Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QQD1

Protein Details
Accession E3QQD1    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MSDGPIRKACDRCHRQKLSCKRVGDEHydrophilic
36-82EECTSSPSLRYRKQNQHGSTRDLSRKRVPSPKRQRKKGGHPVAHTDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-74SRKRVPSPKRQRKKGG
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MSDGPIRKACDRCHRQKLSCKRVGDEACERCIRLKEECTSSPSLRYRKQNQHGSTRDLSRKRVPSPKRQRKKGGHPVAHTDLSIVKTQNLASVCSNTGFPDDGTVPSDAMLDIVDFDFSFGGHSAGLYQSGPNQQQPVQQAFGDSMDALMPDHGDTIAQSWSPVHSTTSDSAFTSPMAPETGFAGRAYLGSPSPYGHLSASSELQEPAPHRISKRCIRQRARQIMLRPYAGGHGSSTEEWMPRITEVNSRLFELSSDLPAQMDSSEEHGRSSMASTPDNGSSTTAPFPIDEMFKLSRHFADILAEVSPPAEVGSPASDDGSSQPARRLNSLSDPATCLFVLSTYVRLLDMYQKVFSCIHSELAQLESGKLFQSWKLPGVTVGSFAVDSTPSLQMSLTIQLAEEFLLQMRRATTSLDPALRSDSSSVGRASDTTSMFSGVVDVSFQALKRQEESLGKELKELRKAMESFLDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.87
4 0.9
5 0.9
6 0.87
7 0.8
8 0.72
9 0.72
10 0.67
11 0.65
12 0.63
13 0.57
14 0.56
15 0.54
16 0.52
17 0.46
18 0.48
19 0.43
20 0.4
21 0.42
22 0.42
23 0.47
24 0.5
25 0.51
26 0.52
27 0.5
28 0.52
29 0.54
30 0.55
31 0.56
32 0.63
33 0.67
34 0.72
35 0.8
36 0.82
37 0.8
38 0.83
39 0.8
40 0.77
41 0.74
42 0.72
43 0.71
44 0.66
45 0.66
46 0.65
47 0.67
48 0.67
49 0.71
50 0.7
51 0.72
52 0.79
53 0.83
54 0.85
55 0.88
56 0.9
57 0.91
58 0.94
59 0.93
60 0.93
61 0.9
62 0.84
63 0.82
64 0.77
65 0.68
66 0.56
67 0.46
68 0.38
69 0.31
70 0.3
71 0.22
72 0.17
73 0.17
74 0.17
75 0.21
76 0.18
77 0.19
78 0.17
79 0.19
80 0.19
81 0.19
82 0.19
83 0.15
84 0.16
85 0.14
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.15
91 0.15
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.05
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.1
117 0.15
118 0.17
119 0.18
120 0.2
121 0.21
122 0.25
123 0.29
124 0.29
125 0.26
126 0.24
127 0.23
128 0.21
129 0.2
130 0.16
131 0.11
132 0.08
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.14
155 0.15
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.12
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.16
195 0.18
196 0.19
197 0.2
198 0.24
199 0.31
200 0.37
201 0.47
202 0.51
203 0.58
204 0.63
205 0.71
206 0.77
207 0.79
208 0.76
209 0.7
210 0.66
211 0.63
212 0.59
213 0.5
214 0.39
215 0.3
216 0.26
217 0.22
218 0.17
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.09
231 0.09
232 0.13
233 0.15
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.2
238 0.18
239 0.17
240 0.16
241 0.14
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.09
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.15
264 0.16
265 0.17
266 0.16
267 0.13
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.09
278 0.13
279 0.14
280 0.14
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.16
285 0.16
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.13
308 0.13
309 0.13
310 0.17
311 0.21
312 0.22
313 0.24
314 0.26
315 0.23
316 0.29
317 0.33
318 0.31
319 0.28
320 0.29
321 0.27
322 0.27
323 0.23
324 0.17
325 0.11
326 0.1
327 0.11
328 0.09
329 0.11
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.15
336 0.18
337 0.19
338 0.21
339 0.2
340 0.23
341 0.23
342 0.23
343 0.2
344 0.18
345 0.18
346 0.17
347 0.18
348 0.16
349 0.17
350 0.18
351 0.14
352 0.13
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.15
360 0.17
361 0.2
362 0.21
363 0.21
364 0.21
365 0.24
366 0.22
367 0.18
368 0.16
369 0.14
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.11
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.14
383 0.12
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.1
389 0.09
390 0.06
391 0.08
392 0.1
393 0.1
394 0.12
395 0.12
396 0.14
397 0.14
398 0.17
399 0.18
400 0.22
401 0.28
402 0.3
403 0.29
404 0.29
405 0.33
406 0.3
407 0.29
408 0.24
409 0.21
410 0.21
411 0.23
412 0.22
413 0.18
414 0.19
415 0.18
416 0.19
417 0.21
418 0.19
419 0.19
420 0.19
421 0.19
422 0.18
423 0.18
424 0.16
425 0.11
426 0.1
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.1
432 0.15
433 0.19
434 0.22
435 0.24
436 0.25
437 0.3
438 0.34
439 0.41
440 0.43
441 0.46
442 0.44
443 0.47
444 0.52
445 0.54
446 0.54
447 0.5
448 0.45
449 0.47
450 0.48
451 0.45