Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QRW3

Protein Details
Accession E3QRW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
507-527EQPRETSRDRADRKRDELQKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
444-475PSSPRKGVLGRIGGESARSKSPEPPKRTGLGR
519-543RKRDELQKDLQRKAAAGPARKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 11mito 11mito_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MTNLPVWRQLPVSSSTGLPNLLVSTSFSTTSYTIHLTDLANIWVESLDRKAIYKRSLNESTSIDPTDSDSNMRTFLSKIRSVFEPSHQDHAKASLSVSTIPSKEAGAGGLTLSIVCKLENTKPLEWPMYLQKCPQSQLAYELVVPLAQAHTTGRRQIGSLKDIIRQKDAIITKLLDKLEATGTRLENVFTVLSAKQKPTRKMAEDKVKGLAPFRPEDWMSQLDEHQEDMSSLLQYVFGADGLEYHQNPDVHNTASLDDWWIKLQSPSIPIVGTTSSSRLNQSGMSSTDPRQLESKGSEAKDAEVAAEDDDDDFQVQSTPPHLMSTRKRFVNPLPAEDGDGTTKDGDTPPIPDSVPVPPLDNNARPSRLGTIGKRHQPMPTRTSSPPQALELEDSETETVSDEDAAASLAEESSPPQRAGSMSDTKDPKKGLDLIRDNAGGSKAPSSPRKGVLGRIGGESARSKSPEPPKRTGLGRIGGGARPVTTPEPTAIAAEERGRSRVNTTLHEQPRETSRDRADRKRDELQKDLQRKAAAGPARKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.24
4 0.23
5 0.2
6 0.16
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.14
12 0.15
13 0.16
14 0.16
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.19
19 0.18
20 0.17
21 0.17
22 0.19
23 0.17
24 0.19
25 0.19
26 0.17
27 0.16
28 0.15
29 0.14
30 0.12
31 0.12
32 0.11
33 0.11
34 0.13
35 0.13
36 0.16
37 0.21
38 0.27
39 0.34
40 0.4
41 0.44
42 0.49
43 0.56
44 0.55
45 0.54
46 0.51
47 0.48
48 0.45
49 0.4
50 0.32
51 0.25
52 0.26
53 0.25
54 0.22
55 0.2
56 0.18
57 0.18
58 0.19
59 0.19
60 0.17
61 0.15
62 0.2
63 0.25
64 0.28
65 0.28
66 0.3
67 0.32
68 0.36
69 0.38
70 0.39
71 0.42
72 0.4
73 0.48
74 0.46
75 0.44
76 0.4
77 0.4
78 0.35
79 0.26
80 0.24
81 0.17
82 0.17
83 0.18
84 0.2
85 0.2
86 0.18
87 0.19
88 0.19
89 0.16
90 0.16
91 0.14
92 0.12
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.07
104 0.1
105 0.15
106 0.22
107 0.28
108 0.29
109 0.32
110 0.36
111 0.37
112 0.34
113 0.32
114 0.36
115 0.36
116 0.36
117 0.36
118 0.38
119 0.38
120 0.4
121 0.41
122 0.34
123 0.28
124 0.31
125 0.3
126 0.24
127 0.22
128 0.2
129 0.16
130 0.13
131 0.12
132 0.08
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.12
138 0.14
139 0.17
140 0.19
141 0.19
142 0.2
143 0.25
144 0.28
145 0.26
146 0.3
147 0.28
148 0.32
149 0.36
150 0.37
151 0.35
152 0.3
153 0.27
154 0.29
155 0.29
156 0.25
157 0.23
158 0.22
159 0.21
160 0.25
161 0.25
162 0.18
163 0.17
164 0.16
165 0.19
166 0.19
167 0.18
168 0.17
169 0.17
170 0.18
171 0.19
172 0.17
173 0.13
174 0.13
175 0.11
176 0.07
177 0.09
178 0.09
179 0.13
180 0.15
181 0.18
182 0.24
183 0.31
184 0.35
185 0.4
186 0.46
187 0.47
188 0.53
189 0.59
190 0.64
191 0.61
192 0.58
193 0.54
194 0.49
195 0.43
196 0.37
197 0.31
198 0.23
199 0.21
200 0.19
201 0.2
202 0.19
203 0.19
204 0.21
205 0.2
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.16
210 0.16
211 0.15
212 0.12
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.05
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.15
236 0.15
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.11
271 0.13
272 0.15
273 0.16
274 0.21
275 0.2
276 0.2
277 0.2
278 0.2
279 0.19
280 0.18
281 0.21
282 0.2
283 0.2
284 0.21
285 0.2
286 0.2
287 0.18
288 0.17
289 0.13
290 0.08
291 0.08
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.11
309 0.17
310 0.25
311 0.34
312 0.39
313 0.41
314 0.42
315 0.44
316 0.46
317 0.5
318 0.44
319 0.38
320 0.36
321 0.34
322 0.34
323 0.31
324 0.28
325 0.18
326 0.16
327 0.14
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.09
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.16
342 0.14
343 0.15
344 0.14
345 0.18
346 0.22
347 0.24
348 0.26
349 0.27
350 0.29
351 0.27
352 0.28
353 0.27
354 0.28
355 0.3
356 0.3
357 0.36
358 0.41
359 0.48
360 0.5
361 0.48
362 0.48
363 0.51
364 0.53
365 0.5
366 0.48
367 0.47
368 0.46
369 0.51
370 0.5
371 0.45
372 0.41
373 0.37
374 0.33
375 0.28
376 0.27
377 0.22
378 0.2
379 0.16
380 0.15
381 0.13
382 0.11
383 0.1
384 0.09
385 0.08
386 0.06
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.06
399 0.09
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.13
404 0.14
405 0.18
406 0.22
407 0.27
408 0.27
409 0.34
410 0.39
411 0.4
412 0.44
413 0.41
414 0.36
415 0.32
416 0.38
417 0.36
418 0.41
419 0.45
420 0.44
421 0.46
422 0.46
423 0.41
424 0.35
425 0.31
426 0.21
427 0.16
428 0.17
429 0.16
430 0.22
431 0.27
432 0.32
433 0.36
434 0.39
435 0.45
436 0.44
437 0.46
438 0.48
439 0.48
440 0.43
441 0.4
442 0.37
443 0.31
444 0.31
445 0.29
446 0.24
447 0.22
448 0.23
449 0.23
450 0.3
451 0.41
452 0.48
453 0.53
454 0.56
455 0.58
456 0.62
457 0.64
458 0.63
459 0.59
460 0.54
461 0.48
462 0.45
463 0.42
464 0.38
465 0.36
466 0.28
467 0.22
468 0.18
469 0.2
470 0.18
471 0.17
472 0.17
473 0.17
474 0.19
475 0.18
476 0.19
477 0.16
478 0.16
479 0.17
480 0.19
481 0.22
482 0.21
483 0.23
484 0.24
485 0.24
486 0.26
487 0.3
488 0.31
489 0.32
490 0.36
491 0.43
492 0.49
493 0.53
494 0.51
495 0.48
496 0.51
497 0.53
498 0.51
499 0.48
500 0.5
501 0.55
502 0.63
503 0.7
504 0.73
505 0.75
506 0.78
507 0.81
508 0.81
509 0.78
510 0.76
511 0.76
512 0.76
513 0.76
514 0.73
515 0.69
516 0.61
517 0.55
518 0.51
519 0.49
520 0.46
521 0.46
522 0.52
523 0.57