FuNGI

E3QIK6

Protein Details

Accession

E3QIK6

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-49	PPQPAQPGQPRPPPIKRRPRGDPLVARKRPG	Basic
205-228	KDPNADKKPKPKEKEKDVQFHRQP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
28-66	PRPPPIKRRPRGDPLVARKRPGALRPPAPRPPLGARPSP
209-232	ADKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEK
426-444	AEEERRKEGKKTQKALIKR
522-532	LKKGKSLKRPG
546-551	RKKLKK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPPPGLPNGQNPNGQQPPQPAQPGQPRPPPIKRRPRGDPLVARKRPGALRPPAPRPPLGARPSPGAAGHHGLQRPETEDDIKARRAANGGWLDPAPQNVREFKIVTTKKALRDGVRHHVMKLSSAKADLEKRGIDPTNQEEFTRPVTLQRRDPRQPPPGREVKQEQAEPQPLDEKEAERLAQIKADREAVRAIELAKSAPSLKDPNADKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEKEKKQQELRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAPLSETTVCFVATRDGKFAAIPLEKWYKFTAKPHFNTMRLEEAEALMSKKTDVGRWYMRDKQKKSEQEEWEATRHALYGPAKIKTESSTFRAASREEKMDHDQIDMEGDEFQDDDENPGLEQDNDEEYKEANDRIRRDQLGANLFGEADERRVEKEMDELRKAEEERRKEGKKTQKALIKREKETIYQSDSSGYDPFESSSSDDDSDEEKQKEENKDKEKDDENKDKDKDADGKDKTASGVSSKGNTTPSGRQKHTDALKKGKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKLKKHAATSVHQSRSSTPSAGLKNNLGKGAMSDGEATGGEMSDGQLRKKKIKLVGSGARGTPVGSRAGSPMPATSGSKPGSPLPEGSPAPRAGSPNGPIEAWEIVDALPELPGGISIGNLMRRFQGRIGDGPGQMDRKDWIKLVKENCAYGPDKILRRKPT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.52
3	0.52
4	0.48
5	0.47
6	0.49
7	0.51
8	0.55
9	0.47
10	0.49
11	0.57
12	0.63
13	0.63
14	0.65
15	0.65
16	0.69
17	0.78
18	0.8
19	0.8
20	0.82
21	0.83
22	0.84
23	0.86
24	0.87
25	0.86
26	0.85
27	0.85
28	0.84
29	0.87
30	0.82
31	0.75
32	0.68
33	0.66
34	0.61
35	0.59
36	0.57
37	0.55
38	0.61
39	0.66
40	0.72
41	0.74
42	0.72
43	0.66
44	0.62
45	0.61
46	0.61
47	0.58
48	0.56
49	0.5
50	0.5
51	0.5
52	0.46
53	0.4
54	0.32
55	0.3
56	0.28
57	0.28
58	0.29
59	0.3
60	0.29
61	0.29
62	0.28
63	0.29
64	0.27
65	0.28
66	0.25
67	0.25
68	0.31
69	0.34
70	0.35
71	0.35
72	0.33
73	0.32
74	0.31
75	0.29
76	0.31
77	0.31
78	0.29
79	0.28
80	0.27
81	0.27
82	0.26
83	0.29
84	0.24
85	0.22
86	0.24
87	0.25
88	0.28
89	0.29
90	0.29
91	0.27
92	0.35
93	0.35
94	0.36
95	0.42
96	0.44
97	0.46
98	0.52
99	0.55
100	0.5
101	0.56
102	0.58
103	0.59
104	0.62
105	0.58
106	0.52
107	0.51
108	0.46
109	0.44
110	0.42
111	0.35
112	0.28
113	0.28
114	0.28
115	0.29
116	0.33
117	0.31
118	0.3
119	0.28
120	0.27
121	0.33
122	0.33
123	0.29
124	0.29
125	0.32
126	0.36
127	0.35
128	0.34
129	0.3
130	0.31
131	0.33
132	0.3
133	0.24
134	0.25
135	0.33
136	0.37
137	0.45
138	0.51
139	0.57
140	0.61
