Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2HDJ0

Protein Details
Accession Q2HDJ0    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
576-600ISPAAPRRTPPRRARRVMARRLGTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
573-610PGAISPAAPRRTPPRRARRVMARRLGTRMGVGRARGVK
Subcellular Location(s) plas 21, extr 3, mito 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006876  LMBR1-like_membr_prot  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0031419  F:cobalamin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04791  LMBR1  
Amino Acid Sequences MAPAGLLQTSLIWVAYGVAVALVLLVSVITTLTWQTPHERSIAVSIVSIISLTALLATVFLLPVDIALVSSTASAHLGAKKDWATPGRVDGILLTLKIVYYTLYTLDALLCLIVIPFTYFWFEEYDEVEEEEGTSSAAARIWRALKYTLGFVFLVVILFLIGFFVPAAGNNPGKHMDLDYFKRLLAANNGEKALTFGVGLLITLGTLLYILYTSAGLALLPVSFIKSAPSISAPQLSATTASALEHNRELQRQLEMRNSGRPEGMSQKDRREMDALLREERTLVRRERLAAEARGDNRSKIYRAWTKVEAVFRPLKLLGGIFLLLLAILIWVSMLITGIDKAANSICKQHCGYILGHLNVFQPINWIFVQSAKAFPVDYILMALLVLLFFSSSITGLATIGIRFLWVRIFQLKKGRTAPQALLIATVLLGPHDPRHQLRGRHARGAAVRHLRHADLLRQPAAATRASSPTAASTATWCAPAPRPSASPAAIGRLHADRHVHLPQPRPPSNWPRLRRPSTSGPSSSSSPSSSSSSSPASSRTPRLNLSELDEEAEVDERGGPAGPAPAAALARPGAISPAAPRRTPPRRARRVMARRLGTRMGVGRARGVKLNGGAATENDKKEKKNGTWVWAWVWEWEWQTDWLAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.05
5 0.04
6 0.04
7 0.04
8 0.04
9 0.03
10 0.02
11 0.02
12 0.02
13 0.02
14 0.02
15 0.03
16 0.03
17 0.04
18 0.05
19 0.07
20 0.09
21 0.11
22 0.17
23 0.21
24 0.23
25 0.24
26 0.24
27 0.23
28 0.26
29 0.27
30 0.21
31 0.18
32 0.17
33 0.15
34 0.14
35 0.13
36 0.08
37 0.06
38 0.05
39 0.05
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.05
49 0.04
50 0.04
51 0.05
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.07
62 0.09
63 0.13
64 0.15
65 0.16
66 0.2
67 0.22
68 0.24
69 0.29
70 0.29
71 0.29
72 0.29
73 0.33
74 0.32
75 0.3
76 0.28
77 0.22
78 0.22
79 0.19
80 0.17
81 0.13
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.16
113 0.14
114 0.15
115 0.14
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.09
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.12
128 0.15
129 0.16
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.22
134 0.25
135 0.22
136 0.22
137 0.2
138 0.17
139 0.17
140 0.14
141 0.12
142 0.08
143 0.07
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.07
155 0.1
156 0.13
157 0.13
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.18
162 0.17
163 0.18
164 0.21
165 0.25
166 0.27
167 0.26
168 0.25
169 0.26
170 0.26
171 0.24
172 0.24
173 0.26
174 0.26
175 0.28
176 0.28
177 0.27
178 0.26
179 0.25
180 0.19
181 0.12
182 0.08
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.02
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.02
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.15
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.1
226 0.1
227 0.07
228 0.07
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.14
234 0.15
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.2
239 0.21
240 0.22
241 0.25
242 0.27
243 0.28
244 0.32
245 0.33
246 0.29
247 0.27
248 0.25
249 0.22
250 0.25
251 0.29
252 0.3
253 0.32
254 0.36
255 0.42
256 0.42
257 0.42
258 0.36
259 0.32
260 0.31
261 0.35
