FuNGI

Q2HC88

Protein Details

Accession

Q2HC88

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
636-666	TLASWKPSRRGNFHRKRRRYARIRHVVDNTR	Hydrophilic
800-819	GQGCCQGKFKRRKVGSEAEV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
642-657	PSRRGNFHRKRRRYAR

Subcellular Location(s)

mito 17, nucl 4.5, cyto_nucl 4.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MAASQARQQNLNLGTAAPATARKFPDWLQVCVYIALLLPRFVMAQFFVGGNPSQRAPYGLPVLSARAFTSFAVDRIGKDRAGIKMVHDGTCSAILPDACIRRLQLTSVIGRWDQGESCQDLYVPFECAAYFAEDRGASFEISPIGLSELPDRRLTFFSAALEPAQKGNMSALANAQRRVWPVLLAWTYFNQSGMVQDSAGWLSYTTAGESKRLPRRNVRSVLDTEHRHIWPRTISLGKYGAFPSNLVIGRPYHLTFELLDKLPDESFSRLRVVTSDELHADVFADEGASGCATPAAGANDTVISTTDGEEFSLVDEKGNVIARSNHEVLDENARQTLTQEEIEELKREGNNAGKDVIAKLLLSHTALDQKTSFSLAKYKLLKTKKYIRRFQVLPIDVANLAHWQLEERDSSKILDLRAEMIGLVGCWGNVHFGGDDVLLPDPKAPTDAGDEACLPVDEDLLKGRWLVVDDTCGLLVAAMAERMGVLYDGEGPETQRTEEENVTATGPTPAPSEKPQETRAHELIVPETKQKDSDTEMADGPGNSLKQQNDGRQKHQKPRPSDFAIPYSQSNTITVIHSASQPNLSLLNYWGFDITSPNHPPHPLLNHLLNLTWLQLLKPELDTSYSTPPLTASPETLASWKPSRRGNFHRKRRRYARIRHVVDNTRMGNFSGLVCASTMDPISILRHTLPLLGGGAPVAIYSPSVESLAALADCFSVPRRTAWVSGSVPETDGLSNEELERWEGNERFPLNPTLLQGVSIQTSRARRWQVLPGRTHPLMTERGGADGFVFTAWRAKPGGGQGCCQGKFKRRKVGSEAEVVTPTPA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.2
3	0.19
4	0.13
5	0.15
6	0.16
7	0.22
8	0.25
9	0.25
10	0.29
11	0.3
12	0.39
13	0.39
14	0.4
15	0.38
16	0.37
17	0.37
18	0.34
19	0.32
20	0.22
21	0.18
22	0.19
23	0.15
24	0.13
25	0.12
26	0.12
27	0.12
28	0.12
29	0.13
30	0.1
31	0.1
32	0.11
33	0.11
34	0.11
35	0.12
36	0.14
37	0.15
38	0.17
39	0.16
40	0.16
41	0.16
42	0.2
43	0.19
44	0.24
45	0.27
46	0.25
47	0.26
48	0.26
49	0.29
50	0.26
51	0.25
52	0.2
53	0.16
54	0.17
55	0.15
56	0.19
57	0.17
58	0.16
59	0.21
60	0.21
61	0.21
62	0.24
63	0.27
64	0.22
65	0.23
66	0.26
67	0.24
68	0.27
69	0.26
70	0.24
71	0.31
72	0.34
73	0.32
74	0.29
75	0.26
76	0.25
77	0.26
78	0.24
79	0.14
80	0.14
81	0.13
82	0.14
83	0.2
84	0.21
85	0.2
86	0.21
87	0.22
88	0.23
89	0.24
90	0.24
91	0.23
92	0.24
93	0.27
94	0.28
95	0.3
96	0.26
97	0.26
98	0.25
99	0.22
100	0.18
101	0.17
102	0.19
103	0.19
104	0.2
105	0.19
106	0.18
107	0.17
108	0.19
109	0.17
110	0.16
111	0.13
112	0.12
113	0.12
114	0.12
115	0.13
116	0.15
117	0.14
118	0.12
119	0.15
120	0.14
121	0.15
122	0.17
123	0.17
124	0.13
125	0.13
126	0.13
127	0.11
128	0.11
129	0.11
130	0.08
131	0.09
132	0.09
133	0.1
134	0.15
135	0.19
136	0.21
137	0.24
138	0.25
139	0.26
140	0.27
141	0.29
142	0.25
143	0.22
144	0.23
145	0.21
146	0.21
147	0.2
148	0.2
149	0.18
150	0.16
151	0.16
152	0.13
153	0.12
154	0.11
155	0.15
156	0.13
157	0.13
158	0.17
159	0.24
160	0.27
161	0.28
162	0.29
163	0.27
164	0.29
165	0.31
166	0.27
167	0.2
168	0.17
169	0.24
170	0.24
171	0.22
172	0.21
173	0.2
174	0.22
175	0.21
176	0.2
177	0.14
178	0.12
179	0.13
180	0.14