141	0.68
142	0.69
143	0.71
144	0.74
145	0.71
146	0.71
147	0.72
148	0.68
149	0.69
150	0.66
151	0.63
152	0.61
153	0.58
154	0.52
155	0.5
156	0.52
157	0.45
158	0.4
159	0.39
160	0.32
161	0.33
162	0.31
163	0.25
164	0.22
165	0.24
166	0.22
167	0.17
168	0.2
169	0.16
170	0.19
171	0.19
172	0.18
173	0.18
174	0.24
175	0.24
176	0.23
177	0.25
178	0.21
179	0.21
180	0.19
181	0.18
182	0.13
183	0.13
184	0.12
185	0.1
186	0.11
187	0.11
188	0.1
189	0.13
190	0.15
191	0.16
192	0.23
193	0.27
194	0.35
195	0.44
196	0.51
197	0.53
198	0.59
199	0.69
200	0.72
201	0.76
202	0.77
203	0.77
204	0.8
205	0.85
206	0.83
207	0.82
208	0.79
209	0.82
210	0.79
211	0.79
212	0.75
213	0.72
214	0.67
215	0.65
216	0.69
217	0.68
218	0.69
219	0.7
220	0.74
221	0.73
222	0.79
223	0.76
224	0.74
225	0.71
226	0.66
227	0.6
228	0.51
229	0.45
230	0.38
231	0.34
232	0.26
233	0.19
234	0.16
235	0.12
236	0.1
237	0.11
238	0.12
239	0.13
240	0.13
241	0.12
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.11
246	0.09
247	0.06
248	0.08
249	0.08
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.12
262	0.14
263	0.15
264	0.15
265	0.15
266	0.16
267	0.15
268	0.16
269	0.15
270	0.13
271	0.13
272	0.16
273	0.23
274	0.23
275	0.25
276	0.26
277	0.25
278	0.27
279	0.34
280	0.39
281	0.4
282	0.42
283	0.5
284	0.53
285	0.51
286	0.51
287	0.47
288	0.42
289	0.34
290	0.32
291	0.24
292	0.19
293	0.17
294	0.15
295	0.13
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.09
300	0.09
301	0.11
302	0.11
303	0.16
304	0.21
305	0.25
306	0.3
307	0.36
308	0.44
309	0.51
310	0.52
311	0.56
312	0.59
313	0.64
314	0.66
315	0.67
316	0.63
317	0.6
318	0.62
319	0.56
320	0.48
321	0.41
322	0.34
323	0.25
324	0.21
325	0.14
326	0.14
327	0.12
328	0.16
329	0.18
330	0.2
331	0.2
332	0.21
333	0.21
334	0.19
335	0.22
336	0.19
337	0.19
338	0.22
339	0.22
340	0.23
341	0.24
342	0.23
343	0.23
344	0.23
345	0.23
346	0.19
347	0.22
348	0.24
349	0.26
350	0.25
351	0.22
352	0.19
353	0.16
354	0.16
355	0.12
356	0.09
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.09
377	0.08
378	0.1
379	0.11
380	0.11
381	0.13
382	0.17
383	0.2
384	0.24
385	0.29
386	0.29
387	0.3
388	0.31
389	0.32
390	0.31
391	0.3
392	0.25
393	0.2
394	0.19
395	0.16
396	0.15
397	0.1
398	0.07
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.1
403	0.11
404	0.1
405	0.17
406	0.22
407	0.25
408	0.27
409	0.26
410	0.26
411	0.29
412	0.3
413	0.3
414	0.3
415	0.3
416	0.36
417	0.44
418	0.46
419	0.47
420	0.55
421	0.58
422	0.61
423	0.62
424	0.62
425	0.6
426	0.63
427	0.7
