Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QE16

Protein Details
Accession E3QE16    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-127WKEVDEKMARRRQKQREAREKAEQEEBasic
160-179VGDLTGKNRRSKQNLRQRFYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-115RRQK
Subcellular Location(s) cyto_mito 10, mito 9.5, cyto 9.5, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTEDQIKEAVAKRAAQLGLGTDGKKADENDNDDDDRFKDPDNEVGLFAGGVYDKDDEEADRIWKEVDEKMARRRQKQREAREKAEQEEYERKNPKIQQQFADLKRALSTVTDDEWANLPEVGDLTGKNRRSKQNLRQRFYAVPDSVLAAARDSSELGTTVAEDGTASSADAADGTMTNFAKIGAARDKVLKSRLEQASLDGTESVAGSASTIDPKGYITSLNKSVLSESQAQVGDINRVRELLTSVIKTNPSNAPGWIAAARLEELAGKTVAARNVIARGCTHCPKSEDVWLENIRLNEGKNAKIIAAEAIKKNDRSVRLWVEAMRLENEPRAKKRVIRLALDHIPESEALWKEAVNLEEDPEDARLLLAKATELIPLSVDLWLALARLESPENAQKVLNRARKAVPTSHEIWIAAARLQEQLGEGTKVNVMKRAVAVLVKESAMPKREEWIAEAEKCEEEGAVITCGNIIRETLGYGLDEDDDRKDTWMEDAKSSINRGMYETARAIYSYALRVFVNSRTLWMAAADLERNHGTKESLAQVLEKAVEACPKSEVLWMMLAKEKWQAGEVDNARLVLARAFKSNPDNEDIWLAAVKLEAENGETERARKLLEEARDQAPTDRVWMKSVVFERVLGNGDAALDLVQQALQYFPATAKLWMLKGQIYEDLGKVGQAREAYSTGVKAVPKSVPLWLLYSRLEEKAGLVVKARSVLDRARLAVPKSPELWCESVRIERRAGNVNQAKSLMAKALQEVPKSGLLWSEQIWHLEPRTQRKPRSLEAIKKVDNDPILFVAVARIFWGERKLEKAQNWFEKALVLDSDNGDTWAWYYRFLLQHGTDEKRADVINKCVLNEPRHGEYWQAIAKQPVNARKGTEEVLEMVADALEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.36
40 0.35
41 0.29
42 0.26
43 0.21
44 0.23
45 0.25
46 0.24
47 0.19
48 0.2
49 0.2
50 0.22
51 0.23
52 0.24
53 0.28
54 0.33
55 0.36
56 0.41
57 0.41
58 0.39
59 0.38
60 0.34
61 0.31
62 0.27
63 0.23
64 0.23
65 0.23
66 0.29
67 0.31
68 0.3
69 0.27
70 0.26
71 0.24
72 0.19
73 0.17
74 0.11
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.12
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.16
90 0.18
91 0.19
92 0.26
93 0.31
94 0.36
95 0.45
96 0.54
97 0.6
98 0.68
99 0.75
100 0.77
101 0.79
102 0.84
103 0.86
104 0.88
105 0.89
106 0.87
107 0.87
108 0.81
109 0.74
110 0.72
111 0.62
112 0.57
113 0.58
114 0.56
115 0.55
116 0.57
117 0.54
118 0.53
119 0.58
120 0.61
121 0.62
122 0.63
123 0.57
124 0.6
125 0.69
126 0.63
127 0.66
128 0.57
129 0.48
130 0.42
131 0.38
132 0.29
133 0.21
134 0.21
135 0.15
136 0.16
137 0.17
138 0.16
139 0.17
140 0.19
141 0.19
142 0.16
143 0.13
144 0.12
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.12
151 0.19
152 0.24
153 0.3
154 0.37
155 0.45
156 0.54
157 0.64
158 0.7
159 0.75
160 0.81
161 0.8
162 0.78
163 0.74
164 0.69
165 0.64
166 0.62
167 0.51
168 0.41
169 0.36
170 0.32
171 0.28
172 0.25
173 0.19
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.14
209 0.16
210 0.18
211 0.19
212 0.24
213 0.26
214 0.29
215 0.33
216 0.31
217 0.28
218 0.36
219 0.38
220 0.36
221 0.34
222 0.32
223 0.33
224 0.31
225 0.29
226 0.19
227 0.16
228 0.13
229 0.13
230 0.1
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.11
244 0.13