262 0.32
263 0.28
264 0.27
265 0.25
266 0.24
267 0.25
268 0.22
269 0.19
270 0.19
271 0.2
272 0.21
273 0.23
274 0.24
275 0.27
276 0.27
277 0.24
278 0.24
279 0.25
280 0.25
281 0.28
282 0.26
283 0.23
284 0.22
285 0.22
286 0.21
287 0.18
288 0.24
289 0.27
290 0.3
291 0.34
292 0.33
293 0.34
294 0.36
295 0.39
296 0.32
297 0.29
298 0.28
299 0.24
300 0.24
301 0.21
302 0.17
303 0.14
304 0.13
305 0.09
306 0.06
307 0.07
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.01
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.02
324 0.03
325 0.03
326 0.04
327 0.03
328 0.04
329 0.05
330 0.07
331 0.07
332 0.15
333 0.15
334 0.19
335 0.2
336 0.21
337 0.21
338 0.22
339 0.22
340 0.21
341 0.25
342 0.22
343 0.21
344 0.21
345 0.19
346 0.18
347 0.18
348 0.11
349 0.09
350 0.09
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.11
356 0.14
357 0.12
358 0.13
359 0.11
360 0.11
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.03
372 0.03
373 0.02
374 0.02
375 0.02
376 0.02
377 0.02
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.09
395 0.15
396 0.17
397 0.2
398 0.3
399 0.31
400 0.35
401 0.39
402 0.43
403 0.4
404 0.43
405 0.4
406 0.37
407 0.38
408 0.32
409 0.28
410 0.22
411 0.18
412 0.14
413 0.13
414 0.06
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.07
419 0.09
420 0.13
421 0.14
422 0.21
423 0.27
424 0.32
425 0.41
426 0.51
427 0.52
428 0.55
429 0.55
430 0.52
431 0.5
432 0.5
433 0.47
434 0.45
435 0.42
436 0.39
437 0.4
438 0.36
439 0.35
440 0.33
441 0.32
442 0.29
443 0.33
444 0.3
445 0.28
446 0.28
447 0.27
448 0.27
449 0.22
450 0.17
451 0.14
452 0.17
453 0.17
454 0.18
455 0.15
456 0.14
457 0.14
458 0.13
459 0.11
460 0.1
461 0.12
462 0.13
463 0.13
464 0.12
465 0.14
466 0.19
467 0.23
468 0.24
469 0.24
470 0.25
471 0.27
472 0.31
473 0.29
474 0.28
475 0.25
476 0.27
477 0.24
478 0.23
479 0.23
480 0.22
481 0.21
482 0.2
483 0.21
484 0.18
485 0.23
486 0.26
487 0.29
488 0.32
489 0.38
490 0.42
491 0.5
492 0.53
493 0.52
494 0.56
495 0.61
496 0.66
497 0.69
498 0.68
499 0.69
500 0.76
501 0.78
502 0.75
503 0.72
504 0.72
505 0.71
506 0.71
507 0.63
508 0.56
509 0.53
510 0.5
511 0.46
512 0.38
513 0.31
514 0.26
515 0.26
516 0.25
517 0.23
518 0.22
519 0.23
520 0.23
521 0.23
522 0.23
523 0.23
524 0.27
525 0.3
526 0.35
527 0.38
528 0.4
529 0.42
530 0.46
531 0.47
532 0.42
533 0.42
534 0.4
535 0.34
536 0.31
537 0.28
538 0.23
539 0.19
540 0.19
541 0.13
542 0.09
543 0.09
544 0.07
545 0.08
546 0.08
547 0.07
548 0.07
549 0.09
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.1
555 0.1
556 0.11
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.13
565 0.23
566 0.26
567 0.26
568 0.3
569 0.39
570 0.48
571 0.58
572 0.63
573 0.65
574 0.72
575 0.8
576 0.85
577 0.86
578 0.88
579 0.88
580 0.87
581 0.84
582 0.78
583 0.76
584 0.7
585 0.6
586 0.54
587 0.47
588 0.44
589 0.39
590 0.36
591 0.37
592 0.38
593 0.39
594 0.38
595 0.35
596 0.33
597 0.31
598 0.35
599 0.29
600 0.25
601 0.24
602 0.21
603 0.27
604 0.3
605 0.31
606 0.34
607 0.37
608 0.38
609 0.45
610 0.53
611 0.51
612 0.56
613 0.59
614 0.58
615 0.6
616 0.61
617 0.57
618 0.52
619 0.48
620 0.39
621 0.34
622 0.32
623 0.28
624 0.26
625 0.25
626 0.21