Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QDB0

Protein Details
Accession E3QDB0    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
368-395EQEKLEKRLKAEKEERKRRFFEQQRARRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-247TKKEREEMKKDAKKDPKAAARQPSKFQGNARPSAAAAPPRNGTGASRNGPVDRAKDPRAVSKARA
256-260KKLKK
272-299ARPKPGAASAKKKPAPGGALLNARPAPR
374-395KRLKAEKEERKRRFFEQQRARR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MPIGDLLAQISGDKSQSTSPAPSRPSIPPPKRKADDDLRNTVSNKIPRTSANGIASSAPSKLADTQRSARPTEKTATTTTGYRGSAGRPSDRSASAPKLVGNGSTAAKPSSSGARPLNGSSTSKVTSTLPSRPSPSAPSAAPKSGAPPKKGSFAEIMARAQQAQTKMGQVGKIQHKPVEKVFTKKEREEMKKDAKKDPKAAARQPSKFQGNARPSAAAAPPRNGTGASRNGPVDRAKDPRAVSKARAAVAEEENQKKLKKAAIATTGYTGTARPKPGAASAKKKPAPGGALLNARPAPRYGGSAKRSRYDEEEDEELDDFIEYDEDEEEAGPRYTYDSDGSSDMEAGMDDVWEEEARAERVARLEDIEQEKLEKRLKAEKEERKRRFFEQQRARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.16
4 0.2
5 0.26
6 0.29
7 0.36
8 0.39
9 0.41
10 0.44
11 0.46
12 0.53
13 0.57
14 0.62
15 0.65
16 0.7
17 0.78
18 0.79
19 0.77
20 0.76
21 0.75
22 0.76
23 0.73
24 0.74
25 0.68
26 0.67
27 0.63
28 0.59
29 0.55
30 0.51
31 0.47
32 0.41
33 0.39
34 0.36
35 0.43
36 0.43
37 0.43
38 0.41
39 0.38
40 0.36
41 0.35
42 0.35
43 0.28
44 0.23
45 0.17
46 0.13
47 0.13
48 0.18
49 0.24
50 0.27
51 0.31
52 0.37
53 0.43
54 0.46
55 0.48
56 0.47
57 0.44
58 0.44
59 0.44
60 0.42
61 0.39
62 0.38
63 0.38
64 0.36
65 0.34
66 0.32
67 0.31
68 0.27
69 0.25
70 0.23
71 0.21
72 0.25
73 0.27
74 0.29
75 0.27
76 0.3
77 0.32
78 0.32
79 0.33
80 0.33
81 0.34
82 0.32
83 0.31
84 0.28
85 0.27
86 0.26
87 0.23
88 0.19
89 0.17
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.13
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.17
98 0.17
99 0.21
100 0.22
101 0.24
102 0.26
103 0.26
104 0.28
105 0.24
106 0.25
107 0.21
108 0.23
109 0.21
110 0.2
111 0.2
112 0.18
113 0.21
114 0.23
115 0.27
116 0.28
117 0.3
118 0.33
119 0.34
120 0.35
121 0.34
122 0.33
123 0.3
124 0.26
125 0.3
126 0.29
127 0.28
128 0.27
129 0.23
130 0.25
131 0.3
132 0.35
133 0.32
134 0.34
135 0.35
136 0.41
137 0.41
138 0.38
139 0.32
140 0.29
141 0.3
142 0.26
143 0.25
144 0.2
145 0.2
146 0.18
147 0.16
148 0.16
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.16
156 0.15
157 0.21
158 0.28
159 0.31
160 0.31
161 0.33
162 0.34
163 0.36
164 0.37
165 0.38
166 0.33
167 0.34
168 0.4
169 0.45
170 0.48
171 0.47
172 0.51
173 0.51
174 0.56
175 0.56
176 0.57
177 0.59
178 0.59
179 0.62
180 0.63
181 0.63
182 0.61
183 0.61
184 0.59
185 0.56
186 0.58
187 0.6
188 0.61
189 0.6
190 0.58
191 0.55
192 0.55
193 0.49
194 0.44
195 0.42
196 0.41
197 0.38
198 0.38
199 0.36
200 0.31
201 0.28
202 0.28
203 0.27
204 0.24
205 0.2
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.19
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.2
214 0.2
215 0.21
216 0.21
217 0.21
218 0.24
219 0.24
220 0.23
221 0.21
222 0.24
223 0.25
224 0.29
225 0.3
226 0.34
227 0.38
228 0.37
229 0.35
230 0.36
231 0.37
232 0.33
233 0.32
234 0.27
235 0.25
236 0.25
237 0.28
238 0.28
239 0.27
240 0.28
241 0.3
242 0.29
243 0.27
244 0.27
245 0.25
246 0.24
247 0.26
248 0.3
249 0.34
250 0.36
251 0.35
252 0.35
253 0.31
254 0.27
255 0.23
256 0.18
257 0.16
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.18
262 0.19
263 0.25
264 0.33
265 0.35
266 0.4
267 0.45
268 0.54
269 0.57
270 0.57
271 0.53
272 0.48
273 0.45
274 0.4
275 0.38
276 0.34
277 0.36
278 0.35
279 0.37
280 0.34
281 0.31
282 0.28
283 0.23
284 0.22
285 0.17
286 0.21
287 0.23
288 0.3
289 0.35
290 0.42
291 0.45
292 0.47
293 0.49
294 0.47
295 0.48
296 0.46
297 0.44
298 0.41
299 0.41
300 0.36
301 0.34
302 0.31
303 0.26
304 0.19
305 0.14
306 0.1
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.1
321 0.11
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.17
327 0.18
328 0.16
329 0.15
330 0.13
331 0.12
332 0.1
333 0.08
334 0.07
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.1
343 0.11
344 0.13
345 0.13
346 0.14
347 0.17
348 0.19
349 0.19
350 0.19
351 0.19
352 0.25
353 0.29
354 0.3
355 0.27
356 0.29
357 0.31
358 0.34
359 0.39
360 0.34
361 0.35
362 0.42
363 0.47
364 0.54
365 0.62
366 0.67
367 0.72
368 0.81
369 0.85
370 0.85
371 0.84
372 0.8
373 0.81
374 0.8
375 0.8