FuNGI

E3Q5N8

Protein Details

Accession

E3Q5N8

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
61-80	PSTNGKRKSRSSLPKVNYKD	Hydrophilic
162-181	ANEAKAKKATPKKPVKDESS	Hydrophilic
763-783	EEQRSKITKKFEKDNEKRLAE	Hydrophilic
801-824	DELAAKFKKENKSKKVEPEGRSPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
142-178	LAKKKADIEKAAAKEARSIRANEAKAKKATPKKPVKD
187-244	AKSAIKKRQSNGAGSTKKRPNGVKAESDSDEPIAKKAAKRATPAKATVAKGKAAAKAK
429-441	RGEHPKTGKLKKR
784-816	GEKPFPDKELKERLKAADELAAKFKKENKSKKV

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011010 DNA_brk_join_enz IPR013034 DNA_topo_DNA_db_N_dom1 IPR013030 DNA_topo_DNA_db_N_dom2 IPR001631 TopoI IPR025834 TopoI_C_dom IPR014711 TopoI_cat_a-hlx-sub_euk IPR014727 TopoI_cat_a/b-sub_euk IPR013500 TopoI_cat_euk IPR008336 TopoI_DNA-bd_euk IPR036202 TopoI_DNA-bd_euk_N_sf IPR013499 TopoI_euk
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005730 C:nucleolus GO:0031298 C:replication fork protection complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003917 F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity GO:0006271 P:DNA strand elongation involved in DNA replication GO:0006265 P:DNA topological change GO:0007076 P:mitotic chromosome condensation GO:0007097 P:nuclear migration GO:0000183 P:rDNA heterochromatin formation GO:0000019 P:regulation of mitotic recombination GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0009303 P:rRNA transcription GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14370 Topo_C_assoc PF01028 Topoisom_I PF02919 Topoisom_I_N
CDD	cd00659 Topo_IB_C cd03488 Topoisomer_IB_N_htopoI_like

