Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QWP4

Protein Details
Accession C4QWP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
328-378IIQQKKRLSQKESEKAKRRKIQKENVDKKLAKKQERRKRQKEKYEANGSAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-226KIKKNK
332-370KKRLSQKESEKAKRRKIQKENVDKKLAKKQERRKRQKEK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ppa:PAS_chr1-1_0291  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MANKAAPLKKDQQPVEEEDVNVPKSMIIRVGSSFHNPSLQQLSLDLRVLMQPHTAINLRERRKNCLKDYVVMCGPLGVTQLMTLSQNEKTANCHLRLASMSKGPTTTYRIKEYSLVKDIVKTLKHPKMVGKSSTIFQRPPLLVMNGFANPKVAEPHEKVMITQFQNMFPPIMPEKINVDSIRRVLMINKDKETGEINLRHYAIDTKVVDVNKNLKKILNAKIKKNKKMPNLGNIKDISEILEDSHHLGYTSESEVEDEESLVQVDETESLTKAKVIKNEGGANNIRKKAIKLVELGPRLRMELVKIEAGVCDGEVLYHRYVKKSDSEIIQQKKRLSQKESEKAKRRKIQKENVDKKLAKKQERRKRQKEKYEANGSAVPENDNSADESDEEVDLRPEDYENDSDLYSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.6
3 0.54
4 0.48
5 0.44
6 0.45
7 0.4
8 0.35
9 0.28
10 0.22
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.15
15 0.16
16 0.18
17 0.21
18 0.22
19 0.26
20 0.28
21 0.26
22 0.29
23 0.27
24 0.29
25 0.31
26 0.3
27 0.24
28 0.24
29 0.26
30 0.24
31 0.25
32 0.2
33 0.16
34 0.17
35 0.18
36 0.17
37 0.14
38 0.13
39 0.12
40 0.16
41 0.18
42 0.18
43 0.25
44 0.33
45 0.38
46 0.46
47 0.47
48 0.53
49 0.61
50 0.68
51 0.65
52 0.66
53 0.64
54 0.64
55 0.64
56 0.62
57 0.53
58 0.45
59 0.39
60 0.29
61 0.25
62 0.17
63 0.16
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.11
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.19
77 0.26
78 0.31
79 0.3
80 0.32
81 0.29
82 0.31
83 0.33
84 0.32
85 0.26
86 0.25
87 0.24
88 0.22
89 0.22
90 0.21
91 0.22
92 0.26
93 0.3
94 0.3
95 0.35
96 0.36
97 0.37
98 0.41
99 0.43
100 0.43
101 0.4
102 0.38
103 0.32
104 0.33
105 0.35
106 0.34
107 0.3
108 0.28
109 0.33
110 0.36
111 0.39
112 0.39
113 0.43
114 0.47
115 0.51
116 0.49
117 0.45
118 0.41
119 0.4
120 0.45
121 0.42
122 0.33
123 0.29
124 0.33
125 0.28
126 0.28
127 0.28
128 0.23
129 0.2
130 0.2
131 0.2
132 0.16
133 0.16
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.15
141 0.17
142 0.2
143 0.23
144 0.22
145 0.22
146 0.23
147 0.28
148 0.23
149 0.25
150 0.24
151 0.21
152 0.23
153 0.23
154 0.21
155 0.14
156 0.17
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.16
162 0.17
163 0.2
164 0.17
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.22
173 0.27
174 0.29
175 0.29
176 0.3
177 0.29
178 0.3
179 0.3
180 0.23
181 0.21
182 0.21
183 0.22
184 0.23
185 0.24
186 0.22
187 0.21
188 0.2
189 0.15
190 0.17
191 0.15
192 0.13
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.17
197 0.25
198 0.24
199 0.25
200 0.25
201 0.23
202 0.26
203 0.31
204 0.39
205 0.41
206 0.42
207 0.5
208 0.59
209 0.67
210 0.72
211 0.75
212 0.73
213 0.71
214 0.76
215 0.72
216 0.71
217 0.72
218 0.65
219 0.61
220 0.54
221 0.46
222 0.36
223 0.32
224 0.23
225 0.14
226 0.13
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.09
259 0.13
260 0.15
261 0.19
262 0.23
263 0.25
264 0.29
265 0.36
266 0.35
267 0.36
268 0.38
269 0.41
270 0.43
271 0.42
272 0.4
273 0.34
274 0.35
275 0.38
276 0.38
277 0.34
278 0.31
279 0.35
280 0.42
281 0.46
282 0.45
283 0.39
284 0.35
285 0.32
286 0.3
287 0.24
288 0.17
289 0.17
290 0.19
291 0.17
292 0.17
293 0.16
294 0.15
295 0.15
296 0.13
297 0.08
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.1
303 0.1
304 0.15
305 0.17
306 0.19
307 0.21
308 0.23
309 0.27
310 0.29
311 0.33
312 0.32
313 0.4
314 0.47
315 0.55
316 0.59
317 0.59
318 0.58
319 0.6
320 0.65
321 0.63
322 0.6
323 0.6
324 0.64
325 0.7
326 0.77
327 0.8
328 0.82
329 0.84
330 0.88
331 0.87
332 0.87
333 0.87
334 0.87
335 0.88
336 0.88
337 0.89
338 0.89
339 0.89
340 0.89
341 0.82
342 0.78
343 0.78
344 0.77
345 0.76
346 0.76
347 0.78
348 0.79
349 0.87
350 0.91
351 0.92
352 0.94
353 0.94
354 0.95
355 0.95
356 0.95
357 0.93
358 0.93
359 0.84
360 0.78
361 0.71
362 0.61
363 0.53
364 0.44
365 0.35
366 0.25
367 0.24
368 0.2
369 0.17
370 0.17
371 0.15
372 0.14
373 0.13
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.13
385 0.17
386 0.18
387 0.19
388 0.2