245 0.17
246 0.21
247 0.23
248 0.23
249 0.22
250 0.23
251 0.22
252 0.22
253 0.22
254 0.18
255 0.21
256 0.2
257 0.2
258 0.2
259 0.19
260 0.21
261 0.2
262 0.21
263 0.16
264 0.17
265 0.17
266 0.16
267 0.17
268 0.14
269 0.15
270 0.15
271 0.16
272 0.18
273 0.2
274 0.2
275 0.22
276 0.22
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.19
281 0.17
282 0.19
283 0.15
284 0.13
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.15
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.17
306 0.21
307 0.26
308 0.27
309 0.26
310 0.28
311 0.3
312 0.32
313 0.34
314 0.33
315 0.29
316 0.34
317 0.32
318 0.31
319 0.3
320 0.27
321 0.22
322 0.2
323 0.19
324 0.18
325 0.19
326 0.18
327 0.17
328 0.18
329 0.16
330 0.15
331 0.15
332 0.12
333 0.13
334 0.15
335 0.16
336 0.2
337 0.22
338 0.22
339 0.25
340 0.27
341 0.27
342 0.26
343 0.31
344 0.31
345 0.31
346 0.32
347 0.31
348 0.29
349 0.27
350 0.26
351 0.21
352 0.17
353 0.15
354 0.17
355 0.22
356 0.24
357 0.26
358 0.3
359 0.3
360 0.34
361 0.4
362 0.46
363 0.45
364 0.44
365 0.44
366 0.46
367 0.49
368 0.46
369 0.39
370 0.3
371 0.26
372 0.22
373 0.19
374 0.16
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.12
381 0.12
382 0.1
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.08
389 0.08
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.05
396 0.04
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.03
413 0.03
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.07
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.13
422 0.13
423 0.19
424 0.28
425 0.32
426 0.29
427 0.32
428 0.33
429 0.37
430 0.38
431 0.36
432 0.3
433 0.29
434 0.31
435 0.29
436 0.27
437 0.23
438 0.21
439 0.18
440 0.15
441 0.12
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.08
454 0.1
455 0.1
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.11
463 0.11
464 0.08
465 0.09
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.11
470 0.13
471 0.14
472 0.13
473 0.15
474 0.16
475 0.16
476 0.16
477 0.19
478 0.2
479 0.2
480 0.2
481 0.19
482 0.17
483 0.17
484 0.15
485 0.09
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.12
515 0.17
516 0.18
517 0.17
518 0.18
519 0.19
520 0.2
521 0.21
522 0.2
523 0.14
524 0.13
525 0.14
526 0.16
527 0.15
528 0.16
529 0.16
530 0.14
531 0.13
532 0.13
533 0.11
534 0.09
535 0.1
536 0.1
537 0.09
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.13
543 0.16
544 0.13
545 0.14
546 0.14
547 0.14
548 0.13
549 0.12
550 0.1
551 0.07
552 0.09
553 0.08
554 0.07
555 0.1
556 0.1
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.1
561 0.1
562 0.12
563 0.13
564 0.14
565 0.13
566 0.13
567 0.13
568 0.13
569 0.13
570 0.1
571 0.08
572 0.07
573 0.11
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.11
578 0.12
579 0.13
580 0.13
581 0.11
582 0.14
583 0.13
584 0.14
585 0.17
586 0.16
587 0.15