Amino Acid Sequences

MSSSDDDAPLARSNGHVSASRISKADDIDMDRTASKARAAPPGLSIRHGPVDDDTMDVDGPSTNGKRKSRSSLPKVNYKDESESDDDAPLAKRQKTKTKAPETDSDDEPLTSRRGKNLPPSYKETALPDESSDDDQPLGARLAKKKADIEKAAAKEARSIRANEAKAKKATPKKPVKDESSDDEPLAKSAIKKRQSNGAGSTKKRPNGVKAESDSDEPIAKKAAKRATPAKATVAKGKAAAKAKQESEAPEEDEEEEYEWWKDPKKEDDSVKWTTLEHNGVMFPPEYQPLPKNVKLVYDGKPVNLPIEAEEVAGFFGAMLNSKHNVDNPVFQKNFFDDFKAVLKESGHATDKQGNKVDIREFSKMNFEQIFQYYEQQSAIRKNRSAAEKKAAKAEKDELEAPFMYCKWDGRKEKVGNFRVEPPSLFRGRGEHPKTGKLKKRVYPEQITINIGKDAKVPEPPKGHKWKAVVHDNKATWLAMWQENINGAYKYVMLGAASAIKGQSDMKKFEKARELKKHIDKIRRDYTKDLKSEIMADRQRATAVYLIDKFALRAGNEKDAENEAETVGCCSLKYEHITLREPNTVIFDFLGKDSIRFYDEVTVEKQVFKNLKLFKKPPKTDGDDIFDRLTTTQLNNHLKNYMPGLTAKVFRTYNASFTMSNLLQKLVDHKNLTIAEKVKLYNDCNREVAILCNHKRTVGAAHEAQMEKLGDRIKGLRYQQWRTKMMMLQVDSKVKKKKGADFFARPEDLTDEWILEHQKFLVEEQRSKITKKFEKDNEKRLAEGEKPFPDKELKERLKAADELAAKFKKENKSKKVEPEGRSPSIEKLDEQVKKFDDRVKTLELQAADRDGNKEVALSTSKINYIDPRLTVVFAKKFDVPIEKFFSKTLRDKFSWAIKSVEDDDWEF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.22
3	0.22
4	0.22
5	0.29
6	0.32
7	0.33
8	0.31
9	0.3
10	0.31
11	0.29
12	0.3
13	0.27
14	0.28
15	0.29
16	0.29
17	0.29
18	0.26
19	0.26
20	0.25
21	0.21
22	0.2
23	0.22
24	0.25
25	0.32
26	0.34
27	0.35
28	0.38
29	0.45
30	0.43
31	0.41
32	0.39
33	0.34
34	0.37
35	0.35
36	0.31
37	0.24
38	0.27
39	0.25
40	0.24
41	0.2
42	0.16
43	0.16
44	0.14
45	0.12
46	0.08
47	0.09
48	0.13
49	0.16
50	0.22
51	0.3
52	0.36
53	0.43
54	0.49
55	0.58
56	0.63
57	0.7
58	0.74
59	0.76
60	0.77
61	0.8
62	0.8
63	0.79
64	0.73
65	0.67
66	0.63
67	0.54
68	0.54
69	0.49
70	0.46
71	0.39
72	0.34
73	0.3
74	0.26
75	0.26
76	0.25
77	0.27
78	0.28
79	0.34
80	0.41
81	0.52
82	0.57
83	0.66
84	0.71
85	0.75
86	0.79
87	0.77
88	0.79
89	0.76
90	0.74
91	0.65
92	0.57
93	0.47
94	0.39
95	0.34
96	0.28
97	0.24
98	0.25
99	0.25
100	0.29
101	0.34
102	0.39
103	0.49
104	0.57
105	0.62
106	0.62
107	0.68
108	0.67
109	0.65
110	0.62
111	0.55
112	0.51
113	0.45
114	0.39
115	0.33
116	0.29
117	0.28
118	0.29
119	0.25
120	0.19
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.14
125	0.13
126	0.14
127	0.18
128	0.23
129	0.3
130	0.33
131	0.36
132	0.42
133	0.48
134	0.53
135	0.52
136	0.52
137	0.53
138	0.52
139	0.55
140	0.5
141	0.43
142	0.42
143	0.41
144	0.42
145	0.37
146	0.37
147	0.38
148	0.44
149	0.47
150	0.49
151	0.51
152	0.51
153	0.51
154	0.53
155	0.56
156	0.58
157	0.63
158	0.64
159	0.69
160	0.71
161	0.78
162	0.82
163	0.8
164	0.77
165	0.74
166	0.7
167	0.67
168	0.59
169	0.49
170	0.43
171	0.36
172	0.29
173	0.25
174	0.2
175	0.17
176	0.24
177	0.33
178	0.38
179	0.43
180	0.45
181	0.54
182	0.56
183	0.57
184	0.56
185	0.57
186	0.58
187	0.57
188	0.64
189	0.61
190	0.6
191	0.61
192	0.58
193	0.56
194	0.57
195	0.59
196	0.57
197	0.54
198	0.56
199	0.52
200	0.49
201	0.42
202	0.34
203	0.31
204	0.23
205	0.2
206	0.19
207	0.2
208	0.2
209	0.26
210	0.33
211	0.34
212	0.4
213	0.47
214	0.51
215	0.54
216	0.54
217	0.54
218	0.52
219	0.51
220	0.51
221	0.46
222	0.39
223	0.37
224	0.38
225	0.37
226	0.36
227	0.39
228	0.37
229	0.41
230	0.41
231	0.4
232	0.39
233	0.36
234	0.35
235	0.33
236	0.29
237	0.24
238	0.24
239	0.21
240	0.2
241	0.17
242	0.14
243	0.11
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.16
249	0.19
250	0.22
251	0.3
252	0.35
253	0.41
254	0.45
255	0.51
256	0.53
257	0.54
258	0.52
259	0.44
260	0.39
261	0.35
262	0.33
263	0.27
264	0.21
265	0.17
266	0.16
267	0.16
268	0.17
269	0.14
270	0.1
271	0.1
272	0.11
273	0.11
274	0.13
275	0.14
276	0.2
277	0.27
278	0.29