181	0.13
182	0.11
183	0.1
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.09
188	0.06
189	0.07
190	0.09
191	0.09
192	0.08
193	0.11
194	0.11
195	0.13
196	0.17
197	0.25
198	0.33
199	0.4
200	0.45
201	0.52
202	0.61
203	0.69
204	0.73
205	0.68
206	0.64
207	0.6
208	0.61
209	0.58
210	0.51
211	0.45
212	0.43
213	0.4
214	0.39
215	0.37
216	0.35
217	0.3
218	0.29
219	0.31
220	0.29
221	0.28
222	0.28
223	0.31
224	0.27
225	0.27
226	0.26
227	0.23
228	0.2
229	0.2
230	0.16
231	0.18
232	0.18
233	0.16
234	0.16
235	0.14
236	0.15
237	0.18
238	0.17
239	0.13
240	0.13
241	0.14
242	0.13
243	0.16
244	0.19
245	0.17
246	0.16
247	0.15
248	0.16
249	0.15
250	0.15
251	0.14
252	0.14
253	0.15
254	0.16
255	0.18
256	0.17
257	0.17
258	0.16
259	0.19
260	0.18
261	0.18
262	0.18
263	0.16
264	0.17
265	0.17
266	0.16
267	0.12
268	0.08
269	0.07
270	0.05
271	0.04
272	0.03
273	0.04
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.06
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.09
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.1
305	0.12
306	0.11
307	0.1
308	0.13
309	0.15
310	0.21
311	0.21
312	0.19
313	0.18
314	0.19
315	0.19
316	0.24
317	0.22
318	0.17
319	0.18
320	0.17
321	0.16
322	0.16
323	0.16
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.12
329	0.13
330	0.14
331	0.13
332	0.13
333	0.12
334	0.13
335	0.14
336	0.16
337	0.17
338	0.17
339	0.17
340	0.15
341	0.15
342	0.15
343	0.14
344	0.09
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.12
353	0.12
354	0.13
355	0.13
356	0.13
357	0.13
358	0.15
359	0.14
360	0.09
361	0.15
362	0.15
363	0.22
364	0.25
365	0.27
366	0.33
367	0.38
368	0.41
369	0.43
370	0.52
371	0.55
372	0.61
373	0.66
374	0.63
375	0.65
376	0.63
377	0.62
378	0.61
379	0.52
380	0.44
381	0.36
382	0.32
383	0.24
384	0.23
385	0.17
386	0.08
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.06
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.09
396	0.1
397	0.11
398	0.12
399	0.13
400	0.12
401	0.12
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.1
406	0.08
407	0.07
408	0.06
409	0.05
410	0.05
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.09
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.11
439	0.11
440	0.1
441	0.07
442	0.05
443	0.05
444	0.04
445	0.04
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.09
454	0.07
455	0.08
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.08
460	0.07
461	0.05
462	0.05
463	0.04
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.03
472	0.02
473	0.03
474	0.04
475	0.05
476	0.05
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.08
481	0.08
482	0.08
483	0.09
484	0.12
485	0.12
486	0.12
487	0.12
488	0.12
489	0.13
490	0.12
491	0.11
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.11
498	0.14
499	0.2
500	0.23
501	0.26
502	0.31
503	0.37
