Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QDB4

Protein Details
Accession E3QDB4    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-60QNLRGLRAKLHAKKRHNEKIQMRKQIKHydrophilic
129-149ISTGKKTHKKSWKRMITKPTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-60RKLHGRRLDHEERARKKEAREGHKASKDAQNLRGLRAKLHAKKRHNEKIQMRKQIK
134-141KTHKKSWK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MERWRKLHGRRLDHEERARKKEAREGHKASKDAQNLRGLRAKLHAKKRHNEKIQMRKQIKAHEERNIKTNNEKEPSEPMPAYLLDRSNPNNAKAISSQIKNKRAEKAARFAVPLPKVKGISEEEMFKVISTGKKTHKKSWKRMITKPTFVGPNFTRRDPKHERFIRPMGLRYKHAHVTHPELGVTVKLPIIGVKKNPQNPLYTNLGVLTKGTIIEVNVSELGLTTTTGKVVWGRYCQITNNPENDGCVNGVLLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.8
3 0.79
4 0.76
5 0.77
6 0.72
7 0.67
8 0.66
9 0.66
10 0.64
11 0.65
12 0.67
13 0.69
14 0.71
15 0.7
16 0.66
17 0.64
18 0.63
19 0.59
20 0.56
21 0.54
22 0.49
23 0.52
24 0.54
25 0.46
26 0.4
27 0.42
28 0.46
29 0.46
30 0.56
31 0.61
32 0.62
33 0.72
34 0.8
35 0.84
36 0.82
37 0.84
38 0.83
39 0.85
40 0.86
41 0.87
42 0.79
43 0.75
44 0.71
45 0.69
46 0.67
47 0.65
48 0.61
49 0.6
50 0.64
51 0.6
52 0.63
53 0.58
54 0.52
55 0.5
56 0.5
57 0.48
58 0.45
59 0.44
60 0.39
61 0.4
62 0.41
63 0.39
64 0.33
65 0.26
66 0.23
67 0.23
68 0.23
69 0.19
70 0.17
71 0.13
72 0.16
73 0.18
74 0.24
75 0.26
76 0.25
77 0.28
78 0.27
79 0.28
80 0.25
81 0.29
82 0.26
83 0.27
84 0.34
85 0.38
86 0.45
87 0.48
88 0.51
89 0.51
90 0.52
91 0.57
92 0.53
93 0.52
94 0.49
95 0.45
96 0.43
97 0.39
98 0.39
99 0.35
100 0.35
101 0.3
102 0.28
103 0.27
104 0.26
105 0.27
106 0.23
107 0.22
108 0.19
109 0.18
110 0.16
111 0.17
112 0.16
113 0.13
114 0.11
115 0.09
116 0.11
117 0.12
118 0.16
119 0.24
120 0.33
121 0.37
122 0.46
123 0.55
124 0.62
125 0.7
126 0.76
127 0.78
128 0.77
129 0.8
130 0.82
131 0.79
132 0.74
133 0.65
134 0.58
135 0.52
136 0.44
137 0.43
138 0.34
139 0.36
140 0.34
141 0.35
142 0.39
143 0.36
144 0.45
145 0.48
146 0.52
147 0.54
148 0.59
149 0.62
150 0.61
151 0.65
152 0.63
153 0.56
154 0.57
155 0.55
156 0.5
157 0.49
158 0.45
159 0.45
160 0.45
161 0.43
162 0.42
163 0.38
164 0.42
165 0.42
166 0.39
167 0.34
168 0.27
169 0.26
170 0.22
171 0.18
172 0.11
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.12
178 0.15
179 0.19
180 0.26
181 0.33
182 0.39
183 0.45
184 0.45
185 0.46
186 0.46
187 0.47
188 0.46
189 0.39
190 0.33
191 0.29
192 0.27
193 0.22
194 0.2
195 0.16
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.11
217 0.16
218 0.2
219 0.23
220 0.26
221 0.31
222 0.33
223 0.36
224 0.41
225 0.44
226 0.46
227 0.45
228 0.46
229 0.42
230 0.42
231 0.4
232 0.33
233 0.26
234 0.2