Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QCG8

Protein Details
Accession E3QCG8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-244IGTGGKTKRERERKTKQLLDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-109GKTTEEPARGGPRGGYGARARGGRGGRFPRER
253-305RPRGGDRGGPRGGARGGARGGARGGDRGGRGRGDGPRGGAPRAGGAPRGGRRE
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 12.5, nucl 6, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLFELLGNDAEDDTPQAPVKTVDKTTMRSTKRGVEPEAPTRAAGNTGARRTNVSGNEAAFRDRGAGSDRNRGKTTEEPARGGPRGGYGARARGGRGGRFPRERDDRQPKNIVSGSEKQAAQSWGATEGEAERKDEVAGEAIAQAEAKDAEAEAAAPVEPEEPEEKHISYADYLAQQAEKKLALESGSEIRKANEGTKLKKEWANAKEVTRDDDDTFMIGTGGKTKRERERKTKQLLDIDQRYVEPERPRGGDRGGPRGGARGGARGGARGGDRGGRGRGDGPRGGAPRAGGAPRGGRREGGAQINTKDESAFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.11
7 0.11
8 0.13
9 0.12
10 0.13
11 0.16
12 0.19
13 0.22
14 0.24
15 0.29
16 0.32
17 0.36
18 0.44
19 0.5
20 0.5
21 0.5
22 0.52
23 0.54
24 0.57
25 0.59
26 0.55
27 0.54
28 0.56
29 0.59
30 0.61
31 0.53
32 0.45
33 0.4
34 0.35
35 0.29
36 0.25
37 0.25
38 0.25
39 0.29
40 0.32
41 0.32
42 0.34
43 0.35
44 0.39
45 0.34
46 0.32
47 0.3
48 0.28
49 0.31
50 0.29
51 0.27
52 0.21
53 0.19
54 0.17
55 0.14
56 0.14
57 0.15
58 0.21
59 0.23
60 0.33
61 0.38
62 0.41
63 0.43
64 0.43
65 0.42
66 0.42
67 0.46
68 0.46
69 0.43
70 0.4
71 0.43
72 0.47
73 0.43
74 0.38
75 0.31
76 0.22
77 0.23
78 0.2
79 0.22
80 0.18
81 0.21
82 0.23
83 0.23
84 0.22
85 0.24
86 0.27
87 0.24
88 0.3
89 0.34
90 0.38
91 0.44
92 0.46
93 0.49
94 0.54
95 0.57
96 0.59
97 0.63
98 0.63
99 0.64
100 0.69
101 0.61
102 0.59
103 0.56
104 0.47
105 0.42
106 0.4
107 0.38
108 0.35
109 0.35
110 0.29
111 0.3
112 0.29
113 0.24
114 0.19
115 0.15
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.08
120 0.09
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.09
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.14
179 0.15
180 0.15
181 0.16
182 0.15
183 0.17
184 0.18
185 0.18
186 0.21
187 0.25
188 0.29
189 0.35
190 0.37
191 0.39
192 0.4
193 0.42
194 0.43
195 0.4
196 0.42
197 0.39
198 0.39
199 0.41
200 0.39
201 0.39
202 0.32
203 0.32
204 0.26
205 0.24
206 0.22
207 0.16
208 0.16
209 0.12
210 0.09
211 0.07
212 0.07
213 0.12
214 0.14
215 0.19
216 0.21
217 0.28
218 0.38
219 0.48
220 0.57
221 0.6
222 0.69
223 0.75
224 0.82
225 0.83
226 0.79
227 0.78
228 0.76
229 0.75
230 0.7
231 0.62
232 0.53
233 0.45
234 0.42
235 0.35
236 0.34
237 0.29
238 0.29
239 0.31
240 0.33
241 0.35
242 0.35
243 0.36
244 0.36
245 0.35
246 0.39
247 0.36
248 0.34
249 0.32
250 0.33
251 0.3
252 0.28
253 0.25
254 0.2
255 0.19
256 0.21
257 0.21
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.17
262 0.14
263 0.15
264 0.16
265 0.18
266 0.21
267 0.23
268 0.21
269 0.22
270 0.26
271 0.3
272 0.32
273 0.32
274 0.31
275 0.35
276 0.37
277 0.37
278 0.33
279 0.28
280 0.26
281 0.28
282 0.26
283 0.21
284 0.22
285 0.29
286 0.33
287 0.38
288 0.36
289 0.33
290 0.34
291 0.37
292 0.4
293 0.4
294 0.39
295 0.39
296 0.39
297 0.43
298 0.41
299 0.36
300 0.31
301 0.24
302 0.24
303 0.23
304 0.21