Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3QJS9

Protein Details
Accession E3QJS9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
315-343EEFARREADKKRRKDAKFRDKLNDLKRKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
319-345RREADKKRRKDAKFRDKLNDLKRKTRT
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 10, mito_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MVRPSTPPPNQAAAPPPTATPPTPAATRRMEESRLRAKALRDRRDAELAASGAPSALKTASGFVATPDVHITTAGAGASRSAADASRKRPYSSISTTASGTGSQPPPPQHPTTNRDARDTNAVPRPARNFAKFVDYNMSAMTDTKGGFLTAEDDPHNTALVPRQKPGGGPAQEEKPKGMSSQEWERLQLLRKLRRQKAGPFEPGLSVLADDAARKKCKDCGSYEIDFVWDEVFGAQVCHACKDKHPEKYSLLTKTECREDYLLTDEELKDAALLPHLSRPNPHKSHWHDMMLFLRFQVEEYAFTTKWGSAEKLDEEFARREADKKRRKDAKFRDKLNDLKRKTRTEAIRRQQATIAAGSGPRKFGDSVGGGKHVHDWGRAVENEDGMTVKKCNGCGMEVEELEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.38
3 0.34
4 0.33
5 0.36
6 0.32
7 0.29
8 0.28
9 0.28
10 0.33
11 0.35
12 0.37
13 0.39
14 0.4
15 0.41
16 0.42
17 0.45
18 0.45
19 0.52
20 0.55
21 0.53
22 0.54
23 0.52
24 0.54
25 0.58
26 0.62
27 0.63
28 0.61
29 0.62
30 0.63
31 0.65
32 0.59
33 0.51
34 0.45
35 0.36
36 0.28
37 0.24
38 0.19
39 0.13
40 0.12
41 0.1
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.15
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.08
70 0.15
71 0.21
72 0.27
73 0.35
74 0.37
75 0.38
76 0.4
77 0.42
78 0.43
79 0.44
80 0.45
81 0.39
82 0.39
83 0.38
84 0.37
85 0.33
86 0.25
87 0.21
88 0.21
89 0.19
90 0.21
91 0.24
92 0.26
93 0.31
94 0.36
95 0.39
96 0.4
97 0.46
98 0.48
99 0.53
100 0.59
101 0.55
102 0.54
103 0.51
104 0.46
105 0.46
106 0.43
107 0.4
108 0.38
109 0.41
110 0.37
111 0.4
112 0.42
113 0.41
114 0.44
115 0.4
116 0.36
117 0.33
118 0.4
119 0.37
120 0.35
121 0.33
122 0.28
123 0.26
124 0.23
125 0.23
126 0.14
127 0.15
128 0.13
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.08
145 0.09
146 0.13
147 0.21
148 0.22
149 0.22
150 0.24
151 0.24
152 0.24
153 0.27
154 0.29
155 0.22
156 0.24
157 0.26
158 0.31
159 0.34
160 0.34
161 0.32
162 0.25
163 0.23
164 0.21
165 0.2
166 0.15
167 0.16
168 0.23
169 0.29
170 0.28
171 0.28
172 0.29
173 0.3
174 0.31
175 0.31
176 0.31
177 0.33
178 0.39
179 0.48
180 0.52
181 0.57
182 0.58
183 0.6
184 0.63
185 0.61
186 0.59
187 0.51
188 0.46
189 0.39
190 0.36
191 0.29
192 0.19
193 0.12
194 0.08
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.09
199 0.13
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.22
204 0.28
205 0.31
206 0.3
207 0.33
208 0.38
209 0.38
210 0.38
211 0.33
212 0.28
213 0.24
214 0.2
215 0.14
216 0.07
217 0.06
218 0.04
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.06
224 0.07
225 0.09
226 0.11
227 0.12
228 0.15
229 0.25
230 0.31
231 0.39
232 0.42
233 0.45
234 0.46
235 0.53
236 0.56
237 0.51
238 0.47
239 0.4
240 0.4
241 0.38
242 0.41
243 0.34
244 0.3
245 0.26
246 0.24
247 0.23
248 0.24
249 0.22
250 0.16
251 0.18
252 0.16
253 0.15
254 0.14
255 0.12
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.14
263 0.17
264 0.17
265 0.21
266 0.26
267 0.35
268 0.38
269 0.4
270 0.44
271 0.49
272 0.58
273 0.59
274 0.58
275 0.49
276 0.48
277 0.51
278 0.43
279 0.35
280 0.26
281 0.22
282 0.17
283 0.17
284 0.16
285 0.11
286 0.1
287 0.13
288 0.17
289 0.16
290 0.17
291 0.18
292 0.16
293 0.16
294 0.17
295 0.17
296 0.14
297 0.17
298 0.19
299 0.2
300 0.2
301 0.2
302 0.22
303 0.22
304 0.21
305 0.21
306 0.2
307 0.24
308 0.32
309 0.42
310 0.48
311 0.54
312 0.63
313 0.7
314 0.77
315 0.82
316 0.84
317 0.85
318 0.85
319 0.85
320 0.83
321 0.81
322 0.83
323 0.82
324 0.81
325 0.75
326 0.75
327 0.76
328 0.73
329 0.71
330 0.71
331 0.71
332 0.71
333 0.77
334 0.77
335 0.79
336 0.75
337 0.71
338 0.65
339 0.58
340 0.5
341 0.4
342 0.31
343 0.22
344 0.23
345 0.24
346 0.23
347 0.21
348 0.19
349 0.2
350 0.19
351 0.18
352 0.21
353 0.21
354 0.24
355 0.26
356 0.3
357 0.28
358 0.28
359 0.3
360 0.29
361 0.27
362 0.24
363 0.23
364 0.23
365 0.29
366 0.29
367 0.3
368 0.28
369 0.27
370 0.25
371 0.24
372 0.21
373 0.16
374 0.18
375 0.15
376 0.18
377 0.2
378 0.21
379 0.25
380 0.26
381 0.26
382 0.28
383 0.31
384 0.33