Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3Q7M2

Protein Details
Accession E3Q7M2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-46DDLLFQQRPRKRVKQDTSHLKAHLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
551-582RGVQRGGPQRGGQRGGPRGGSLQQRGRGGAPR
Subcellular Location(s) cyto 9.5cyto_nucl 9.5, nucl 8.5, cysk 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0055087  C:Ski complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030968  P:endoplasmic reticulum unfolded protein response  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
GO:0070481  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MASDLATAIRGLHLTDRPNMNIDDLLFQQRPRKRVKQDTSHLKAHLEDDFLTPSTRFSSAWLNRLQQRWDCPVDYTELFKIPPPQTRTVTRFERHGLEGRVTGYRNVTVPANSATAKNSTSFLRKPASRVDFVRGAAGFFPFAPGGLDGIEATAALEDQVHRTGGGDSAAVPSNKLERIIKLGAESSLLQVAPGLSRGININRKTNEDEARAVEQELYQEPEQSPSTDEADGDAQASGEREAGVDARVEAEAEFEAEEEDGEDIDAILPVEFPALEPHGALAASSARKAGREWAHMVDIDRDITNFRELVPDMARDWPFELDTFQKEAIYHLESGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALASKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQTFEEVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDFERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKQKDIYVISTPKRPIPLEHYLWAGKNIHKIVDSEKKFIEKGWKEANQAIQGRDKTKALEPSNTPRGGGGQRGVQRGGPQRGGQRGGPRGGSLQQRGRGGAPRASHNPGHMGRTGRQGGFTSAAQDKNLWVHLVQFLKKSNLLPSCIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTANEKSAIHMTIEKSIARLKPEDRCLPQIIRLRELLSRGIAVHHGGLLPIVKEIVEILFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGLVIIVPPGGDEAPPVADLQKMILGEPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKAVKLSEADLAKIKRDSCGICDVSMDECHQASEDYKQLTGEVYKSLIGIPIGRKMFSQARLIVYNRDGIRTPGILLSDGASNKGPQGSPTLHVCEIRLMRETRDSTDLLPFIPAFRKHFTPLPQAKKHIRIKTLHVPLSDVECLTRHVTKGIVPEIFQSGEKYLKAKDRLHSICRSWDDLWDEMDLSKIKNLQFQEMMKKRKEAEVTASSSPALSCPQFLKHFAMCHDQWLIKEHISQLQHSLSDQNLQLLPDYEQRIQVLKQLQFIDESARIQLKGKVACEIHSGDELVLTELILDNVLADYEPAEIAALLSAFVFQEKTETQPNLTGNLERGKDTIIAISEKVNEVQTLHQVIQSADDSNDFISRPRFGLMEVVYEWARGMSFKNITDLTDVLEGTIVRTITRLDETCREVKNAARIIGDPELYQKMQTAQEMIKRDITAVASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.28
3 0.32
4 0.33
5 0.36
6 0.36
7 0.33
8 0.3
9 0.28
10 0.25
11 0.23
12 0.28
13 0.26
14 0.28
15 0.35
16 0.38
17 0.44
18 0.5
19 0.58
20 0.61
21 0.71
22 0.79
23 0.81
24 0.86
25 0.9
26 0.88
27 0.85
28 0.76
29 0.67
30 0.59
31 0.51
32 0.43
33 0.34
34 0.28
35 0.24
36 0.25
37 0.24
38 0.23
39 0.2
40 0.19
41 0.19
42 0.19
43 0.16
44 0.16
45 0.26
46 0.3
47 0.36
48 0.41
49 0.45
50 0.5
51 0.56
52 0.6
53 0.55
54 0.56
55 0.57
56 0.56
57 0.51
58 0.47
59 0.43
60 0.43
61 0.38
62 0.36
63 0.31
64 0.28
65 0.27
66 0.27
67 0.34
68 0.33
69 0.4
70 0.42
71 0.46
72 0.5
73 0.58
74 0.6
75 0.59
76 0.64
77 0.58
78 0.58
79 0.55
80 0.55
81 0.5
82 0.53
83 0.48
84 0.42
85 0.41
86 0.38
87 0.38
88 0.34
89 0.32
90 0.27
91 0.26
92 0.24
93 0.23
94 0.23
95 0.2
96 0.21
97 0.21
98 0.22
99 0.2
100 0.21
101 0.21
102 0.21
103 0.22
104 0.2
105 0.2
106 0.21
107 0.27
108 0.28
109 0.32
110 0.38
111 0.39
112 0.41
113 0.5
114 0.52
115 0.51
116 0.51
117 0.52
118 0.48
119 0.46
120 0.47
121 0.37
122 0.32
123 0.27
124 0.25
125 0.19
126 0.14
127 0.15
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.1
154 0.09
155 0.12
156 0.16
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.18
161 0.19
162 0.22
163 0.21
164 0.19
165 0.26
166 0.27
167 0.27
168 0.24
169 0.25
170 0.22
171 0.21
172 0.2
173 0.15
174 0.15
175 0.13
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.1
181 0.09
182 0.07
183 0.08
184 0.12
185 0.19
186 0.27
187 0.3
188 0.37
189 0.39
190 0.43
191 0.47
192 0.51
193 0.49
194 0.45
195 0.44
196 0.4
197 0.41
198 0.38
199 0.34
200 0.28
201 0.22
202 0.21
203 0.19
204 0.2
205 0.17
206 0.19
207 0.18
208 0.21
209 0.22
210 0.2
211 0.21
212 0.18
213 0.21
214 0.18
215 0.18
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.13
220 0.11
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.07
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.13
273 0.12
274 0.13
275 0.14
276 0.22
277 0.23
278 0.27
279 0.3
280 0.31
281 0.33
282 0.33
283 0.34
284 0.28
285 0.24
286 0.21
287 0.17
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.12
293 0.11
294 0.13
295 0.13
296 0.16
297 0.17
298 0.17
299 0.16
300 0.22
301 0.22
302 0.2
303 0.21
304 0.19
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.15
309 0.17
310 0.19
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.17
315 0.19
316 0.18
317 0.15
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.13
322 0.11
323 0.08
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.09
352 0.12
353 0.14
354 0.21
355 0.22
356 0.24
357 0.25
358 0.28
359 0.28
360 0.31
361 0.37
362 0.38
363 0.46
364 0.47
365 0.52
366 0.53
367 0.54
368 0.61
369 0.52
370 0.46
371 0.43
372 0.43
373 0.37
374 0.33
375 0.32
376 0.2
377 0.19
378 0.17
379 0.1
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.11
404 0.1
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.09
418 0.07
419 0.06
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.1
427 0.1
428 0.07
429 0.08
430 0.09
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.07
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.04
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.13
464 0.17
465 0.21
466 0.23
467 0.26
468 0.3
469 0.31
470 0.35
471 0.33
472 0.33
473 0.36
474 0.4
475 0.38
476 0.38
477 0.37
478 0.35
479 0.36
480 0.33
481 0.28
482 0.29
483 0.35
484 0.32
485 0.33
486 0.33
487 0.31
488 0.31
489 0.31
490 0.26
491 0.21
492 0.22
493 0.22
494 0.2
495 0.19
496 0.2
497 0.23
498 0.31
499 0.31
500 0.29
501 0.29
502 0.3
503 0.29
504 0.3
505 0.34
506 0.27
507 0.3
508 0.35
509 0.38
510 0.38
511 0.41
512 0.42
513 0.39
514 0.39
515 0.35
516 0.33
517 0.31
518 0.31
519 0.3
520 0.27
521 0.23
522 0.24
523 0.3
524 0.27
525 0.29
526 0.32
527 0.38
528 0.44
529 0.42
530 0.38
531 0.3
532 0.31
533 0.27
534 0.25
535 0.19
536 0.17
537 0.22
538 0.23
539 0.24
540 0.21
541 0.25
542 0.3
543 0.32
544 0.29
545 0.27
546 0.3
547 0.33
548 0.34
549 0.32
550 0.3
551 0.31
552 0.3
553 0.28
554 0.24
555 0.22
556 0.25
557 0.27
558 0.25
559 0.26
560 0.28
561 0.29
562 0.29
563 0.29
564 0.29
565 0.27
566 0.26
567 0.24
568 0.24
569 0.27
570 0.3
571 0.29
572 0.25
573 0.29
574 0.26
575 0.27
576 0.25
577 0.24
578 0.22
579 0.28
580 0.3
581 0.24
582 0.24
583 0.22
584 0.2
585 0.2
586 0.18
587 0.15
588 0.15
589 0.16
