Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QAH4

Protein Details
Accession E3QAH4    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-75RRDDRDRRDDRDRRYRSRSRDRRDDRDHRPRSRDRERDRLRDDRDBasic
242-263VGAVRKEKKTEYRQYMNRQGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-96RRNHRGGGGPRDRDGRRDDRDRRDDRDRRYRSRSRDRRDDRDHRPRSRDRERDRLRDDRDGGRPPRRERGGWQGRDDRRRR
115-136RNTPRGKDRRRSASPRRSGSPP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MGRGRDSRQAWDEPDRRNHRGGGGPRDRDGRRDDRDRRDDRDRRYRSRSRDRRDDRDHRPRSRDRERDRLRDDRDGGRPPRRERGGWQGRDDRRRRDDDLLDERPPRRTDDDEGRNTPRGKDRRRSASPRRSGSPPLARRDPVSYTETLPTRTAPRGKKEQHTMSFKVGRHESPEVESGRDSERGDTPMTNGGRDDRREAADDDEPEPEVEVEDDDMAAMQAMLGFGGFGTTKNKKIAGNNVGAVRKEKKTEYRQYMNRQGGFNRPLSPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.65
3 0.64
4 0.63
5 0.6
6 0.54
7 0.56
8 0.57
9 0.57
10 0.58
11 0.58
12 0.58
13 0.64
14 0.6
15 0.55
16 0.55
17 0.53
18 0.52
19 0.59
20 0.65
21 0.67
22 0.77
23 0.78
24 0.78
25 0.79
26 0.79
27 0.78
28 0.8
29 0.78
30 0.77
31 0.81
32 0.82
33 0.81
34 0.85
35 0.86
36 0.84
37 0.87
38 0.87
39 0.87
40 0.89
41 0.89
42 0.88
43 0.88
44 0.89
45 0.86
46 0.86
47 0.85
48 0.84
49 0.85
50 0.85
51 0.81
52 0.82
53 0.83
54 0.83
55 0.82
56 0.81
57 0.75
58 0.73
59 0.69
60 0.65
61 0.62
62 0.61
63 0.61
64 0.6
65 0.63
66 0.59
67 0.64
68 0.61
69 0.57
70 0.53
71 0.57
72 0.59
73 0.56
74 0.58
75 0.58
76 0.61
77 0.69
78 0.7
79 0.68
80 0.64
81 0.65
82 0.63
83 0.59
84 0.56
85 0.54
86 0.57
87 0.52
88 0.49
89 0.49
90 0.46
91 0.44
92 0.41
93 0.36
94 0.31
95 0.3
96 0.32
97 0.37
98 0.45
99 0.45
100 0.48
101 0.49
102 0.5
103 0.47
104 0.45
105 0.43
106 0.44
107 0.46
108 0.5
109 0.55
110 0.59
111 0.67
112 0.74
113 0.76
114 0.77
115 0.78
116 0.73
117 0.69
118 0.63
119 0.58
120 0.56
121 0.55
122 0.5
123 0.47
124 0.46
125 0.43
126 0.41
127 0.41
128 0.36
129 0.29
130 0.27
131 0.22
132 0.2
133 0.23
134 0.23
135 0.21
136 0.2
137 0.18
138 0.18
139 0.21
140 0.26
141 0.28
142 0.33
143 0.41
144 0.45
145 0.51
146 0.56
147 0.6
148 0.61
149 0.63
150 0.6
151 0.57
152 0.58
153 0.53
154 0.5
155 0.44
156 0.37
157 0.35
158 0.34
159 0.29
160 0.25
161 0.28
162 0.24
163 0.23
164 0.22
165 0.19
166 0.18
167 0.2
168 0.18
169 0.15
170 0.17
171 0.17
172 0.19
173 0.17
174 0.17
175 0.21
176 0.21
177 0.19
178 0.17
179 0.21
180 0.24
181 0.26
182 0.28
183 0.24
184 0.25
185 0.27
186 0.28
187 0.28
188 0.27
189 0.28
190 0.25
191 0.23
192 0.22
193 0.19
194 0.18
195 0.14
196 0.1
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.02
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.12
218 0.16
219 0.2
220 0.23
221 0.26
222 0.29
223 0.35
224 0.44
225 0.45
226 0.47
227 0.47
228 0.51
229 0.51
230 0.49
231 0.48
232 0.44
233 0.4
234 0.4
235 0.42
236 0.46
237 0.53
238 0.63
239 0.67
240 0.72
241 0.77
242 0.83
243 0.86
244 0.85
245 0.79
246 0.73
247 0.66
248 0.65
249 0.61
250 0.54
251 0.48