Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2H8R6

Protein Details
Accession Q2H8R6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-243PASGGKTKRERERKTKQFVELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-107APRGGRRGGFRGGRGGRREEG
229-236TKRERERK
252-310RTRGGRGGRGGERGDRGTRGDRGEFRGGRGRGDGARGRGRGAPRGESRGEFRGGRGGAR
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 11, nucl 7, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVATKNLYDLLGNDIEGDEPPAPPLRPVEKTSTHTVKRNTDGLAPSKGPVTTGNRRGGANVGGNEAAFRDRGAGRDSNRVKSTDEAPRGGRRGGFRGGRGGRREEGDRHPFRGALHSNSEKQAAQSWGANEGEAELKDEQAAAEIAQSEQKAEGEAAAEGEVKEEEPEEKHITYDEYLVQQAEKKAALEAELNVRQPNEGVKDDKWKDFAPLAKDDEEELFPASGGKTKRERERKTKQFVELENRYIEPERTRGGRGGRGGERGDRGTRGDRGEFRGGRGRGDGARGRGRGAPRGESRGEFRGGRGGARGQENKPINTNDEDAFPSLGGSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.14
4 0.13
5 0.15
6 0.1
7 0.09
8 0.12
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.22
13 0.26
14 0.31
15 0.34
16 0.4
17 0.43
18 0.47
19 0.55
20 0.58
21 0.57
22 0.6
23 0.63
24 0.63
25 0.62
26 0.61
27 0.53
28 0.49
29 0.49
30 0.46
31 0.45
32 0.38
33 0.34
34 0.32
35 0.3
36 0.25
37 0.25
38 0.29
39 0.33
40 0.39
41 0.45
42 0.45
43 0.45
44 0.45
45 0.42
46 0.38
47 0.34
48 0.27
49 0.23
50 0.21
51 0.2
52 0.19
53 0.17
54 0.14
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.12
60 0.16
61 0.21
62 0.23
63 0.33
64 0.37
65 0.4
66 0.42
67 0.42
68 0.39
69 0.37
70 0.41
71 0.4
72 0.4
73 0.36
74 0.38
75 0.42
76 0.43
77 0.41
78 0.39
79 0.32
80 0.32
81 0.36
82 0.35
83 0.31
84 0.38
85 0.41
86 0.44
87 0.44
88 0.44
89 0.39
90 0.39
91 0.41
92 0.37
93 0.4
94 0.44
95 0.44
96 0.43
97 0.42
98 0.4
99 0.37
100 0.39
101 0.34
102 0.27
103 0.31
104 0.32
105 0.33
106 0.34
107 0.35
108 0.27
109 0.25
110 0.25
111 0.2
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.18
116 0.17
117 0.16
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.09
122 0.11
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.09
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.13
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.15
186 0.13
187 0.14
188 0.16
189 0.17
190 0.27
191 0.3
192 0.31
193 0.32
194 0.28
195 0.28
196 0.29
197 0.31
198 0.26
199 0.27
200 0.28
201 0.26
202 0.26
203 0.25
204 0.23
205 0.19
206 0.16
207 0.13
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.11
213 0.12
214 0.17
215 0.23
216 0.3
217 0.4
218 0.5
219 0.59
220 0.65
221 0.75
222 0.8
223 0.82
224 0.82
225 0.79
226 0.76
227 0.74
228 0.73
229 0.67
230 0.6
231 0.52
232 0.46
233 0.41
234 0.35
235 0.31
236 0.24
237 0.22
238 0.22
239 0.23
240 0.24
241 0.26
242 0.29
243 0.32
244 0.33
245 0.36
246 0.36
247 0.38
248 0.38
249 0.37
250 0.37
251 0.35
252 0.34
253 0.29
254 0.29
255 0.3
256 0.32
257 0.32
258 0.35
259 0.35
260 0.39
261 0.46
262 0.44
263 0.43
264 0.48
265 0.45
266 0.41
267 0.39
268 0.36
269 0.28
270 0.34
271 0.35
272 0.32
273 0.39
274 0.38
275 0.38
276 0.4
277 0.41
278 0.42
279 0.42
280 0.43
281 0.41
282 0.46
283 0.47
284 0.45
285 0.47
286 0.44
287 0.44
288 0.37
289 0.33
290 0.35
291 0.32
292 0.31
293 0.29
294 0.28
295 0.29
296 0.37
297 0.42
298 0.36
299 0.45
300 0.49
301 0.48
302 0.5
303 0.48
304 0.44
305 0.42
306 0.43
307 0.35
308 0.33
309 0.32
310 0.28
311 0.26
312 0.21