590 0.15
591 0.14
592 0.13
593 0.13
594 0.13
595 0.1
596 0.07
597 0.08
598 0.11
599 0.14
600 0.15
601 0.16
602 0.17
603 0.18
604 0.19
605 0.19
606 0.21
607 0.2
608 0.22
609 0.2
610 0.2
611 0.21
612 0.2
613 0.2
614 0.16
615 0.21
616 0.21
617 0.29
618 0.3
619 0.31
620 0.31
621 0.36
622 0.38
623 0.38
624 0.4
625 0.32
626 0.3
627 0.28
628 0.28
629 0.23
630 0.19
631 0.14
632 0.09
633 0.08
634 0.13
635 0.13
636 0.13
637 0.15
638 0.15
639 0.14
640 0.16
641 0.16
642 0.11
643 0.13
644 0.13
645 0.14
646 0.15
647 0.14
648 0.13
649 0.16
650 0.17
651 0.16
652 0.18
653 0.18
654 0.23
655 0.28
656 0.33
657 0.32
658 0.34
659 0.36
660 0.34
661 0.38
662 0.39
663 0.35
664 0.31
665 0.3
666 0.27
667 0.26
668 0.26
669 0.2
670 0.14
671 0.13
672 0.11
673 0.1
674 0.09
675 0.08
676 0.07
677 0.06
678 0.06
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.04
698 0.05
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.06
704 0.05
705 0.06
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.06
710 0.07
711 0.07
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.07
716 0.07
717 0.07
718 0.08
719 0.1
720 0.13
721 0.19
722 0.23
723 0.28
724 0.28
725 0.29
726 0.34
727 0.36
728 0.38
729 0.41
730 0.41
731 0.36
732 0.41
733 0.4
734 0.34
735 0.29
736 0.25
737 0.19
738 0.15
739 0.15
740 0.09
741 0.1
742 0.1
743 0.1
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.12
748 0.12
749 0.12
750 0.12
751 0.12
752 0.11
753 0.09
754 0.08
755 0.07
756 0.06
757 0.05
758 0.05
759 0.03
760 0.03
761 0.03
762 0.03
763 0.03
764 0.03
765 0.03
766 0.04
767 0.05
768 0.05
769 0.05
770 0.05
771 0.06
772 0.06
773 0.06
774 0.07
775 0.07
776 0.07
777 0.09
778 0.09
779 0.11
780 0.13
781 0.15
782 0.16
783 0.19
784 0.2
785 0.21
786 0.26
787 0.31
788 0.32
789 0.37
790 0.36
791 0.38
792 0.38
793 0.36
794 0.32
795 0.25
796 0.22
797 0.15
798 0.13
799 0.09
800 0.07
801 0.06
802 0.05
803 0.06
804 0.06
805 0.07
806 0.09
807 0.11
808 0.13
809 0.14
810 0.14
811 0.14
812 0.15
813 0.17
814 0.17
815 0.19
816 0.19
817 0.23
818 0.25
819 0.25
820 0.25
821 0.26
822 0.26
823 0.24
824 0.22
825 0.19
826 0.17
827 0.18
828 0.17
829 0.16
830 0.15
831 0.13
832 0.13
833 0.16
834 0.15
835 0.15
836 0.2
837 0.18
838 0.19
839 0.22
840 0.21
841 0.18
842 0.21
843 0.2
844 0.19
845 0.25
846 0.24
847 0.22
848 0.22
849 0.21
850 0.2
851 0.2
852 0.18
853 0.11
854 0.1
855 0.1
856 0.1
857 0.1
858 0.09
859 0.11
860 0.14
861 0.14
862 0.14
863 0.14
864 0.14
865 0.14
866 0.15
867 0.13
868 0.1
869 0.1
870 0.1
871 0.1
872 0.1
873 0.1
874 0.08
875 0.11
876 0.11
877 0.17
878 0.17
879 0.17
880 0.17
881 0.21
882 0.26
883 0.26
884 0.29
885 0.26
886 0.28
887 0.32
888 0.33
889 0.31
890 0.27
891 0.3
892 0.26
893 0.25
894 0.22
895 0.2
896 0.21
897 0.18
898 0.18
899 0.14
900 0.14
901 0.12
902 0.12
903 0.11
904 0.12
905 0.12
906 0.12
907 0.11
908 0.11
909 0.12
910 0.13
911 0.12
912 0.1
913 0.15
914 0.15
915 0.18
916 0.21
917 0.24
918 0.24
919 0.24
920 0.24
921 0.25
922 0.25
923 0.24
924 0.25
925 0.22
926 0.23
927 0.29
928 0.3
929 0.28
930 0.29
931 0.28
932 0.25
933 0.28
934 0.26
935 0.19
936 0.19
937 0.16
938 0.15
939 0.19
940 0.21
941 0.21
942 0.24
943 0.26
944 0.28
945 0.34
946 0.37
947 0.42
948 0.49
949 0.55
950 0.57
951 0.62
952 0.66
953 0.71
954 0.75
955 0.71
956 0.68
957 0.62
958 0.64
959 0.67
960 0.68
961 0.62
962 0.53
963 0.48
964 0.42
965 0.43
966 0.35
967 0.25
968 0.17
969 0.14
970 0.16
971 0.18
972 0.18
973 0.15
974 0.15
975 0.15
976 0.17
977 0.22
978 0.24
979 0.22
980 0.2
981 0.21
982 0.22
983 0.23
984 0.21
985 0.17
986 0.15
987 0.16
988 0.17
989 0.17
990 0.19
991 0.25
992 0.32
993 0.36
994 0.38
995 0.46
996 0.52
997 0.56
998 0.59
999 0.54
1000 0.55
1001 0.53
1002 0.53
1003 0.44
1004 0.42
1005 0.39
1006 0.34
1007 0.32
1008 0.25
1009 0.22
1010 0.17
1011 0.2
1012 0.16
1013 0.13
1014 0.14
1015 0.16
1016 0.16
1017 0.21
1018 0.23
1019 0.24
1020 0.28
1021 0.31
1022 0.4
1023 0.45
1024 0.51
1025 0.49
1026 0.52
1027 0.5
1028 0.51
1029 0.51
1030 0.44
1031 0.43
1032 0.43
1033 0.45
1034 0.42
1035 0.41
1036 0.34
1037 0.31
1038 0.27
1039 0.2
1040 0.16
1041 0.12
1042 0.12
1043 0.14
1044 0.19
1045 0.22
1046 0.25
1047 0.29
1048 0.29
1049 0.32
1050 0.32
1051 0.38
1052 0.33
1053 0.33
1054 0.34
1055 0.3
1056 0.28
1057 0.3
1058 0.3
1059 0.24
1060 0.26
1061 0.24
1062 0.27
1063 0.27
1064 0.27
1065 0.26
1066 0.26
1067 0.25
1068 0.23
1069 0.23
1070 0.18
1071 0.21
1072 0.2
1073 0.19
1074 0.18
1075 0.18
1076 0.18
1077 0.17
1078 0.19
1079 0.21
1080 0.24
1081 0.22
1082 0.23
1083 0.24
1084 0.26
1085 0.25
1086 0.28
1087 0.3
1088 0.28
1089 0.32
1090 0.32
1091 0.31
1092 0.3
1093 0.3
1094 0.29
1095 0.23
1096 0.22
1097 0.2
1098 0.2
1099 0.2
1100 0.21
1101 0.24
1102 0.26
1103 0.28
1104 0.28
1105 0.31
1106 0.3
1107 0.31
1108 0.33
1109 0.31
1110 0.27
1111 0.24
1112 0.24
1113 0.17
1114 0.17
1115 0.16
1116 0.13
1117 0.11
1118 0.09
1119 0.07
1120 0.07
1121 0.07
1122 0.06
1123 0.05
1124 0.04
1125 0.04
1126 0.05
1127 0.04
1128 0.04
1129 0.04
1130 0.05
1131 0.05
1132 0.05
1133 0.05
1134 0.05
1135 0.05
1136 0.05
1137 0.05
1138 0.04
1139 0.04
1140 0.05
1141 0.05
1142 0.05
1143 0.06
1144 0.05
1145 0.09
1146 0.1
1147 0.14
1148 0.21
1149 0.23
1150 0.24
1151 0.29
1152 0.3
1153 0.3
1154 0.31
1155 0.29
1156 0.26
1157 0.31
1158 0.3
1159 0.26
1160 0.26
1161 0.24
1162 0.23
1163 0.22
1164 0.21
1165 0.17
1166 0.18
1167 0.17
1168 0.19
1169 0.19
1170 0.19
1171 0.2
1172 0.18
1173 0.16
1174 0.16
1175 0.18
1176 0.21
1177 0.23
1178 0.22
1179 0.22
1180 0.22
1181 0.21
1182 0.23
1183 0.22
1184 0.18
1185 0.15
1186 0.15
1187 0.15
1188 0.15
1189 0.16
1190 0.13
1191 0.14
1192 0.16
1193 0.18
1194 0.18
1195 0.19
1196 0.18
1197 0.17
1198 0.23
1199 0.22
1200 0.23
1201 0.21
1202 0.23
1203 0.21
1204 0.21
1205 0.2
1206 0.14
1207 0.13
1208 0.1
1209 0.12
1210 0.16
1211 0.2
1212 0.2
1213 0.25
1214 0.26
1215 0.27
1216 0.29
1217 0.27
1218 0.22
1219 0.21
1220 0.19
1221 0.15
1222 0.15
1223 0.14
1224 0.12
1225 0.15
1226 0.12
1227 0.1
1228 0.11
1229 0.11
1230 0.13
1231 0.19
1232 0.2
1233 0.22
1234 0.28
1235 0.34
1236 0.4
1237 0.42
1238 0.42
1239 0.39
1240 0.41
1241 0.45
1242 0.45
1243 0.42
1244 0.37
1245 0.36
1246 0.38
1247 0.4
1248 0.36
1249 0.27
1250 0.26
1251 0.28
1252 0.27
1253 0.26
1254 0.23
1255 0.23
1256 0.25
1257 0.26
1258 0.26
1259 0.26
1260 0.32
1261 0.37
1262 0.38
1263 0.38
1264 0.36
1265 0.35
1266 0.33
1267 0.3
1268 0.25