FuNGI

Q2GYW2

Protein Details

Accession

Q2GYW2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-45	DTIATSSQKPDKKHKRSKSDHKKKRAREEEDATVV	Hydrophilic
71-96	EASADEAVKKKKKKQRAPEEVENGQD	Hydrophilic
98-124	IIAADEPKKERKKSKKRAKDVEQAGAE	Hydrophilic
137-164	EEAGGAERKRKDKKKSKKQELDRDDEMR	Basic
169-192	EADAGPQEKKKRKNKTTQEMQSTQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-37	KPDKKHKRSKSDHKKKRAR
79-87	KKKKKKQRA
104-116	PKKERKKSKKRAK
142-154	AERKRKDKKKSKK
177-181	KKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, mito_nucl 11, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MSATAGGSSQDTIATSSQKPDKKHKRSKSDHKKKRAREEEDATVVEEIPRKSKKSRSADAEDRLAQPEHIEASADEAVKKKKKKQRAPEEVENGQDGIIAADEPKKERKKSKKRAKDVEQAGAEPMDVDLPETAPPEEAGGAERKRKDKKKSKKQELDRDDEMRDELPEADAGPQEKKKRKNKTTQEMQSTQESVAEVSSDSEFPFFTQTISLYVPFFPIGFDKPLTNVAAQHLDPLLNHYSPLLRGVLLSYSNLNLSDRPAKASITHPPTDETPALLHSIDEYAVGFGWLTFDAQLFVPSRGKWMEGVVQLQSEGHIGVVCWGKFNASIEAKRLPESWKWIDLAKGGARPNAFAASEENEGEQGGQEAEDVLDGEELQVVEQIHTTGYWVNGEGKKLSGKLRFRIKNFDVGLAGDYGYLSIEGTCLDDDAERALAAKERDMEKARRAKQNPGGLLRPLSRRVPEFSMTKFGREDQEEDDGQRAVLYKGSRPGTPDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.17
3	0.24
4	0.32
5	0.37
6	0.42
7	0.52
8	0.61
9	0.68
10	0.77
11	0.8
12	0.84
13	0.89
14	0.95
15	0.95
16	0.95
17	0.95
18	0.95
19	0.95
20	0.94
21	0.95
22	0.94
23	0.91
24	0.89
25	0.86
26	0.83
27	0.77
28	0.68
29	0.58
30	0.47
31	0.39
32	0.32
33	0.29
34	0.22
35	0.25
36	0.29
37	0.32
38	0.38
39	0.46
40	0.54
41	0.58
42	0.67
43	0.68
44	0.72
45	0.77
46	0.76
47	0.74
48	0.68
49	0.6
50	0.54
51	0.46
52	0.36
53	0.28
54	0.24
55	0.18
56	0.15
57	0.14
58	0.1
59	0.14
60	0.17
61	0.17
62	0.17
63	0.2
64	0.28
65	0.36
66	0.43
67	0.48
68	0.54
69	0.65
70	0.74
71	0.81
72	0.84
73	0.87
74	0.9
75	0.9
76	0.89
77	0.81
78	0.72
79	0.62
80	0.5
81	0.39
82	0.29
83	0.19
84	0.11
85	0.08
86	0.06
87	0.06
88	0.09
89	0.11
90	0.14
91	0.23
92	0.3
93	0.37
94	0.48
95	0.58
96	0.66
97	0.76
98	0.85
99	0.87
100	0.9
101	0.94
102	0.93
103	0.92
104	0.87
105	0.84
106	0.75
107	0.64
108	0.55
109	0.44
110	0.34
111	0.23
112	0.17
113	0.08
114	0.06
115	0.06
116	0.05
117	0.06
118	0.07
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.07
126	0.09
127	0.14
128	0.16
129	0.22
130	0.27
131	0.34
132	0.44
133	0.52
134	0.61
135	0.66
136	0.75
137	0.81
138	0.88
139	0.91
140	0.92
141	0.94
142	0.94
143	0.91
144	0.87
145	0.81
146	0.74
147	0.63
148	0.53
149	0.43
150	0.33
151	0.25
152	0.18
153	0.13
154	0.09
155	0.09
156	0.08
157	0.08
158	0.09
159	0.1
160	0.13
161	0.17
162	0.25
163	0.33
164	0.42
165	0.5
166	0.6
167	0.69
168	0.76
169	0.82
170	0.84
171	0.88
172	0.87
173	0.86
174	0.78
175	0.71
176	0.63
177	0.53
178	0.42
179	0.32
180	0.24
181	0.15
182	0.12
183	0.09
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.09
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.09
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.09
204	0.09
205	0.07
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.13
213	0.13
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.13
218	0.13
219	0.13
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.12
224	0.13
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.11
231	0.08
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.06
244	0.08
245	0.13
246	0.13
247	0.15
248	0.16
249	0.16
250	0.17
251	0.19
252	0.25
253	0.25
254	0.26
255	0.24
256	0.25
257	0.26
258	0.28
259	0.25
260	0.18
261	0.13
262	0.13
263	0.13
264	0.11
265	0.1
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.03
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.08
284	0.08
285	0.1
286	0.12
287	0.12
288	0.14
289	0.14
290	0.14
291	0.13
292	0.13
293	0.16
294	0.16
295	0.17
296	0.15
297	0.15
298	0.14
299	0.14
300	0.12
301	0.08
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.07
307	0.11
308	0.1
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.12
313	0.14
314	0.17
315	0.18
316	0.19
317	0.22
318	0.26
319	0.27
320	0.27
321	0.27
322	0.25
323	0.23
324	0.3
325	0.3
326	0.29
327	0.29
328	0.28
329	0.28
330	0.26
331	0.27
332	0.22
333	0.23
334	0.22
335	0.24
336	0.23
337	0.22
338	0.22
339	0.2
340	0.17
341	0.13
342	0.14
343	0.14
344	0.16
345	0.15
346	0.14
347	0.12
348	0.12
349	0.11
350	0.09
351	0.07
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.15
379	0.17
380	0.19
381	0.19
382	0.2
383	0.22
384	0.25
385	0.3
386	0.32
387	0.36
388	0.42
389	0.52
390	0.58
391	0.59
392	0.66
393	0.62
394	0.63
395	0.58
396	0.53
397	0.43
398	0.36
399	0.33
400	0.24
401	0.21
402	0.12
403	0.1
404	0.08
405	0.07
406	0.06
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.09
419	0.07
420	0.08
421	0.09
422	0.13
423	0.13
424	0.15
425	0.19
426	0.21
427	0.28
428	0.33
429	0.38
430	0.43
431	0.52
432	0.58
433	0.63
434	0.64
435	0.68
436	0.7
437	0.74
438	0.73
439	0.69
440	0.65
441	0.58
442	0.6
443	0.56
444	0.53
445	0.48
446	0.46
447	0.44
448	0.44
449	0.46
450	0.46
451	0.46
452	0.44
453	0.43
454	0.48
455	0.44
456	0.44
457	0.4
458	0.38
459	0.4
460	0.39
461	0.39
462	0.33
463	0.38
464	0.37
465	0.36
466	0.35
467	0.29
468	0.25
469	0.22
470	0.2
471	0.14
472	0.17
473	0.17
474	0.2
475	0.27
476	0.3
477	0.31

Q2GYW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer