Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3Q335

Protein Details
Accession E3Q335    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-58NKTSNKLKRKELYVLQKKEKDKTQREMRFRRKKEEDKDPELRABasic
135-160AAEAKKAEREKRREEKRRARRDSSAABasic
404-423DSQPWEWKAKMEKDRKRFNLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-25RK
30-67LQKKEKDKTQREMRFRRKKEEDKDPELRAARITKNKPK
139-155KKAEREKRREEKRRARR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MGFSKPGKSMGASLTNKTSNKLKRKELYVLQKKEKDKTQREMRFRRKKEEDKDPELRAARITKNKPKTLDSKRVWDDVDDDSLGNVVDVEKLKRRRIEEEENAALEKELDDEDNSEDGDESDNDSMLASDDDEEAAEAKKAEREKRREEKRRARRDSSAAPSTTSTNLDLTPSSLALKFPSLFTEDAPPPPKILITTSLNSTLHYEANVFRTIFPNSTYVPRSAHRYGHKYSLREISKFASNRDYTAVVLLKEDQKKLTGMSIVHLPAGPTFTFSITNFMEGKKLPGHGNPTNHYPELLLNNFKTPLGLLTAALFQRLFPPQPELEGRQVLTVHNQRDYLFFRRHRYVFREKRETEKNITTADGAEMKGVEGIRVGLQEVGPRFTAKLRRVDKGIGRAGSEGEDSQPWEWKAKMEKDRKRFNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.46
4 0.46
5 0.49
6 0.49
7 0.56
8 0.61
9 0.65
10 0.66
11 0.72
12 0.77
13 0.78
14 0.79
15 0.79
16 0.81
17 0.81
18 0.81
19 0.8
20 0.78
21 0.78
22 0.77
23 0.75
24 0.76
25 0.77
26 0.79
27 0.84
28 0.88
29 0.9
30 0.9
31 0.88
32 0.88
33 0.88
34 0.88
35 0.87
36 0.87
37 0.85
38 0.83
39 0.85
40 0.77
41 0.74
42 0.67
43 0.58
44 0.52
45 0.48
46 0.47
47 0.49
48 0.55
49 0.57
50 0.64
51 0.7
52 0.69
53 0.7
54 0.72
55 0.72
56 0.74
57 0.68
58 0.69
59 0.67
60 0.67
61 0.61
62 0.51
63 0.44
64 0.36
65 0.34
66 0.25
67 0.2
68 0.16
69 0.16
70 0.14
71 0.11
72 0.08
73 0.05
74 0.07
75 0.09
76 0.13
77 0.2
78 0.27
79 0.33
80 0.38
81 0.42
82 0.46
83 0.53
84 0.59
85 0.6
86 0.62
87 0.59
88 0.55
89 0.51
90 0.44
91 0.36
92 0.26
93 0.17
94 0.1
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.1
127 0.15
128 0.24
129 0.32
130 0.4
131 0.49
132 0.6
133 0.7
134 0.77
135 0.83
136 0.86
137 0.88
138 0.92
139 0.9
140 0.86
141 0.81
142 0.77
143 0.75
144 0.71
145 0.66
146 0.55
147 0.48
148 0.43
149 0.38
150 0.32
151 0.25
152 0.18
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.16
172 0.16
173 0.2
174 0.22
175 0.21
176 0.19
177 0.19
178 0.18
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.2
186 0.2
187 0.19
188 0.2
189 0.16
190 0.13
191 0.12
192 0.12
193 0.1
194 0.12
195 0.14
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.13
203 0.12
204 0.16
205 0.17
206 0.16
207 0.17
208 0.18
209 0.24
210 0.25
211 0.29
212 0.32
213 0.36
214 0.37
215 0.44
216 0.47
217 0.41
218 0.42
219 0.45
220 0.42
221 0.37
222 0.36
223 0.3
224 0.32
225 0.32
226 0.3
227 0.29
228 0.26
229 0.26
230 0.27
231 0.25
232 0.18
233 0.2
234 0.2
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.18
239 0.2
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.19
244 0.19
245 0.18
246 0.15
247 0.12
248 0.13
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.1
255 0.12
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.15
263 0.14
264 0.16
265 0.16
266 0.15
267 0.17
268 0.15
269 0.18
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.19
274 0.27
275 0.3
276 0.35
277 0.35
278 0.38
279 0.4
280 0.39
281 0.36
282 0.29
283 0.26
284 0.27
285 0.27
286 0.25
287 0.21
288 0.23
289 0.24
290 0.23
291 0.2
292 0.14
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.09
297 0.09
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.1
303 0.13
304 0.16
305 0.16
306 0.14
307 0.19
308 0.19
309 0.23
310 0.27
311 0.28
312 0.29
313 0.31
314 0.3
315 0.26
316 0.27
317 0.23
318 0.28
319 0.3
320 0.28
321 0.28
322 0.29
323 0.28
324 0.32
325 0.36
326 0.34
327 0.37
328 0.4
329 0.44
330 0.51
331 0.55
332 0.57
333 0.6
334 0.65
335 0.66
336 0.7
337 0.74
338 0.68
339 0.74
340 0.76
341 0.74
342 0.71
343 0.68
344 0.61
345 0.52
346 0.5
347 0.42
348 0.34
349 0.3
350 0.24
351 0.17
352 0.15
353 0.13
354 0.12
355 0.14
356 0.13
357 0.1
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.1
365 0.15
366 0.16
367 0.17
368 0.17
369 0.18
370 0.18
371 0.23
372 0.32
373 0.33
374 0.41
375 0.44
376 0.49
377 0.52
378 0.59
379 0.6
380 0.6
381 0.62
382 0.54
383 0.5
384 0.46
385 0.42
386 0.36
387 0.31
388 0.22
389 0.17
390 0.17
391 0.18
392 0.18
393 0.23
394 0.23
395 0.25
396 0.25
397 0.29
398 0.37
399 0.44
400 0.54
401 0.58
402 0.67
403 0.73