Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R283

Protein Details
Accession C4R283    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-41ISPAGEKKSKVRKPYIRQVAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-32RKSAISPAGEKKSKVRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 13, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0300  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MDQFGRPVYSRLWNRRKSAISPAGEKKSKVRKPYIRQVAASRSSNVTVNPTLADPDASSDEEVAEDRILSNLDSSNKKYTNLDLSNKSPKKELNMYQGIEKSREPVVESDREPTPIVLKLLNDTGNYTANKKAQTKESVMQKYSSKKFSPLIVSYEALRNAIEPHLAIVPAILNGSKPSYFYSLAYEVSKSSKNRVLTKNVLENIDMTKFEVGYLGMKRAGIISDFIRSKYRTLLSELGKSNPVIQFWSVDMFVTCALTPEVISRYIKEEMKLSDLSDAYDLMEWTSDYGKYIMDTEPVGHASWDENTDWTASSNTKETSSGNSPPEPESDTDSLLETGAATNLLTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.72
3 0.74
4 0.68
5 0.69
6 0.67
7 0.62
8 0.63
9 0.67
10 0.68
11 0.66
12 0.63
13 0.62
14 0.64
15 0.65
16 0.65
17 0.68
18 0.69
19 0.75
20 0.84
21 0.86
22 0.81
23 0.79
24 0.77
25 0.75
26 0.71
27 0.64
28 0.56
29 0.48
30 0.43
31 0.4
32 0.34
33 0.3
34 0.24
35 0.22
36 0.2
37 0.18
38 0.18
39 0.16
40 0.16
41 0.11
42 0.13
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.1
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.1
59 0.15
60 0.19
61 0.22
62 0.29
63 0.3
64 0.32
65 0.33
66 0.33
67 0.38
68 0.41
69 0.44
70 0.41
71 0.46
72 0.56
73 0.57
74 0.54
75 0.48
76 0.43
77 0.44
78 0.47
79 0.47
80 0.46
81 0.5
82 0.49
83 0.5
84 0.52
85 0.47
86 0.41
87 0.35
88 0.27
89 0.23
90 0.22
91 0.19
92 0.19
93 0.22
94 0.24
95 0.25
96 0.26
97 0.25
98 0.26
99 0.25
100 0.22
101 0.19
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.14
110 0.13
111 0.14
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.2
117 0.25
118 0.27
119 0.29
120 0.31
121 0.35
122 0.37
123 0.39
124 0.46
125 0.46
126 0.44
127 0.44
128 0.42
129 0.46
130 0.46
131 0.45
132 0.37
133 0.35
134 0.36
135 0.37
136 0.38
137 0.32
138 0.31
139 0.28
140 0.27
141 0.25
142 0.25
143 0.21
144 0.16
145 0.14
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.03
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.07
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.14
170 0.15
171 0.16
172 0.16
173 0.15
174 0.13
175 0.14
176 0.18
177 0.16
178 0.18
179 0.22
180 0.26
181 0.33
182 0.37
183 0.42
184 0.43
185 0.47
186 0.49
187 0.46
188 0.43
189 0.35
190 0.31
191 0.26
192 0.22
193 0.18
194 0.12
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.06
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.11
208 0.08
209 0.09
210 0.08
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.19
215 0.19
216 0.2
217 0.23
218 0.25
219 0.21
220 0.25
221 0.31
222 0.3
223 0.36
224 0.37
225 0.34
226 0.33
227 0.31
228 0.3
229 0.25
230 0.22
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.16
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.1
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.17
253 0.22
254 0.23
255 0.22
256 0.24
257 0.23
258 0.27
259 0.27
260 0.23
261 0.22
262 0.21
263 0.2
264 0.17
265 0.15
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.14
285 0.15
286 0.14
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.13
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.14
297 0.13
298 0.14
299 0.13
300 0.15
301 0.19
302 0.2
303 0.2
304 0.21
305 0.21
306 0.26
307 0.3
308 0.34
309 0.35
310 0.36
311 0.37
312 0.37
313 0.38
314 0.35
315 0.3
316 0.31
317 0.28
318 0.27
319 0.26
320 0.25
321 0.23
322 0.2
323 0.18
324 0.12
325 0.1
326 0.09
327 0.08