Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QED0

Protein Details
Accession E3QED0    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-413QELPRKRKAVDIFMPKKKGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
335-350PRAKSNIRVERPPPKP
398-414RKRKAVDIFMPKKKGRR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 9, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MAPVKSLAELCVAVCQRHITELSSVGNGDTLQYHHVRDILMRVTNPAQLREIEINSPHIQGETSEIWLRLIKKEFPTESHDKNYAPKNPSKWYKIYERYAEERRHAQQQAEAELLARVQGLQQKKDNNVSRIVDPKFARFLPKPPKTGRTFGTRGRGGKELPSSLSFAAGSRMKTTTGASVMKKARREAKEIVGIRSNLAVPTGLIRAPRLGKAPPSMAAEHRISTQPVFRPTSTSSRPPTHSTYVAASKTTYVSDSSDDEGGDLFGDEGTPRQKGGKTGSSAGPISPLNKPTGSKDRNLSTSASSSSGSKLSPPSLKLHSAGLRRGGGILGNAPRAKSNIRVERPPPKPEPAIRIAEPSRAHKVLAQNNGPQSPPLPAFLDEMQPTRPTLSNQELPRKRKAVDIFMPKKKGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.2
4 0.23
5 0.24
6 0.19
7 0.2
8 0.24
9 0.25
10 0.23
11 0.22
12 0.19
13 0.18
14 0.15
15 0.14
16 0.11
17 0.1
18 0.14
19 0.16
20 0.17
21 0.17
22 0.19
23 0.18
24 0.19
25 0.23
26 0.23
27 0.25
28 0.24
29 0.27
30 0.27
31 0.32
32 0.32
33 0.29
34 0.26
35 0.23
36 0.27
37 0.28
38 0.28
39 0.26
40 0.26
41 0.29
42 0.29
43 0.29
44 0.25
45 0.21
46 0.19
47 0.15
48 0.19
49 0.15
50 0.17
51 0.18
52 0.18
53 0.19
54 0.22
55 0.24
56 0.24
57 0.27
58 0.29
59 0.32
60 0.39
61 0.4
62 0.4
63 0.47
64 0.48
65 0.49
66 0.5
67 0.48
68 0.42
69 0.47
70 0.51
71 0.51
72 0.5
73 0.51
74 0.51
75 0.57
76 0.64
77 0.64
78 0.61
79 0.58
80 0.62
81 0.65
82 0.66
83 0.64
84 0.61
85 0.62
86 0.65
87 0.64
88 0.58
89 0.56
90 0.52
91 0.53
92 0.5
93 0.44
94 0.39
95 0.38
96 0.36
97 0.3
98 0.26
99 0.19
100 0.16
101 0.15
102 0.11
103 0.08
104 0.05
105 0.06
106 0.12
107 0.15
108 0.19
109 0.24
110 0.29
111 0.33
112 0.42
113 0.47
114 0.44
115 0.47
116 0.45
117 0.44
118 0.47
119 0.45
120 0.42
121 0.37
122 0.36
123 0.34
124 0.32
125 0.35
126 0.29
127 0.37
128 0.41
129 0.46
130 0.51
131 0.52
132 0.59
133 0.58
134 0.61
135 0.55
136 0.52
137 0.5
138 0.49
139 0.52
140 0.48
141 0.46
142 0.44
143 0.43
144 0.35
145 0.35
146 0.32
147 0.25
148 0.23
149 0.22
150 0.21
151 0.18
152 0.18
153 0.14
154 0.11
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.13
164 0.14
165 0.17
166 0.16
167 0.23
168 0.28
169 0.31
170 0.33
171 0.35
172 0.4
173 0.39
174 0.44
175 0.41
176 0.41
177 0.45
178 0.45
179 0.43
180 0.38
181 0.35
182 0.3
183 0.27
184 0.22
185 0.13
186 0.11
187 0.09
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.11
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.16
201 0.17
202 0.17
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.21
207 0.2
208 0.18
209 0.19
210 0.17
211 0.15
212 0.15
213 0.18
214 0.17
215 0.21
216 0.23
217 0.22
218 0.25
219 0.27
220 0.34
221 0.34
222 0.36
223 0.37
224 0.39
225 0.42
226 0.43
227 0.45
228 0.41
229 0.39
230 0.34
231 0.32
232 0.32
233 0.3
234 0.26
235 0.21
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.13
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.07
251 0.06
252 0.04
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.11
261 0.12
262 0.16
263 0.22
264 0.26
265 0.28
266 0.31
267 0.33
268 0.33
269 0.32
270 0.29
271 0.26
272 0.2
273 0.19
274 0.19
275 0.19
276 0.18
277 0.19
278 0.21
279 0.24
280 0.35
281 0.35
282 0.36
283 0.4
284 0.42
285 0.44
286 0.45
287 0.4
288 0.32
289 0.31
290 0.28
291 0.24
292 0.2
293 0.18
294 0.18
295 0.17
296 0.15
297 0.15
298 0.16
299 0.19
300 0.23
301 0.24
302 0.27
303 0.3
304 0.32
305 0.31
306 0.34
307 0.36
308 0.36
309 0.37
310 0.37
311 0.34
312 0.32
313 0.31
314 0.26
315 0.2
316 0.16
317 0.17
318 0.15
319 0.19
320 0.2
321 0.2
322 0.21
323 0.23
324 0.24
325 0.27
326 0.34
327 0.4
328 0.44
329 0.52
330 0.58
331 0.66
332 0.7
333 0.7
334 0.66
335 0.62
336 0.64
337 0.62
338 0.63
339 0.59
340 0.59
341 0.52
342 0.55
343 0.5
344 0.49
345 0.46
346 0.44
347 0.45
348 0.39
349 0.39
350 0.35
351 0.43
352 0.44
353 0.49
354 0.49
355 0.48
356 0.52
357 0.54
358 0.5
359 0.42
360 0.35
361 0.32
362 0.28
363 0.24
364 0.22
365 0.21
366 0.24
367 0.25
368 0.29
369 0.26
370 0.27
371 0.27
372 0.25
373 0.25
374 0.25
375 0.25
376 0.23
377 0.28
378 0.34
379 0.39
380 0.46
381 0.56
382 0.62
383 0.65
384 0.71
385 0.69
386 0.62
387 0.63
388 0.62
389 0.61
390 0.61
391 0.67
392 0.68
393 0.72
394 0.8