Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3Q9S4

Protein Details
Accession E3Q9S4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-324QAERMEQQKQKKEERLREREKEFVPPEELGHKRKKRKKSDGDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-318QKQKKEERLREREKEFVPPEELGHKRKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MPSTYKKEKPWDTDDIDKWKIDAFTPADNAGGTFAEESSFAIVFPKYREVYLKEAWPLVTKALEKTGIACSLDLIEGSMTVKTTRKTFDPAAILNARDLIKLLARSVPAPQALKILEDGVACDIIKIRNLVRNKERYVKRRQRILGPNGSTLKALELLTQTYILVQGSTVSVMGPFKGLKEVRRVVEDCMANIHPIYHIKELMIKRELAKDPELANESWDRFLPNFKKKTLSQRRVPLKVTDKSKKVYTPFPPAPEKSKVDKQIETGEYFLGKEAKAKAAQAERMEQQKQKKEERLREREKEFVPPEELGHKRKKRKKSDGDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.68
3 0.62
4 0.55
5 0.48
6 0.43
7 0.38
8 0.3
9 0.3
10 0.25
11 0.26
12 0.28
13 0.28
14 0.25
15 0.24
16 0.23
17 0.17
18 0.14
19 0.1
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.11
31 0.13
32 0.19
33 0.18
34 0.2
35 0.25
36 0.27
37 0.33
38 0.35
39 0.37
40 0.33
41 0.34
42 0.33
43 0.32
44 0.29
45 0.24
46 0.23
47 0.2
48 0.19
49 0.21
50 0.21
51 0.18
52 0.19
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.17
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.11
61 0.08
62 0.06
63 0.05
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.1
69 0.12
70 0.15
71 0.17
72 0.19
73 0.24
74 0.26
75 0.3
76 0.32
77 0.31
78 0.34
79 0.33
80 0.31
81 0.26
82 0.27
83 0.22
84 0.17
85 0.17
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.15
102 0.13
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.16
116 0.19
117 0.26
118 0.32
119 0.39
120 0.41
121 0.5
122 0.56
123 0.57
124 0.66
125 0.69
126 0.68
127 0.7
128 0.7
129 0.7
130 0.72
131 0.72
132 0.69
133 0.61
134 0.59
135 0.51
136 0.49
137 0.39
138 0.3
139 0.22
140 0.15
141 0.13
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.1
165 0.12
166 0.14
167 0.21
168 0.25
169 0.25
170 0.3
171 0.31
172 0.28
173 0.32
174 0.3
175 0.23
176 0.22
177 0.21
178 0.17
179 0.16
180 0.14
181 0.09
182 0.12
183 0.15
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.19
188 0.2
189 0.24
190 0.24
191 0.22
192 0.22
193 0.29
194 0.31
195 0.27
196 0.28
197 0.26
198 0.24
199 0.27
200 0.28
201 0.21
202 0.21
203 0.21
204 0.2
205 0.18
206 0.18
207 0.16
208 0.14
209 0.22
210 0.28
211 0.35
212 0.38
213 0.39
214 0.44
215 0.47
216 0.58
217 0.61
218 0.62
219 0.61
220 0.67
221 0.74
222 0.75
223 0.73
224 0.7
225 0.67
226 0.65
227 0.66
228 0.65
229 0.6
230 0.59
231 0.6
232 0.58
233 0.53
234 0.55
235 0.52
236 0.54
237 0.54
238 0.56
239 0.59
240 0.56
241 0.58
242 0.56
243 0.55
244 0.52
245 0.55
246 0.58
247 0.57
248 0.56
249 0.53
250 0.55
251 0.53
252 0.47
253 0.39
254 0.31
255 0.26
256 0.24
257 0.23
258 0.16
259 0.13
260 0.15
261 0.17
262 0.21
263 0.22
264 0.23
265 0.27
266 0.31
267 0.37
268 0.35
269 0.38
270 0.38
271 0.44
272 0.48
273 0.48
274 0.51
275 0.55
276 0.6
277 0.64
278 0.69
279 0.72
280 0.78
281 0.83
282 0.85
283 0.86
284 0.87
285 0.83
286 0.81
287 0.73
288 0.72
289 0.65
290 0.59
291 0.53
292 0.44
293 0.42
294 0.43
295 0.46
296 0.44
297 0.51
298 0.56
299 0.62
300 0.71
301 0.79
302 0.81
303 0.87
304 0.91