504	0.4
505	0.44
506	0.43
507	0.39
508	0.36
509	0.32
510	0.3
511	0.27
512	0.24
513	0.21
514	0.21
515	0.2
516	0.2
517	0.2
518	0.19
519	0.19
520	0.23
521	0.22
522	0.22
523	0.22
524	0.22
525	0.22
526	0.19
527	0.16
528	0.13
529	0.11
530	0.1
531	0.13
532	0.13
533	0.18
534	0.23
535	0.3
536	0.39
537	0.43
538	0.5
539	0.58
540	0.65
541	0.7
542	0.73
543	0.73
544	0.7
545	0.73
546	0.74
547	0.7
548	0.68
549	0.61
550	0.59
551	0.54
552	0.48
553	0.41
554	0.35
555	0.3
556	0.24
557	0.2
558	0.17
559	0.15
560	0.14
561	0.14
562	0.12
563	0.12
564	0.14
565	0.15
566	0.14
567	0.14
568	0.13
569	0.13
570	0.13
571	0.12
572	0.1
573	0.11
574	0.12
575	0.11
576	0.11
577	0.11
578	0.09
579	0.1
580	0.11
581	0.12
582	0.17
583	0.19
584	0.21
585	0.23
586	0.23
587	0.25
588	0.27
589	0.29
590	0.27
591	0.29
592	0.3
593	0.3
594	0.3
595	0.28
596	0.24
597	0.2
598	0.16
599	0.13
600	0.1
601	0.08
602	0.1
603	0.11
604	0.11
605	0.12
606	0.12
607	0.11
608	0.13
609	0.16
610	0.16
611	0.21
612	0.22
613	0.21
614	0.2
615	0.2
616	0.19
617	0.22
618	0.19
619	0.15
620	0.15
621	0.16
622	0.17
623	0.19
624	0.19
625	0.19
626	0.25
627	0.26
628	0.29
629	0.35
630	0.41
631	0.48
632	0.57
633	0.64
634	0.68
635	0.76
636	0.83
637	0.85
638	0.9
639	0.91
640	0.92
641	0.91
642	0.91
643	0.91
644	0.91
645	0.87
646	0.84
647	0.82
648	0.78
649	0.72
650	0.69
651	0.59
652	0.5
653	0.45
654	0.38
655	0.3
656	0.23
657	0.19
658	0.13
659	0.12
660	0.1
661	0.09
662	0.09
663	0.09
664	0.09
665	0.09
666	0.07
667	0.07
668	0.08
669	0.1
670	0.1
671	0.11
672	0.11
673	0.12
674	0.13
675	0.14
676	0.13
677	0.12
678	0.12
679	0.11
680	0.1
681	0.08
682	0.08
683	0.06
684	0.06
685	0.05
686	0.04
687	0.04
688	0.05
689	0.06
690	0.07
691	0.07
692	0.07
693	0.07
694	0.07
695	0.09
696	0.08
697	0.07
698	0.06
699	0.06
700	0.06
701	0.07
702	0.1
703	0.12
704	0.13
705	0.15
706	0.2
707	0.22
708	0.25
709	0.26
710	0.31
711	0.29
712	0.31
713	0.32
714	0.28
715	0.25
716	0.23
717	0.22
718	0.15
719	0.14
720	0.14
721	0.12
722	0.13
723	0.12
724	0.13
725	0.13
726	0.15
727	0.14
728	0.13
729	0.19
730	0.2
731	0.21
732	0.27
733	0.28
734	0.28
735	0.3
736	0.32
737	0.28
738	0.28
739	0.28
740	0.26
741	0.24
742	0.23
743	0.21
744	0.2
745	0.19
746	0.18
747	0.17
748	0.18
749	0.23
750	0.26
751	0.33
752	0.37
753	0.39
754	0.43
755	0.52
756	0.57
757	0.6
758	0.64
759	0.61
760	0.64
761	0.6
762	0.56
763	0.47
764	0.42
765	0.39
766	0.34
767	0.33
768	0.26
769	0.27
770	0.26
771	0.25
772	0.2
773	0.16
774	0.14
775	0.09
776	0.09
777	0.07
778	0.13
779	0.14
780	0.16
781	0.16
782	0.17
783	0.2
784	0.29
785	0.38
786	0.34
787	0.36
788	0.41
789	0.48
790	0.49
791	0.51
792	0.5
793	0.5
794	0.59
795	0.66
796	0.7
797	0.68
798	0.74
799	0.77
800	0.8
801	0.76
802	0.74
803	0.68
804	0.6
805	0.55

Q2HC88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer