FuNGI

E3Q8C8

Protein Details

Accession

E3Q8C8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
149-170	FINPKIKRTEKRRSPEPDKDSP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
153-177	KIKRTEKRRSPEPDKDSPAAIRRKI

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSSAPRGGERMIHQDFIARIRYSNALPPPPNPPKLLDIPNTGLASGQYTTPGFASRLAREQPLNIEVDAELGMPLDLVGMPGIFDGDESSIQASSHPPAVHPHDRALLRPLSTLGRAKSNADASVSFLRRTEYISSVAPRKAVATGAFINPKIKRTEKRRSPEPDKDSPAAIRRKIEKSFESAERFLSNPSRHRHPSKPHVHLTSSYPLLPDHDAFPDSGAYVTVKLLTNPVASANKYDRRLLSGLLRPLDRSPEENEAFQAALEAHERDPARNPKPANLMDYSFFLPKTQTTGDNFRAKFDPENPDHDDDSLYTYQSGSNGCFQFSRLRAYETTKETELDHNSKYSEEVILAFNDELSGSKQKAAYYYPVIQRTTIRPQRAKNIARTLSHMDDETQVVNEVEVSVTDPKGAPRENMRRYKEKPIGYVEEVQDPFPSAEGGGEGAAPGTPSDRDADGDEDED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.34
3	0.34
4	0.33
5	0.36
6	0.27
7	0.24
8	0.26
9	0.3
10	0.27
11	0.33
12	0.36
13	0.38
14	0.4
15	0.42
16	0.49
17	0.55
18	0.57
19	0.51
20	0.48
21	0.45
22	0.5
23	0.55
24	0.49
25	0.47
26	0.47
27	0.49
28	0.46
29	0.4
30	0.33
31	0.26
32	0.23
33	0.18
34	0.14
35	0.11
36	0.11
37	0.12
38	0.12
39	0.14
40	0.12
41	0.17
42	0.21
43	0.22
44	0.28
45	0.3
46	0.33
47	0.33
48	0.34
49	0.34
50	0.32
51	0.31
52	0.24
53	0.22
54	0.18
55	0.18
56	0.16
57	0.11
58	0.08
59	0.06
60	0.06
61	0.05
62	0.05
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.04
71	0.04
72	0.04
73	0.04
74	0.06
75	0.06
76	0.07
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.1
82	0.1
83	0.15
84	0.15
85	0.15
86	0.2
87	0.28
88	0.34
89	0.34
90	0.35
91	0.37
92	0.38
93	0.39
94	0.39
95	0.34
96	0.28
97	0.27
98	0.26
99	0.21
100	0.24
101	0.27
102	0.23
103	0.25
104	0.26
105	0.27
106	0.29
107	0.29
108	0.26
109	0.24
110	0.23
111	0.21
112	0.28
113	0.27
114	0.23
115	0.22
116	0.22
117	0.21
118	0.23
119	0.22
120	0.17
121	0.18
122	0.2
123	0.24
124	0.27
125	0.28
126	0.25
127	0.22
128	0.21
129	0.19
130	0.18
131	0.15
132	0.14
133	0.15
134	0.18
135	0.2
136	0.2
137	0.25
138	0.24
139	0.26
140	0.28
141	0.32
142	0.37
143	0.44
144	0.55
145	0.6
146	0.67
147	0.73
148	0.78
149	0.81
150	0.82
151	0.81
152	0.78
153	0.74
154	0.67
155	0.59
156	0.52
157	0.51
158	0.47
159	0.42
160	0.38
161	0.38
162	0.42
163	0.44
164	0.46
165	0.4
166	0.39
167	0.41
168	0.42
169	0.41
170	0.36
171	0.34
172	0.3
173	0.29
174	0.26
175	0.27
176	0.25
177	0.27
178	0.31
179	0.36
180	0.41
181	0.47
182	0.53
183	0.55
184	0.62
185	0.65
186	0.69
187	0.68
188	0.65
189	0.61
190	0.55
191	0.5
192	0.44
193	0.35
194	0.28
195	0.22
196	0.18
197	0.18
198	0.17
199	0.14
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.1
204	0.11
205	0.09
206	0.08
207	0.07
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.1
220	0.09
221	0.1
222	0.12
223	0.17
224	0.21
225	0.23
226	0.25
227	0.23
228	0.25
229	0.25
230	0.24
231	0.25
232	0.24
233	0.25
234	0.25
235	0.25
236	0.22
237	0.22
238	0.25
239	0.2
240	0.17
241	0.17
242	0.22
243	0.23
244	0.22
245	0.22
246	0.19
247	0.18
248	0.16
249	0.13
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.11
256	0.12
257	0.12
258	0.19
259	0.27
260	0.29
261	0.34
262	0.34
263	0.35
264	0.41
265	0.42
266	0.39
267	0.33
268	0.31
269	0.27
270	0.28
271	0.25
272	0.19
273	0.18
274	0.14
275	0.13
276	0.11
277	0.14
278	0.14
279	0.15
280	0.18
281	0.25
282	0.31
283	0.38
284	0.38
285	0.37
286	0.37
287	0.35
288	0.34
289	0.33
290	0.35
291	0.3
292	0.35
293	0.37
294	0.39
295	0.38
296	0.35
297	0.3
298	0.23
299	0.25
300	0.19
301	0.15
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.13
306	0.13
307	0.1
308	0.16
309	0.16
310	0.16
311	0.16
312	0.18
313	0.23
314	0.23
315	0.28
316	0.23
317	0.26
318	0.27
319	0.33
320	0.38
321	0.36
322	0.38
323	0.33
324	0.33
325	0.31
326	0.35
327	0.35
328	0.33
329	0.3
330	0.27
331	0.27
332	0.26
333	0.25
334	0.21
335	0.15
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.12
341	0.11
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.08
346	0.1
347	0.13
348	0.13
349	0.16
350	0.18
351	0.18
352	0.21
353	0.23
354	0.24
355	0.26
356	0.33
357	0.37
358	0.4
359	0.4
360	0.4
361	0.41
362	0.42
363	0.47
364	0.48
365	0.5
366	0.51
367	0.56
368	0.64
369	0.7
370	0.71
371	0.68
372	0.71
373	0.68
374	0.63
375	0.63
376	0.6
377	0.53
378	0.48
379	0.4
380	0.31
381	0.27
382	0.27
383	0.23
384	0.17
385	0.14
386	0.13
387	0.12
388	0.1
389	0.09
390	0.07
391	0.06
392	0.08
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.12
397	0.14
398	0.2
399	0.22
400	0.23
401	0.32
402	0.42
403	0.51
404	0.6
405	0.65
406	0.69
407	0.72
408	0.79
409	0.77
410	0.72
411	0.68
412	0.66
413	0.66
414	0.61
415	0.63
416	0.54
417	0.54
418	0.49
419	0.44
420	0.36
421	0.31
422	0.27
423	0.2
424	0.18
425	0.1
426	0.09
427	0.09
428	0.09
429	0.07
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.09
439	0.12
440	0.12
441	0.14
442	0.17
443	0.2

E3Q8C8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer