Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QDE3

Protein Details
Accession E3QDE3    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-132EASVLAPKTKKERKRKREEDDIEGKYBasic
522-546SAKDGRPKDLKFNKRSKPKGVSGGGBasic
551-570KPTGRGAKRASEWKKKQGGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-124KTKKERKRKRE
143-152EKPAEKRTKK
435-495RSNKARAAQPGGPGAPGNTKYRAKITPEQQSKAGRAARLLGRSGANRERLGNRGDREKPRI
519-570RRASAKDGRPKDLKFNKRSKPKGVSGGGVKKSKPTGRGAKRASEWKKKQGGS
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12394  RRM1_RBM34  
Amino Acid Sequences MAKSAKLAASGKAIDPTLDALFASSAGPVKAPEKTRYAELSAPKAKADPETADSDENLPDADEEDDEELSELGSEDGVDLDNIAEDETSSEADEDAKDVSDADEEDEASVLAPKTKKERKRKREEDDIEGKYLSKLAEAEEKEKPAEKRTKKETKPDEDGQEATSETSSEGEDSDEETPLVHESLAADAKAKAKDSEIKKANRTVFLSNVAADAIDNKSAKRTLEAHLSSVLDKDATPPQKIESIRFRSVAFSGGGLPKRAAYITKSLMKETTKSANAYVVFSTPAAARKVCAELNGTVVLDRHLRVDSVAHPAPTDHRRCVFVGNLGFIDDETIVSTNDEGETVQKKRTKVPADIEEGLWRTFGKHAGKVENVRVVRDPKTRVGKGFAYVQFYDGIHVEAALLLDGKKFPPMLPRILRVTRAKAPHKTALAMERSNKARAAQPGGPGAPGNTKYRAKITPEQQSKAGRAARLLGRSGANRERLGNRGDREKPRIPGNGSGVVPKDQMKAPEDFVFEGRRASAKDGRPKDLKFNKRSKPKGVSGGGVKKSKPTGRGAKRASEWKKKQGGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.22
4 0.17
5 0.15
6 0.13
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.13
17 0.19
18 0.24
19 0.28
20 0.32
21 0.35
22 0.39
23 0.42
24 0.43
25 0.43
26 0.44
27 0.49
28 0.5
29 0.48
30 0.44
31 0.42
32 0.39
33 0.36
34 0.35
35 0.29
36 0.27
37 0.31
38 0.32
39 0.32
40 0.31
41 0.3
42 0.26
43 0.21
44 0.17
45 0.12
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.08
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.04
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.1
97 0.08
98 0.12
99 0.13
100 0.16
101 0.26
102 0.36
103 0.46
104 0.54
105 0.66
106 0.72
107 0.83
108 0.9
109 0.89
110 0.91
111 0.87
112 0.85
113 0.83
114 0.76
115 0.66
116 0.56
117 0.48
118 0.36
119 0.32
120 0.22
121 0.14
122 0.11
123 0.1
124 0.18
125 0.19
126 0.23
127 0.25
128 0.27
129 0.27
130 0.32
131 0.32
132 0.33
133 0.42
134 0.45
135 0.51
136 0.59
137 0.69
138 0.7
139 0.79
140 0.8
141 0.78
142 0.79
143 0.76
144 0.7
145 0.63
146 0.57
147 0.47
148 0.38
149 0.3
150 0.22
151 0.16
152 0.11
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.1
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.15
181 0.23
182 0.26
183 0.35
184 0.39
185 0.43
186 0.46
187 0.53
188 0.53
189 0.51
190 0.5
191 0.42
192 0.36
193 0.35
194 0.32
195 0.25
196 0.22
197 0.16
198 0.13
199 0.11
200 0.1
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.11
206 0.13
207 0.13
208 0.15
209 0.17
210 0.17
211 0.26
212 0.26
213 0.26
214 0.26
215 0.26
216 0.24
217 0.21
218 0.19
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.15
223 0.17
224 0.17