588 0.18
589 0.17
590 0.14
591 0.15
592 0.15
593 0.12
594 0.21
595 0.21
596 0.21
597 0.2
598 0.2
599 0.19
600 0.18
601 0.17
602 0.11
603 0.13
604 0.12
605 0.14
606 0.14
607 0.17
608 0.22
609 0.25
610 0.24
611 0.25
612 0.25
613 0.23
614 0.24
615 0.21
616 0.17
617 0.14
618 0.12
619 0.08
620 0.07
621 0.07
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.07
628 0.1
629 0.1
630 0.11
631 0.12
632 0.13
633 0.12
634 0.12
635 0.15
636 0.18
637 0.23
638 0.27
639 0.3
640 0.32
641 0.33
642 0.33
643 0.31
644 0.27
645 0.22
646 0.22
647 0.22
648 0.2
649 0.2
650 0.22
651 0.2
652 0.24
653 0.26
654 0.25
655 0.21
656 0.22
657 0.21
658 0.21
659 0.22
660 0.17
661 0.14
662 0.11
663 0.1
664 0.09
665 0.08
666 0.06
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.09
679 0.1
680 0.11
681 0.13
682 0.15
683 0.15
684 0.18
685 0.2
686 0.18
687 0.18
688 0.19
689 0.18
690 0.18
691 0.19
692 0.16
693 0.16
694 0.13
695 0.13
696 0.13
697 0.12
698 0.12
699 0.11
700 0.12
701 0.13
702 0.14
703 0.14
704 0.14
705 0.14
706 0.13
707 0.15
708 0.16
709 0.14
710 0.17
711 0.17
712 0.18
713 0.19
714 0.2
715 0.19
716 0.19
717 0.22
718 0.2
719 0.22
720 0.21
721 0.24
722 0.24
723 0.23
724 0.22
725 0.19
726 0.18
727 0.2
728 0.21
729 0.17
730 0.17
731 0.17
732 0.17
733 0.21
734 0.2
735 0.16
736 0.17
737 0.2
738 0.23
739 0.25
740 0.27
741 0.29
742 0.33
743 0.33
744 0.36
745 0.37
746 0.35
747 0.35
748 0.34
749 0.3
750 0.31
751 0.33
752 0.28
753 0.28
754 0.26
755 0.32
756 0.37
757 0.38
758 0.36
759 0.35
760 0.38
761 0.43
762 0.42
763 0.44
764 0.45
765 0.43
766 0.43
767 0.4
768 0.37
769 0.3
770 0.29
771 0.21
772 0.16
773 0.15
774 0.15
775 0.23
776 0.26
777 0.26
778 0.27
779 0.27
780 0.28
781 0.28
782 0.26
783 0.19
784 0.17
785 0.18
786 0.17
787 0.19
788 0.18
789 0.2
790 0.22
791 0.23
792 0.22
793 0.26
794 0.32
795 0.36
796 0.46
797 0.53
798 0.57
799 0.63
800 0.69
801 0.69
802 0.73
803 0.73
804 0.73
805 0.73
806 0.76
807 0.71
808 0.69
809 0.65
810 0.59
811 0.53
812 0.44
813 0.36
814 0.28
815 0.25
816 0.2
817 0.19
818 0.17
819 0.14
820 0.13
821 0.11
822 0.11
823 0.1
824 0.13
825 0.17
826 0.17
827 0.19
828 0.26
829 0.32
830 0.38
831 0.43
832 0.5
833 0.56
834 0.61
835 0.64
836 0.58
837 0.52
838 0.47
839 0.43
840 0.36
841 0.27
842 0.19
843 0.17
844 0.17
845 0.19
846 0.17
847 0.17
848 0.15
849 0.13
850 0.13
851 0.18
852 0.17
853 0.16
854 0.18
855 0.23
856 0.26
857 0.28
858 0.34
859 0.27
860 0.35
861 0.41
862 0.45
863 0.42
864 0.4
865 0.39
866 0.36
867 0.36
868 0.33
869 0.32
870 0.33
871 0.37
872 0.37
873 0.38
874 0.43
875 0.48
876 0.47
877 0.48
878 0.48
879 0.45
880 0.46
881 0.45
882 0.4
883 0.36
884 0.39
885 0.37
886 0.33
887 0.31
888 0.34
889 0.36
890 0.4
891 0.45
892 0.46
893 0.45
894 0.44
895 0.45
896 0.43
897 0.43
898 0.4
899 0.35
900 0.29
901 0.27
902 0.26
903 0.22
904 0.18
905 0.15