Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QWM1

Protein Details
Accession E3QWM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-34VSGEGLKRKRVSPKEKSKKRSKSESESEAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-26LKRKRVSPKEKSKKRSK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 4.5, cyto_mito 4, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030692  C:Noc4p-Nop14p complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPARVSGEGLKRKRVSPKEKSKKRSKSESESEAESNESNDPQAEILLLENDIFESKKHYNNISKLIKTTNTHEDEPEVATLACVALCRVFVRLLSAGALVPRKGLPEKEAIVTHWLKERYFEYKDVLISLLSKEDLASTALTLAMRCLKVEAQHLYEKEDYIFPHNFLEQIIAGLLQSDSDDTRVEFVEKYLTQYDDIRFSTLKAIKSLAETPGSLPEDELFDDAFELLTNIGDVPTELGNFFAEKPKKKSHNINSLHQHKKQGQDAWLAVLKLAATREQRKKVLDVMSNEIAPWFIRPELLADFLTDSYDAGGSISLLALSGVFYLIKERNLDYPSFYTKLYSLLDSEILHSKHRSRFFRLMDTFLSSTHLPAVLVASFIKRLARLSLNAPPSAIVFVVPWMYNILKRHPLCTFMIHRETRGPEAKMLMEKQGLDDPFVADEADPMETHAIDSCLWEIVQLQSHYHPNVATIAKIMSEQFTKQSYNIEDFLDHSYGSLLEAEMSKQVKKQPVIEFQIPKRVFLPNEPDSGFQDNLVTKLWSFQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.71
3 0.72
4 0.79
5 0.81
6 0.88
7 0.93
8 0.93
9 0.93
10 0.93
11 0.93
12 0.91
13 0.9
14 0.89
15 0.87
16 0.8
17 0.74
18 0.66
19 0.56
20 0.48
21 0.38
22 0.3
23 0.24
24 0.2
25 0.16
26 0.15
27 0.14
28 0.12
29 0.12
30 0.1
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.14
42 0.18
43 0.24
44 0.28
45 0.36
46 0.44
47 0.5
48 0.6
49 0.61
50 0.6
51 0.57
52 0.58
53 0.56
54 0.5
55 0.5
56 0.49
57 0.46
58 0.45
59 0.43
60 0.4
61 0.36
62 0.34
63 0.29
64 0.2
65 0.15
66 0.13
67 0.12
68 0.09
69 0.08
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.07
74 0.07
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.15
85 0.17
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.16
90 0.19
91 0.2
92 0.2
93 0.23
94 0.26
95 0.28
96 0.28
97 0.26
98 0.3
99 0.3
100 0.29
101 0.29
102 0.29
103 0.26
104 0.28
105 0.3
106 0.29
107 0.32
108 0.32
109 0.29
110 0.3
111 0.3
112 0.28
113 0.25
114 0.19
115 0.16
116 0.15
117 0.12
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.21
138 0.23
139 0.23
140 0.27
141 0.28
142 0.31
143 0.3
144 0.28
145 0.24
146 0.23
147 0.2
148 0.2
149 0.21
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.17
154 0.15
155 0.15
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.13
176 0.13
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.2
182 0.21
183 0.2
184 0.2
185 0.19
186 0.17
187 0.17
188 0.24
189 0.24
190 0.24
191 0.21
192 0.22
193 0.21
194 0.23
195 0.24
196 0.19
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.19
201 0.19
202 0.16
203 0.14
204 0.13
205 0.12
206 0.13
207 0.12
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.13
231 0.18
232 0.22
233 0.28
234 0.36
235 0.42
236 0.47
237 0.57
238 0.59
239 0.65
240 0.66
241 0.68
242 0.69
243 0.73
244 0.74
245 0.66
246 0.62
247 0.55
248 0.55
249 0.52
250 0.46
251 0.39
252 0.36
253 0.33
254 0.3
255 0.28
256 0.23
257 0.18
258 0.14
259 0.11
260 0.08
261 0.08
262 0.1
263 0.12
264 0.2
265 0.27
266 0.32
267 0.35
268 0.35
269 0.37
270 0.38
271 0.41
272 0.37
273 0.33
274 0.34
275 0.32
276 0.3
277 0.28
278 0.23
279 0.17
280 0.12
281 0.1
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.07
287 0.08
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.02
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.06
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.16
319 0.18
320 0.18
321 0.18
322 0.2
323 0.23
324 0.23
325 0.22
326 0.19
327 0.17
328 0.2
329 0.18
330 0.15
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.12
335 0.14
336 0.16
337 0.16
338 0.17
339 0.18
340 0.23
341 0.28
342 0.36
343 0.39
344 0.42
345 0.49
346 0.51
347 0.58
348 0.55
349 0.52
350 0.45
351 0.45
352 0.38
353 0.29
354 0.29
355 0.19
356 0.17
357 0.14
358 0.13
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.08
370 0.09
371 0.13
372 0.15
373 0.16
374 0.2
375 0.26
376 0.28
377 0.28
378 0.27
379 0.23
380 0.21
381 0.2
382 0.16
383 0.09
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.13
392 0.16
393 0.2
394 0.27
395 0.28
396 0.31
397 0.3
398 0.33
399 0.32
400 0.37
401 0.38
402 0.36
403 0.43
404 0.41
405 0.41
406 0.43
407 0.44
408 0.44
409 0.44
410 0.38
411 0.32
412 0.33
413 0.34
414 0.33
415 0.32
416 0.29
417 0.25
418 0.23
419 0.24
420 0.27
421 0.24
422 0.21
423 0.2
424 0.17
425 0.16
426 0.16
427 0.14
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.16
448 0.16
449 0.17
450 0.2
451 0.25
452 0.26
453 0.26
454 0.23
455 0.19
456 0.24
457 0.22
458 0.19
459 0.16
460 0.15
461 0.14
462 0.15
463 0.15
464 0.12
465 0.14
466 0.15
467 0.18
468 0.2
469 0.22
470 0.22
471 0.27
472 0.28
473 0.3
474 0.3
475 0.28
476 0.25
477 0.25
478 0.29
479 0.24
480 0.19
481 0.15
482 0.14
483 0.13
484 0.13
485 0.11
486 0.07
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.14
491 0.16
492 0.17
493 0.2
494 0.27
495 0.34
496 0.38
497 0.45
498 0.48
499 0.56
500 0.63
501 0.67
502 0.69
503 0.65
504 0.72
505 0.64
506 0.57
507 0.5
508 0.48
509 0.42
510 0.4
511 0.45
512 0.39
513 0.45
514 0.44
515 0.44
516 0.42
517 0.45
518 0.38
519 0.29
520 0.3
521 0.25
522 0.25
523 0.24
524 0.21