225 0.17
226 0.19
227 0.24
228 0.25
229 0.27
230 0.3
231 0.34
232 0.36
233 0.37
234 0.36
235 0.32
236 0.31
237 0.28
238 0.19
239 0.12
240 0.12
241 0.15
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.11
249 0.09
250 0.13
251 0.17
252 0.23
253 0.23
254 0.24
255 0.26
256 0.26
257 0.26
258 0.24
259 0.25
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.21
264 0.21
265 0.2
266 0.18
267 0.13
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.08
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.15
297 0.16
298 0.15
299 0.14
300 0.15
301 0.2
302 0.25
303 0.27
304 0.24
305 0.24
306 0.27
307 0.27
308 0.29
309 0.25
310 0.23
311 0.21
312 0.19
313 0.17
314 0.15
315 0.14
316 0.12
317 0.11
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.07
330 0.12
331 0.13
332 0.19
333 0.22
334 0.24
335 0.3
336 0.38
337 0.4
338 0.42
339 0.47
340 0.48
341 0.51
342 0.51
343 0.45
344 0.4
345 0.36
346 0.3
347 0.23
348 0.17
349 0.12
350 0.11
351 0.17
352 0.17
353 0.19
354 0.22
355 0.26
356 0.3
357 0.33
358 0.35
359 0.36
360 0.33
361 0.31
362 0.32
363 0.31
364 0.33
365 0.35
366 0.36
367 0.36
368 0.45
369 0.46
370 0.44
371 0.45
372 0.41
373 0.38
374 0.42
375 0.37
376 0.33
377 0.31
378 0.3
379 0.26
380 0.25
381 0.23
382 0.16
383 0.14
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.04
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.17
399 0.21
400 0.29
401 0.32
402 0.36
403 0.41
404 0.44
405 0.49
406 0.46
407 0.48
408 0.46
409 0.51
410 0.54
411 0.54
412 0.58
413 0.58
414 0.55
415 0.51
416 0.47
417 0.45
418 0.44
419 0.41
420 0.38
421 0.38
422 0.39
423 0.39
424 0.38
425 0.32
426 0.32
427 0.33
428 0.36
429 0.33
430 0.33
431 0.36
432 0.35
433 0.34
434 0.29
435 0.25
436 0.24
437 0.23
438 0.23
439 0.26
440 0.28
441 0.3
442 0.35
443 0.38
444 0.4
445 0.46
446 0.5
447 0.54
448 0.6
449 0.6
450 0.61
451 0.61
452 0.56
453 0.55
454 0.51
455 0.41
456 0.34
457 0.38
458 0.37
459 0.35
460 0.35
461 0.3
462 0.3
463 0.31
464 0.37
465 0.36
466 0.36
467 0.35
468 0.38
469 0.39
470 0.39
471 0.41
472 0.41
473 0.4
474 0.44
475 0.51
476 0.54
477 0.59
478 0.62
479 0.62
480 0.62
481 0.65
482 0.6
483 0.58
484 0.56
485 0.54
486 0.48
487 0.47
488 0.42
489 0.37
490 0.35
491 0.3
492 0.28
493 0.24
494 0.28
495 0.27
496 0.28
497 0.3
498 0.32
499 0.32
500 0.3
501 0.3
502 0.29
503 0.27
504 0.25
505 0.22
506 0.21
507 0.21
508 0.25
509 0.31
510 0.36
511 0.46
512 0.51
513 0.57
514 0.62
515 0.63
516 0.68
517 0.7
518 0.72
519 0.72
520 0.76
521 0.78
522 0.82
523 0.87
524 0.86
525 0.85
526 0.83
527 0.82
528 0.76
529 0.73
530 0.72
531 0.73
532 0.71
533 0.67
534 0.6
535 0.56
536 0.6
537 0.59
538 0.54
539 0.54
540 0.57
541 0.62
542 0.72
543 0.72
544 0.72
545 0.73
546 0.79
547 0.8
548 0.8
549 0.78
550 0.78