428	0.72
429	0.68
430	0.62
431	0.63
432	0.58
433	0.55
434	0.53
435	0.47
436	0.42
437	0.35
438	0.33
439	0.28
440	0.26
441	0.25
442	0.2
443	0.17
444	0.12
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.1
450	0.11
451	0.12
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.14
456	0.17
457	0.21
458	0.2
459	0.19
460	0.21
461	0.27
462	0.34
463	0.4
464	0.44
465	0.47
466	0.54
467	0.55
468	0.58
469	0.6
470	0.6
471	0.61
472	0.63
473	0.61
474	0.63
475	0.62
476	0.58
477	0.52
478	0.49
479	0.48
480	0.43
481	0.46
482	0.4
483	0.41
484	0.39
485	0.38
486	0.34
487	0.28
488	0.23
489	0.15
490	0.17
491	0.16
492	0.18
493	0.18
494	0.19
495	0.2
496	0.21
497	0.23
498	0.27
499	0.35
500	0.41
501	0.42
502	0.43
503	0.45
504	0.51
505	0.55
506	0.56
507	0.54
508	0.56
509	0.59
510	0.62
511	0.69
512	0.66
513	0.67
514	0.68
515	0.69
516	0.68
517	0.71
518	0.71
519	0.71
520	0.68
521	0.61
522	0.54
523	0.48
524	0.41
525	0.34
526	0.36
527	0.29
528	0.28
529	0.29
530	0.28
531	0.31
532	0.4
533	0.45
534	0.4
535	0.47
536	0.56
537	0.62
538	0.68
539	0.73
540	0.72
541	0.7
542	0.77
543	0.77
544	0.72
545	0.63
546	0.56
547	0.49
548	0.46
549	0.44
550	0.35
551	0.27
552	0.29
553	0.32
554	0.35
555	0.34
556	0.35
557	0.38
558	0.39
559	0.38
560	0.31
561	0.26
562	0.23
563	0.24
564	0.19
565	0.14
566	0.12
567	0.11
568	0.11
569	0.11
570	0.11
571	0.07
572	0.07
573	0.06
574	0.05
575	0.06
576	0.11
577	0.13
578	0.16
579	0.22
580	0.26
581	0.33
582	0.37
583	0.44
584	0.46
585	0.52
586	0.56
587	0.6
588	0.65
589	0.64
590	0.64
591	0.57
592	0.5
593	0.42
594	0.35
595	0.27
596	0.21
597	0.18
598	0.14
599	0.15
600	0.16
601	0.18
602	0.19
603	0.18
604	0.16
605	0.16
606	0.18
607	0.21
608	0.2
609	0.25
610	0.25
611	0.26
612	0.27
613	0.29
614	0.31
615	0.29
616	0.3
617	0.27
618	0.33
619	0.33
620	0.33
621	0.34
622	0.31
623	0.32
624	0.32
625	0.31
626	0.27
627	0.32
628	0.33
629	0.33
630	0.33
631	0.29
632	0.27
633	0.27
634	0.25
635	0.19
636	0.16
637	0.12
638	0.1
639	0.11
640	0.11
641	0.08
642	0.07
643	0.06
644	0.06
645	0.05
646	0.06
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.06
651	0.09
652	0.14
653	0.15
654	0.16
655	0.2
656	0.23
657	0.26
658	0.27
659	0.31
660	0.3
661	0.33
662	0.39
663	0.4
664	0.38
665	0.38
666	0.4
667	0.37
668	0.33
669	0.3
670	0.27
671	0.25
672	0.27
673	0.28
674	0.31
675	0.35
676	0.42
677	0.46
678	0.53
679	0.53
680	0.53
681	0.51
682	0.5
683	0.45
684	0.39
685	0.42
686	0.4
687	0.45
688	0.52

E3QIK6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer