FuNGI

Q2GTS6

Protein Details

Accession

Q2GTS6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-24	GAEQKARRRKEQLVDQVPKRFKS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

MGAEQKARRRKEQLVDQVPKRFKSLKFGVQSHQDIVSQGVLEVSDNLLYDVENRRAAFPHGPLDPRLKKIAPESKVEFDASFNQAKKYTPELEKHTRKAMEDLNPLKVLNLFRAISQTDCELLGLDPSEGRPDMFLWQYLPAPPICIRPSVAQENASNEDDITSKLSEIILYAGHLRESLKKGVALPVIMEQWEFLQLQVGMYVNSDVPGLYQPGFGKPIRGFCQRLKGKQGRFRGNLSGKRVDFSGRTVISPDPNLSIEQVAVPELVAKNLTYPERVNHANIEKLRERVITGPNIWPGAQGIIKKDGAKYNLKIGNESLREKHANNLEHGDVVERHLEDNDVVLFNRQPSLHKLSIMSHLAKIRPWRTFRLNECVCTPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARAEAINLMGVKHNLVTPKNGEPIIAATQDFITAAYLLSSKDIFFDRASFTYVCTQMLLGDTHLELPPPAIIKPRALWTGKQIFNVLMRPNKESPVLVNLEAKNKVFFKKKDGQIPDMDIDDAFLVVRNSEVMCGRMDKATVGGGKKNSVFYVILRDFGPDHAAVAMNRLSKLCARTLSLRGFSIGVGDVWPSGSLTSHKAQLVEDAYNKCDDLIETYRQGKLEKAPGCNLEETLENSISGILSKVRQQAGNYCVGNLSKNNAPLIMAKSGSKGSDINVAQMVACVGQQIIGGKRVPDGFQDRSLPHFHKNARQPPSKGFVRNSFYTGLVPTEFLFHAISGREGLVDTAVKTAETGYMSRRLMKSLEDLSTQYDDTVRTSEGGIVQFQYGADRLDPVDMEGDAKPVDFTRTWNHAQSITWSNSDTSLLPWEIQKLSKAILDEERSKYVRRHLVTNEEIKYDDETIRESMEHDVLIAIDEHESARVYLNTIRDYVMERAVKLAKVRKSVGLDPCIPDDKRMKEEVDGWKPAVAEGSEMDVDAHGEPCQPLEYVLRDLRREINEEDDLDETARQARIQAKAQDHVNRVAKVSERTLRQFIQMCLHKYKKARVEPGHAVGAVGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVAGMSITQGVPRIKEIINASKTISTPVISCELENRVDIKAARVVKGRIEKTYVSDIISFVDDEWLPDVAKIVLQVDLQALSDMQLGISMKDIADAIVRAKKLKLKVEPEDLRIGRDRVEVIVRNTWQDVTAARKAARVRAAAVEKGHIMSSALDESAADFQLRVNFLKRMLPQVVISGYPDAARAIIQTDDKNEHMVLVEGYGLRACMTTEGVIGTKCVTNSVMRKCRDVLGIRGGRAPPFATRNRGCHAPR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.83
3	0.82
4	0.84
5	0.81
6	0.73
7	0.68
8	0.64
9	0.56
10	0.56
11	0.58
12	0.57
13	0.6
14	0.63
15	0.63
16	0.65
17	0.66
18	0.59
19	0.52
20	0.43
21	0.35
22	0.32
23	0.27
24	0.19
25	0.15
26	0.12
27	0.1
28	0.1
29	0.1
30	0.09
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.08
35	0.08
36	0.12
37	0.17
38	0.21
39	0.24
40	0.25
41	0.27
42	0.28
43	0.33
44	0.34
45	0.31
46	0.33
47	0.34
48	0.36
49	0.38
50	0.46
51	0.47
52	0.47
53	0.5
54	0.45
55	0.44
56	0.51
57	0.57
58	0.5
59	0.53
60	0.54
61	0.53
62	0.54
63	0.52
64	0.42
65	0.35
66	0.37
67	0.34
68	0.34
69	0.31
70	0.31
71	0.31
72	0.33
73	0.34
74	0.35
75	0.39
76	0.39
77	0.45
78	0.51
79	0.6
80	0.68
81	0.68
82	0.7
83	0.65
84	0.6
85	0.59
86	0.58
87	0.55
88	0.56
89	0.55
90	0.52
91	0.5
92	0.48
93	0.42
94	0.39
95	0.32
96	0.25
97	0.27
98	0.22
99	0.21
100	0.25
101	0.25
102	0.23
103	0.23
104	0.21
105	0.17
106	0.16
107	0.16
108	0.13
109	0.12
110	0.12
111	0.11
112	0.1
113	0.09
114	0.1
115	0.13
116	0.12
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.16
121	0.17
122	0.17
123	0.15
124	0.17
125	0.19
126	0.2
127	0.21
128	0.17
129	0.19
130	0.2
131	0.25
132	0.24
133	0.25
134	0.25
135	0.27
136	0.34
137	0.36
138	0.37
139	0.35
140	0.36
141	0.39
142	0.41
143	0.38
144	0.32
145	0.25
146	0.23
147	0.2
148	0.19
149	0.16
150	0.12
151	0.11
152	0.11
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.07
158	0.08
159	0.1
160	0.1
161	0.1
162	0.11
163	0.12
164	0.18
165	0.21
166	0.25
167	0.24
168	0.26
169	0.27
170	0.32
171	0.32
172	0.26
173	0.23
174	0.22
175	0.21
176	0.19
177	0.18
178	0.12
179	0.11
180	0.13
181	0.12
182	0.09
183	0.11
184	0.11
185	0.11
186	0.12
187	0.12
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.06
195	0.07
196	0.08
197	0.1
198	0.1
199	0.12
200	0.13
201	0.16
202	0.2
203	0.19
204	0.23
205	0.24
206	0.31
207	0.34
208	0.4
209	0.42
210	0.42
211	0.53
212	0.55
213	0.59
214	0.62
215	0.65
216	0.68
217	0.71
218	0.77
219	0.76
220	0.72
221	0.7
222	0.7
223	0.7
224	0.68
225	0.66
226	0.65
227	0.55
228	0.53
229	0.49
230	0.42
231	0.34
232	0.3
233	0.32
234	0.24
235	0.24
236	0.25
237	0.26
238	0.26
239	0.27
240	0.25
241	0.19
242	0.19
243	0.19
244	0.18
245	0.16
246	0.13
247	0.12
248	0.11
249	0.09
250	0.08
251	0.07
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.1
258	0.14
259	0.15
260	0.15
261	0.16
262	0.18
263	0.22
264	0.25
265	0.25
266	0.28
267	0.29
268	0.34
269	0.34
270	0.39
271	0.37
272	0.36
273	0.37
274	0.32
275	0.3
276	0.29
277	0.32
278	0.3
279	0.29
280	0.31
281	0.31
282	0.31
283	0.29
284	0.24
285	0.2
286	0.17
287	0.17
288	0.15
289	0.16
290	0.19
291	0.21
292	0.22
293	0.24
294	0.27
295	0.29
296	0.34
297	0.33
298	0.38
299	0.4
300	0.39
301	0.37
302	0.35
303	0.38
304	0.36
305	0.38
306	0.31
307	0.32
308	0.35
309	0.34
310	0.39
311	0.38
312	0.36
313	0.35
314	0.36
315	0.31
316	0.29
317	0.28
318	0.24
319	0.17
320	0.16
321	0.16
322	0.13
323	0.13
324	0.12
325	0.13
326	0.1
327	0.11
328	0.11
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.1
333	0.1
334	0.13
335	0.13
336	0.14
337	0.19
338	0.26
339	0.26
340	0.27
341	0.28
342	0.28
343	0.33
344	0.35
345	0.31
346	0.26
347	0.28
348	0.28
349	0.29
350	0.34
351	0.33
352	0.36
353	0.39
354	0.42
355	0.46
356	0.53
357	0.55
358	0.58
359	0.56
360	0.51
361	0.5
362	0.46
363	0.39
364	0.34
365	0.31
366	0.23
367	0.22
368	0.2
369	0.18
370	0.14
371	0.15
372	0.14
373	0.12
374	0.09
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.07
380	0.06
381	0.07
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.1
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.1
399	0.12
400	0.13
401	0.15
402	0.18
403	0.21
404	0.24
405	0.23
406	0.22
407	0.18
408	0.2
409	0.2
410	0.17
411	0.14
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.1
416	0.08
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.07
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.13
432	0.14
433	0.17
434	0.15
435	0.16
436	0.19
437	0.19
438	0.17
439	0.15
440	0.14
441	0.12
442	0.13
443	0.12
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.09
448	0.09
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.11
456	0.12
457	0.14
458	0.16
459	0.19
460	0.23
461	0.24
462	0.24
463	0.28
464	0.36
465	0.37
466	0.36
467	0.33
468	0.29
469	0.29
470	0.32
471	0.29
472	0.24
473	0.23
474	0.27
475	0.28
476	0.28
477	0.27
478	0.23
479	0.21
480	0.21
481	0.22
482	0.18
483	0.22
484	0.22
485	0.25
486	0.26
487	0.25
488	0.22
489	0.22
490	0.26
491	0.29
492	0.29
493	0.33
494	0.41
495	0.46
496	0.52
497	0.55
498	0.54
499	0.48
500	0.5
501	0.43
502	0.34
503	0.29
504	0.2
505	0.16
506	0.12
507	0.09
508	0.05
509	0.05
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.06
516	0.06
517	0.07
518	0.07
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.09
524	0.09
525	0.1
526	0.13
527	0.13
528	0.15
529	0.15
530	0.17
531	0.18
532	0.19
533	0.16
534	0.15
535	0.15
536	0.12
537	0.2
538	0.18
539	0.18
540	0.17
541	0.18
542	0.16
543	0.16
544	0.17
545	0.08
546	0.08
547	0.07
548	0.08
549	0.07
550	0.09
551	0.11
552	0.1
553	0.1
554	0.1
555	0.11
556	0.12
557	0.14
558	0.14
559	0.13
560	0.15
561	0.18
562	0.23
563	0.26
564	0.25
565	0.23
566	0.22
567	0.21
568	0.19
569	0.15
570	0.11
571	0.07
572	0.06
573	0.06
574	0.05
575	0.04
576	0.05
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.05
581	0.09
582	0.1
583	0.13
584	0.13
585	0.14
586	0.14
587	0.16
588	0.17
589	0.15
590	0.18
591	0.16
592	0.16
593	0.16
594	0.16
595	0.13
596	0.11
597	0.1
598	0.1
599	0.13
600	0.14
601	0.16
602	0.18
603	0.19
604	0.2
605	0.2
606	0.17
607	0.17
608	0.23
609	0.24
610	0.25
611	0.26
612	0.27
613	0.29
614	0.27
615	0.24
616	0.17
617	0.14
618	0.13
619	0.13
620	0.11
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.08
625	0.07
626	0.06
627	0.04
628	0.05
629	0.08
630	0.12
631	0.13
632	0.15
633	0.15
634	0.2
635	0.22
636	0.27
637	0.24
638	0.2
639	0.2
640	0.19
641	0.2
642	0.15
643	0.15
644	0.11
645	0.12
646	0.12
647	0.11
648	0.12
649	0.13
650	0.15
651	0.13
652	0.12
653	0.11
654	0.12
655	0.13
656	0.12
657	0.11
658	0.09
659	0.08
660	0.15
661	0.15
662	0.15
663	0.14
664	0.14
665	0.13
666	0.12
667	0.12
668	0.05
669	0.05
670	0.04
671	0.03
672	0.03
673	0.04
674	0.05
675	0.06
676	0.08
677	0.09
678	0.09
679	0.11
680	0.11
681	0.11
682	0.13
683	0.18
684	0.17
685	0.2
686	0.23
687	0.22
688	0.24
689	0.27
690	0.26
691	0.25
692	0.28
693	0.29
694	0.33
695	0.41
696	0.47
697	0.52
698	0.56
699	0.55
700	0.53
701	0.57
702	0.54
703	0.5
704	0.45
705	0.44
706	0.42
707	0.41
708	0.4
709	0.34
710	0.29
711	0.26
712	0.23
713	0.16
714	0.12
715	0.11
716	0.09
717	0.09
718	0.08
719	0.09
720	0.08
721	0.07
722	0.08
723	0.08
724	0.08
725	0.07
726	0.07
727	0.06
728	0.06
729	0.06
730	0.05
731	0.05
732	0.05
733	0.06
734	0.06
735	0.05
736	0.05
737	0.06
738	0.06
739	0.07
740	0.07
741	0.09
742	0.15
743	0.15
744	0.19
745	0.19
746	0.19
747	0.19
748	0.2
749	0.22
750	0.19
751	0.2
752	0.18
753	0.18
754	0.19
755	0.19
756	0.18
757	0.14
758	0.12
759	0.11
760	0.1
761	0.11
762	0.09
763	0.08
764	0.09
765	0.09
766	0.1
767	0.11
768	0.1
769	0.1
770	0.09
771	0.09
772	0.08
773	0.08
774	0.07
775	0.06
776	0.06
777	0.06
778	0.06
779	0.07
780	0.07
781	0.06
782	0.07
783	0.06
784	0.08
785	0.07
786	0.08
787	0.07
788	0.07
789	0.07
790	0.07
791	0.1
792	0.08
793	0.11
794	0.15
795	0.21
796	0.24
797	0.26
798	0.27
799	0.25
800	0.25
801	0.27
802	0.28
803	0.24
804	0.23
805	0.21
806	0.2
807	0.19
808	0.2
809	0.16
810	0.11
811	0.11
812	0.11
813	0.11
814	0.11
815	0.13
816	0.13
817	0.14
818	0.14
819	0.12
820	0.13
821	0.14
822	0.14
823	0.14
824	0.17
825	0.2
826	0.24
827	0.26
828	0.3
829	0.3
830	0.31
831	0.31
832	0.34
833	0.38
834	0.34
835	0.37
836	0.36
837	0.43
838	0.46
839	0.51
840	0.45
841	0.38
842	0.37
843	0.32
844	0.3
845	0.24
846	0.2
847	0.13
848	0.14
849	0.14
850	0.13
851	0.13
852	0.12
853	0.12
854	0.11
855	0.11
856	0.09
857	0.08
858	0.07
859	0.08
860	0.07
861	0.05
862	0.05
863	0.05
864	0.05
865	0.05
866	0.06
867	0.06
868	0.07
869	0.07
870	0.08
871	0.11
872	0.14
873	0.15
874	0.15
875	0.15
876	0.14
877	0.18
878	0.18
879	0.21
880	0.19
881	0.18
882	0.21
883	0.22
884	0.23
885	0.24
886	0.3
887	0.28
888	0.32
889	0.34
890	0.35
891	0.38
892	0.43
893	0.45
894	0.43
895	0.41
896	0.38
897	0.39
898	0.4
899	0.35
900	0.33
901	0.33
902	0.32
903	0.34
904	0.35
905	0.33
906	0.29
907	0.37
908	0.42
909	0.42
910	0.4
911	0.36
912	0.35
913	0.34
914	0.32
915	0.26
916	0.17
917	0.11
918	0.09
919	0.11
920	0.09
921	0.09
922	0.09
923	0.07
924	0.08
925	0.08
926	0.08
927	0.06
928	0.07
929	0.07
930	0.08
931	0.09
932	0.08
933	0.08
934	0.1
935	0.13
936	0.17
937	0.21
938	0.24
939	0.24
940	0.26
941	0.31
942	0.31
943	0.33
944	0.29
945	0.3
946	0.29
947	0.29
948	0.28
949	0.23
950	0.21
951	0.18
952	0.16
953	0.11
954	0.12
955	0.12
956	0.1
957	0.13
958	0.17
959	0.21
960	0.27
961	0.33
962	0.34
963	0.37
964	0.44
965	0.47
966	0.45
967	0.49
968	0.48
969	0.42
970	0.4
971	0.38
972	0.36
973	0.32
974	0.35
975	0.33
976	0.32
977	0.36
978	0.4
979	0.38
980	0.4
981	0.41
982	0.37
983	0.4
984	0.41
985	0.42
986	0.46
987	0.48
988	0.49
989	0.49
990	0.55
991	0.56
992	0.59
993	0.64
994	0.61
995	0.66
996	0.67
997	0.66
998	0.61
999	0.51
1000	0.42
1001	0.32
1002	0.27
1003	0.18
1004	0.11
1005	0.07
1006	0.04
1007	0.04
1008	0.04
1009	0.05
1010	0.04
1011	0.04
1012	0.04
1013	0.07
1014	0.07
1015	0.07
1016	0.09
1017	0.12
1018	0.12
1019	0.14
1020	0.15
1021	0.13
1022	0.13
1023	0.13
1024	0.12
1025	0.09
1026	0.09
1027	0.07
1028	0.07
1029	0.06
1030	0.06
1031	0.06
1032	0.05
1033	0.09
1034	0.1
1035	0.11
1036	0.12
1037	0.16
1038	0.16
1039	0.21
1040	0.26
1041	0.31
1042	0.33
1043	0.33
1044	0.33
1045	0.32
1046	0.32
1047	0.3
1048	0.26
1049	0.18
1050	0.16
1051	0.17
1052	0.2
1053	0.18
1054	0.18
1055	0.18
1056	0.2
1057	0.21
1058	0.21
1059	0.2
1060	0.16
1061	0.19
1062	0.19
1063	0.19
1064	0.22
1065	0.23
1066	0.25
1067	0.29
1068	0.29
1069	0.33
1070	0.42
1071	0.42
1072	0.39
1073	0.41
1074	0.38
1075	0.38
1076	0.44
1077	0.38
1078	0.31
1079	0.29
1080	0.26
1081	0.23
1082	0.23
1083	0.18
1084	0.11
1085	0.13
1086	0.11
1087	0.11
1088	0.12
1089	0.12
1090	0.11
1091	0.11
1092	0.12
1093	0.09
1094	0.09
1095	0.09
1096	0.09
1097	0.09
1098	0.09
1099	0.1
1100	0.1
1101	0.1
1102	0.1
1103	0.09
1104	0.08
1105	0.07
1106	0.08
1107	0.08
1108	0.06
1109	0.08
1110	0.08
1111	0.08
1112	0.1
1113	0.09
1114	0.08
1115	0.09
1116	0.09
1117	0.07
1118	0.09
1119	0.09
1120	0.12
1121	0.16
1122	0.17
1123	0.18
1124	0.22
1125	0.28
1126	0.33
1127	0.41
1128	0.46
1129	0.5
1130	0.56
1131	0.65
1132	0.67
1133	0.65
1134	0.68
1135	0.6
1136	0.55
1137	0.52
1138	0.45
1139	0.37
1140	0.34
1141	0.3
1142	0.24
1143	0.3
1144	0.3
1145	0.29
1146	0.35
1147	0.34
1148	0.35
1149	0.35
1150	0.32
1151	0.27
1152	0.23
1153	0.22
1154	0.22
1155	0.25
1156	0.28
1157	0.27
1158	0.31
1159	0.33
1160	0.38
1161	0.41
1162	0.36
1163	0.34
1164	0.37
1165	0.41
1166	0.41
1167	0.4
1168	0.36
1169	0.31
1170	0.3
1171	0.28
1172	0.2
1173	0.16
1174	0.13
1175	0.14
1176	0.13
1177	0.11
1178	0.1
1179	0.1
1180	0.11
1181	0.12
1182	0.12
1183	0.1
1184	0.09
1185	0.1
1186	0.15
1187	0.17
1188	0.18
1189	0.2
1190	0.21
1191	0.23
1192	0.3
1193	0.31
1194	0.34
1195	0.34
1196	0.34
1197	0.31
1198	0.33
1199	0.33
1200	0.27
1201	0.26
1202	0.2
1203	0.18
1204	0.16
1205	0.16
1206	0.12
1207	0.11
1208	0.1
1209	0.09
1210	0.09
1211	0.12
1212	0.15
1213	0.17
1214	0.21
1215	0.25
1216	0.26
1217	0.28
1218	0.26
1219	0.23
1220	0.2
1221	0.2
1222	0.15
1223	0.11
1224	0.13
1225	0.1
1226	0.11
1227	0.1
1228	0.1
1229	0.09
1230	0.08
1231	0.08
1232	0.08
1233	0.09
1234	0.09
1235	0.1
1236	0.11
1237	0.13
1238	0.13
1239	0.13
1240	0.14
1241	0.14
1242	0.14
1243	0.15
1244	0.15
1245	0.21
1246	0.29
1247	0.39
1248	0.46
1249	0.46
1250	0.51
1251	0.51
1252	0.54
1253	0.55
1254	0.52
1255	0.47
1256	0.5
1257	0.53
1258	0.5
1259	0.53
1260	0.51
1261	0.44
1262	0.41
1263	0.36
1264	0.32
1265	0.34
1266	0.39
1267	0.43
1268	0.47
1269	0.52
1270	0.55

Q2GTS6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer