Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QVT2

Protein Details
Accession E3QVT2    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-38ENDTAEPAPKRNKQPNPKTRDHQNAHIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, cyto 7.5, mito 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MSSKRNYAASDENDTAEPAPKRNKQPNPKTRDHQNAHIDPTWGQKYVFSSAAGSTTVPVDPDLDFEDDADAMAYLKSVRTQANGIPHLLVAPKVPIGPQLPKELQNDGHDDMDEGLDVEEDRNIYTTGQGDFRGYYQDGAYTARPAHWDDDPRALRHHDAADDEWKGNEGVYDDEENTADPEAAIHEAYFAAILSRFNTLRRTLHAPPPPGLVAGLPRTHDYHVGAFGPKSGTFAIWSQRLRATDPLPAQVASMDKDGVLRVVRVLLGGKFLRRGCELRERTSRWLWALLARLPERGELNHAEIGWVRDLGRRAVLMMQSLADMAALRDALEGEGMDLGVHDAVDESSDDGDVLREMQVEERDGEEVSGNVAETPSAGSEVLPAAAARPEEPGPIPTEPTEDGEVEEGEIDDDGDDQKSEPMDVSEDGEIDEEPAPAESLEAARARLLAQLDTAAEDAPSEAPSKGQPAAEAEDEEMADQLRARMNMRATLNMILTVAGEFYGQRDLLEFRDPFTGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.31
4 0.28
5 0.28
6 0.36
7 0.42
8 0.51
9 0.61
10 0.7
11 0.74
12 0.83
13 0.87
14 0.87
15 0.88
16 0.86
17 0.86
18 0.87
19 0.81
20 0.8
21 0.8
22 0.76
23 0.73
24 0.68
25 0.59
26 0.5
27 0.52
28 0.45
29 0.36
30 0.31
31 0.27
32 0.28
33 0.3
34 0.3
35 0.22
36 0.21
37 0.2
38 0.21
39 0.19
40 0.16
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.13
50 0.14
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.1
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.06
63 0.08
64 0.11
65 0.13
66 0.14
67 0.17
68 0.21
69 0.29
70 0.31
71 0.3
72 0.27
73 0.26
74 0.25
75 0.23
76 0.2
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.11
82 0.14
83 0.17
84 0.23
85 0.24
86 0.31
87 0.33
88 0.38
89 0.4
90 0.4
91 0.4
92 0.37
93 0.39
94 0.33
95 0.31
96 0.26
97 0.24
98 0.2
99 0.17
100 0.13
101 0.09
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.15
127 0.15
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.15
132 0.16
133 0.17
134 0.19
135 0.23
136 0.23
137 0.33
138 0.34
139 0.34
140 0.35
141 0.35
142 0.32
143 0.3
144 0.3
145 0.21
146 0.21
147 0.22
148 0.23
149 0.23
150 0.22
151 0.19
152 0.18
153 0.16
154 0.14
155 0.12
156 0.08
157 0.07
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.14
186 0.16
187 0.17
188 0.21
189 0.26
190 0.28
191 0.36
192 0.41
193 0.4
194 0.38
195 0.39
196 0.36
197 0.29
198 0.25
199 0.17
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.12
204 0.13
205 0.15
206 0.15
207 0.16
208 0.15
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.1
217 0.11
218 0.1
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.13
223 0.17
224 0.17
225 0.18
226 0.2
227 0.21
228 0.21
229 0.23
230 0.21
231 0.21
232 0.22
233 0.22
234 0.2
235 0.19
236 0.17
237 0.15
238 0.14
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.05
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.14
258 0.14
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.19
263 0.29
264 0.32
265 0.34
266 0.42
267 0.44
268 0.46
269 0.48
270 0.46
271 0.36
272 0.34
273 0.28
274 0.23
275 0.22
276 0.19
277 0.21
278 0.2
279 0.2
280 0.19
281 0.19
282 0.17
283 0.15
284 0.16
285 0.13
286 0.15
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.12
293 0.11
294 0.09
295 0.1
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.13
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.07
375 0.1
376 0.1
377 0.12
378 0.13
379 0.14
380 0.16
381 0.17
382 0.18
383 0.16
384 0.18
385 0.18
386 0.2
387 0.2
388 0.17
389 0.16
390 0.16
391 0.15
392 0.12
393 0.11
394 0.08
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.04
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.11
410 0.11
411 0.13
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.12
416 0.11
417 0.1
418 0.1
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.1
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.12
433 0.14
434 0.15
435 0.12
436 0.11
437 0.12
438 0.12
439 0.13
440 0.13
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.12
451 0.15
452 0.17
453 0.17
454 0.17
455 0.19
456 0.23
457 0.24
458 0.24
459 0.21
460 0.19
461 0.19
462 0.18
463 0.14
464 0.1
465 0.09
466 0.09
467 0.1
468 0.13
469 0.15
470 0.16
471 0.21
472 0.23
473 0.3
474 0.31
475 0.33
476 0.31
477 0.33
478 0.32
479 0.27
480 0.24
481 0.18
482 0.16
483 0.12
484 0.1
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.11
490 0.1
491 0.1
492 0.12
493 0.14
494 0.16
495 0.24
496 0.23
497 0.21