0.66
625 0.66
626 0.64
627 0.64
628 0.63
629 0.69
630 0.75
631 0.78
632 0.83
633 0.85
634 0.87
635 0.89
636 0.91
637 0.92
638 0.9
639 0.83
640 0.75
641 0.66
642 0.54
643 0.43
644 0.32
645 0.24
646 0.15
647 0.12