Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QHF1

Protein Details
Accession E3QHF1    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-49QQDKMVQKEKKSEKKGKAVAAPHydrophilic
292-311SDSDKDTKKKSAKKAAKTADHydrophilic
394-421LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
300-305KKSAKK
400-413KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSAPPSWLFSNNFTKTNDTAPTTITTSQQDKMVQKEKKSEKKGKAVAAPTQQAPPDQLMDLVDSFLSENAFTSAHEAFQKQRTQSGWKPSKKQTTRPDLVTIFQTWQTSLDVKAVSSDSDTSSSDSDSSSDDEDVDMADAAADSDSSSSSSSSSDSDSSSDSESESEDEKLAPKAATKNALKRKAPESDSSSSDSSSDESSSDESSSEDEAPKAKKQKVKKDDSSDSSDSSSDSSSDSSSDSDSSDSDSDSDSSDSDSDSDSDSDGSSAAKVPLPESGSDSSSSDSDSDSDSDSDKDTKKKSAKKAAKTADSASNSSATLEKTSPEASTAADPPLPPDPMLNRPNNRGGKGANGKGKVPNKPFSRIPDEVYVDPKFASNEYVPNDYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDISEKKGIKFDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.45
4 0.43
5 0.37
6 0.34
7 0.32
8 0.33
9 0.32
10 0.31
11 0.29
12 0.3
13 0.29
14 0.3
15 0.32
16 0.36
17 0.36
18 0.43
19 0.49
20 0.5
21 0.52
22 0.6
23 0.67
24 0.71
25 0.78
26 0.79
27 0.79
28 0.83
29 0.85
30 0.82
31 0.8
32 0.75
33 0.72
34 0.7
35 0.65
36 0.57
37 0.53
38 0.46
39 0.39
40 0.36
41 0.3
42 0.24
43 0.19
44 0.18
45 0.15
46 0.16
47 0.15
48 0.13
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.07
59 0.11
60 0.1
61 0.12
62 0.14
63 0.16
64 0.19
65 0.26
66 0.32
67 0.29
68 0.34
69 0.35
70 0.41
71 0.47
72 0.53
73 0.57
74 0.59
75 0.66
76 0.7
77 0.78
78 0.77
79 0.8
80 0.79
81 0.79
82 0.78
83 0.73
84 0.71
85 0.61
86 0.56
87 0.49
88 0.41
89 0.32
90 0.28
91 0.25
92 0.18
93 0.18
94 0.18
95 0.15
96 0.14
97 0.15
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.08
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.12
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.1
160 0.12
161 0.15
162 0.17
163 0.24
164 0.27
165 0.35
166 0.43
167 0.51
168 0.5
169 0.5
170 0.53
171 0.52
172 0.52
173 0.48
174 0.45
175 0.4
176 0.41
177 0.4
178 0.36
179 0.29
180 0.26
181 0.21
182 0.15
183 0.13
184 0.11
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.11
198 0.14
199 0.17
200 0.23
201 0.26
202 0.31
203 0.39
204 0.49
205 0.56
206 0.64
207 0.67
208 0.69
209 0.71
210 0.7
211 0.69
212 0.6
213 0.51
214 0.43
215 0.35
216 0.27
217 0.21
218 0.16
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.05
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.15
264 0.16
265 0.15
266 0.16
267 0.17
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.11
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.16
282 0.18
283 0.24
284 0.25
285 0.33
286 0.41
287 0.49
288 0.57
289 0.63
290 0.69
291 0.73
292 0.8
293 0.8
294 0.77
295 0.72
296 0.66
297 0.63
298 0.57
299 0.49
300 0.4
301 0.33
302 0.27
303 0.24
304 0.22
305 0.15
306 0.14
307 0.13
308 0.12
309 0.14
310 0.15
311 0.14
312 0.14
313 0.13
314 0.12
315 0.15
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.19
322 0.19
323 0.16
324 0.17
325 0.2
326 0.27
327 0.35
328 0.41
329 0.42
330 0.46
331 0.55
332 0.58
333 0.55
334 0.5
335 0.44
336 0.45
337 0.49
338 0.51
339 0.49
340 0.45
341 0.46
342 0.52
343 0.57
344 0.56
345 0.55
346 0.56
347 0.54
348 0.58
349 0.61
350 0.6
351 0.62
352 0.56
353 0.53
354 0.52
355 0.52
356 0.48
357 0.48
358 0.41
359 0.34
360 0.31
361 0.28
362 0.22
363 0.18
364 0.2
365 0.17
366 0.21
367 0.24
368 0.28
369 0.27
370 0.29
371 0.31
372 0.28
373 0.28
374 0.25
375 0.27
376 0.25
377 0.26
378 0.25
379 0.26
380 0.26
381 0.31
382 0.32
383 0.26
384 0.26
385 0.3
386 0.3
387 0.35
388 0.37
389 0.4
390 0.48
391 0.59
392 0.67
393 0.74
394 0.82
395 0.83
396 0.9
397 0.91
398 0.9
399 0.9
400 0.88
401 0.86
402 0.84
403 0.78
404 0.67
405 0.57
406 0.55
407 0.48
408 0.43
409 0.38
410 0.31
411 0.29