Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TF43

Protein Details
Accession A7TF43    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-117QCKVISKSSKKLKGPKIKSNETRMSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-108KKLKGPK
402-409RRGRGPRR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG vpo:Kpol_2000p33  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MGSKQDISVESVQDQTSVAIGSFFKGFNVPNETSFELYKKKNSDGEFVVHGENSRLEYEGSTDSTASDSVQYVVGVYDPSKKNIKLYKAPLVQCKVISKSSKKLKGPKIKSNETRMSILRNALGEAFGTKKAKKAIMDLEKNRVDADKLVESAIDIVDSVKAASKDLPSKADLDEMVSNDRPTPLANVEATDVEEIYPINNIIPKREWQFIRVGPIIKEEDQEQKLEMFPYTKSQYISKKLSTLSQSNNMTKLQLLYYLSLLLGVYDNRRANNKDKLLEKLNSPPEILIDGVLDRFTISRPGQFGKSKDRSYFIDPQNEDRLLCFILTIILHLDNFIVEISPLAQELGLKPSKVVSLFRILGCIVKGATVSQAEAFGIPKSAASTYKIASLKVPFKLPEMVRRGRGPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.16
3 0.13
4 0.11
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.1
9 0.12
10 0.11
11 0.11
12 0.14
13 0.15
14 0.18
15 0.25
16 0.25
17 0.25
18 0.3
19 0.32
20 0.31
21 0.32
22 0.31
23 0.31
24 0.33
25 0.39
26 0.39
27 0.42
28 0.46
29 0.47
30 0.49
31 0.46
32 0.46
33 0.41
34 0.39
35 0.35
36 0.29
37 0.27
38 0.22
39 0.19
40 0.17
41 0.15
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.15
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.16
65 0.17
66 0.21
67 0.27
68 0.28
69 0.35
70 0.41
71 0.48
72 0.48
73 0.54
74 0.6
75 0.62
76 0.66
77 0.67
78 0.64
79 0.59
80 0.52
81 0.5
82 0.44
83 0.42
84 0.45
85 0.42
86 0.47
87 0.55
88 0.61
89 0.63
90 0.7
91 0.74
92 0.77
93 0.81
94 0.81
95 0.8
96 0.82
97 0.82
98 0.81
99 0.78
100 0.7
101 0.66
102 0.57
103 0.53
104 0.45
105 0.39
106 0.32
107 0.25
108 0.22
109 0.18
110 0.16
111 0.12
112 0.1
113 0.1
114 0.12
115 0.15
116 0.15
117 0.18
118 0.22
119 0.25
120 0.25
121 0.28
122 0.34
123 0.41
124 0.5
125 0.5
126 0.54
127 0.52
128 0.51
129 0.47
130 0.38
131 0.29
132 0.21
133 0.22
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.1
141 0.06
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.09
151 0.11
152 0.16
153 0.17
154 0.19
155 0.18
156 0.2
157 0.19
158 0.19
159 0.16
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.09
179 0.08
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.07
188 0.07
189 0.09
190 0.11
191 0.14
192 0.17
193 0.22
194 0.22
195 0.22
196 0.27
197 0.26
198 0.3
199 0.29
200 0.28
201 0.22
202 0.25
203 0.25
204 0.2
205 0.2
206 0.16
207 0.2
208 0.2
209 0.2
210 0.18
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.15
215 0.09
216 0.09
217 0.13
218 0.15
219 0.16
220 0.17
221 0.21
222 0.27
223 0.33
224 0.37
225 0.33
226 0.34
227 0.33
228 0.36
229 0.36
230 0.35
231 0.31
232 0.34
233 0.38
234 0.36
235 0.38
236 0.33
237 0.3
238 0.25
239 0.22
240 0.15
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.12
254 0.14
255 0.15
256 0.2
257 0.23
258 0.28
259 0.37
260 0.41
261 0.4
262 0.42
263 0.46
264 0.48
265 0.46
266 0.43
267 0.42
268 0.43
269 0.39
270 0.36
271 0.31
272 0.25
273 0.24
274 0.22
275 0.13
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.11
285 0.12
286 0.15
287 0.17
288 0.21
289 0.26
290 0.31
291 0.35
292 0.4
293 0.47
294 0.49
295 0.49
296 0.5
297 0.48
298 0.5
299 0.56
300 0.51
301 0.52
302 0.49
303 0.52
304 0.54
305 0.51
306 0.43
307 0.34
308 0.31
309 0.22
310 0.2
311 0.15
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.05
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.08
334 0.15
335 0.17
336 0.16
337 0.17
338 0.18
339 0.21
340 0.22
341 0.23
342 0.2
343 0.25
344 0.29
345 0.29
346 0.29
347 0.26
348 0.26
349 0.24
350 0.22
351 0.14
352 0.11
353 0.12
354 0.1
355 0.13
356 0.12
357 0.13
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.13
363 0.1
364 0.11
365 0.1
366 0.09
367 0.11
368 0.12
369 0.14
370 0.17
371 0.2
372 0.19
373 0.27
374 0.28
375 0.27
376 0.3
377 0.36
378 0.39
379 0.39
380 0.43
381 0.37
382 0.39
383 0.46
384 0.46
385 0.47
386 0.49
387 0.52
388 0.53
389 0.6