Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QPI7

Protein Details
Accession E3QPI7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-267DVERRSGSRSRSRSRSRQRSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-151RKLRRKG
254-265SRSRSRSRSRQR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5, mito 1, extr 1, pero 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKPDLVYADERRFLDERGSSASLAPNGENPATIMEKAVRERIIDSYFYKEQCFAVNEADIVDRVVEHVSFIGGTYGVTQKPTPFLCLAFKLLQLAPSDAVLETYLGFGGDKFKYLRALACFYIRMTRKPRDVYLLLEPFLEDRRKLRRKGRQGASLTYMDDFVDDLLTKTRVCATSFRELPKRSDLVDLDELEERISPLGDIDELLEEEEERKANEREANAGANGADGSSEGEVAEDRSGDGEPMDVERRSGSRSRSRSRSRQRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.32
4 0.29
5 0.3
6 0.31
7 0.27
8 0.27
9 0.29
10 0.25
11 0.24
12 0.22
13 0.19
14 0.2
15 0.2
16 0.18
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.18
24 0.21
25 0.25
26 0.22
27 0.21
28 0.23
29 0.26
30 0.26
31 0.25
32 0.25
33 0.27
34 0.3
35 0.31
36 0.3
37 0.27
38 0.25
39 0.26
40 0.26
41 0.21
42 0.19
43 0.18
44 0.17
45 0.17
46 0.16
47 0.13
48 0.1
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.05
60 0.04
61 0.04
62 0.06
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.16
69 0.16
70 0.18
71 0.16
72 0.18
73 0.19
74 0.2
75 0.23
76 0.2
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.19
81 0.17
82 0.16
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.09
87 0.09
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.08
97 0.07
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.12
102 0.13
103 0.16
104 0.15
105 0.18
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.16
110 0.22
111 0.21
112 0.24
113 0.27
114 0.31
115 0.35
116 0.38
117 0.38
118 0.37
119 0.37
120 0.34
121 0.35
122 0.32
123 0.27
124 0.24
125 0.23
126 0.17
127 0.19
128 0.17
129 0.11
130 0.13
131 0.23
132 0.3
133 0.36
134 0.45
135 0.52
136 0.62
137 0.72
138 0.75
139 0.74
140 0.71
141 0.67
142 0.62
143 0.53
144 0.43
145 0.33
146 0.26
147 0.17
148 0.13
149 0.1
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.11
159 0.12
160 0.14
161 0.18
162 0.21
163 0.29
164 0.33
165 0.38
166 0.42
167 0.43
168 0.45
169 0.46
170 0.43
171 0.35
172 0.36
173 0.32
174 0.3
175 0.32
176 0.29
177 0.25
178 0.24
179 0.23
180 0.18
181 0.18
182 0.12
183 0.08
184 0.08
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.13
201 0.13
202 0.17
203 0.21
204 0.21
205 0.24
206 0.26
207 0.27
208 0.23
209 0.23
210 0.19
211 0.15
212 0.14
213 0.09
214 0.07
215 0.05
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.11
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.17
237 0.19
238 0.23
239 0.28
240 0.32
241 0.38
242 0.48
243 0.57
244 0.65
245 0.73
246 0.8
247 0.86