279	0.31
280	0.3
281	0.31
282	0.33
283	0.36
284	0.33
285	0.35
286	0.33
287	0.31
288	0.32
289	0.3
290	0.26
291	0.22
292	0.18
293	0.1
294	0.13
295	0.12
296	0.1
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.07
302	0.03
303	0.04
304	0.03
305	0.05
306	0.05
307	0.07
308	0.09
309	0.1
310	0.11
311	0.12
312	0.15
313	0.16
314	0.22
315	0.23
316	0.31
317	0.3
318	0.29
319	0.3
320	0.29
321	0.32
322	0.25
323	0.25
324	0.17
325	0.18
326	0.21
327	0.21
328	0.19
329	0.16
330	0.16
331	0.15
332	0.16
333	0.17
334	0.17
335	0.16
336	0.18
337	0.23
338	0.26
339	0.29
340	0.31
341	0.29
342	0.28
343	0.3
344	0.3
345	0.29
346	0.3
347	0.28
348	0.25
349	0.25
350	0.31
351	0.28
352	0.28
353	0.24
354	0.21
355	0.2
356	0.21
357	0.23
358	0.16
359	0.19
360	0.16
361	0.16
362	0.16
363	0.15
364	0.16
365	0.22
366	0.28
367	0.29
368	0.29
369	0.31
370	0.35
371	0.43
372	0.46
373	0.42
374	0.45
375	0.46
376	0.46
377	0.53
378	0.5
379	0.43
380	0.4
381	0.41
382	0.33
383	0.31
384	0.32
385	0.23
386	0.23
387	0.22
388	0.19
389	0.15
390	0.12
391	0.12
392	0.1
393	0.12
394	0.14
395	0.23
396	0.27
397	0.32
398	0.41
399	0.45
400	0.51
401	0.59
402	0.6
403	0.54
404	0.52
405	0.53
406	0.47
407	0.42
408	0.36
409	0.3
410	0.29
411	0.27
412	0.26
413	0.19
414	0.19
415	0.22
416	0.32
417	0.32
418	0.34
419	0.34
420	0.41
421	0.48
422	0.53
423	0.57
424	0.56
425	0.6
426	0.59
427	0.67
428	0.67
429	0.68
430	0.65
431	0.6
432	0.56
433	0.5
434	0.47
435	0.39
436	0.31
437	0.26
438	0.21
439	0.18
440	0.14
441	0.14
442	0.12
443	0.18
444	0.18
445	0.22
446	0.28
447	0.31
448	0.37
449	0.45
450	0.46
451	0.45
452	0.47
453	0.47
454	0.48
455	0.55
456	0.52
457	0.47
458	0.51
459	0.46
460	0.43
461	0.38
462	0.31
463	0.21
464	0.17
465	0.16
466	0.11
467	0.12
468	0.1
469	0.1
470	0.11
471	0.12
472	0.11
473	0.08
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.06
479	0.05
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.07
490	0.12
491	0.14
492	0.18
493	0.21
494	0.29
495	0.3
496	0.34
497	0.41
498	0.43
499	0.5
500	0.56
501	0.61
502	0.62
503	0.69
504	0.73
505	0.71
506	0.73
507	0.69
508	0.68
509	0.71
510	0.68
511	0.63
512	0.61
513	0.63
514	0.61
515	0.57
516	0.51
517	0.42
518	0.36
519	0.37
520	0.33
521	0.32
522	0.26
523	0.26
524	0.25
525	0.24
526	0.24
527	0.2
528	0.19
529	0.13
530	0.12
531	0.14
532	0.13
533	0.13
534	0.14
535	0.14
536	0.13
537	0.12
538	0.13
539	0.09
540	0.14
541	0.16
542	0.21
543	0.22
544	0.22
545	0.22
546	0.22
547	0.22
548	0.18
549	0.16
550	0.1
551	0.1
552	0.09
553	0.09
554	0.07
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.08
559	0.1
560	0.13
561	0.15
562	0.18
563	0.22
564	0.26
565	0.28
566	0.3
567	0.3
568	0.28
569	0.25
570	0.25
571	0.22
572	0.19
573	0.16
574	0.13
575	0.11
576	0.11
577	0.14
578	0.1
579	0.1
580	0.1
581	0.11
582	0.12
583	0.11
584	0.12
585	0.15
586	0.16
587	0.17
588	0.18
589	0.2
590	0.19
591	0.21
592	0.21
593	0.21
594	0.22
595	0.22
596	0.27
597	0.33
598	0.4
599	0.46
600	0.52
601	0.57
602	0.66
603	0.68
604	0.67
605	0.67
606	0.67
607	0.65
608	0.63
609	0.59
610	0.51
611	0.49
612	0.43
613	0.35
614	0.28
615	0.23
616	0.18
617	0.13
618	0.11
619	0.13
620	0.22
621	0.29
622	0.3
623	0.31
624	0.32
625	0.31
626	0.31
627	0.3
628	0.23
629	0.17
630	0.16
631	0.18
632	0.19
633	0.22
634	0.22
635	0.24
636	0.22
637	0.22
638	0.27
639	0.25
640	0.25
641	0.25
642	0.26
643	0.21
644	0.22
645	0.27
646	0.21
647	0.23
648	0.2
649	0.17
650	0.15
651	0.15
652	0.21
653	0.21
654	0.25
655	0.25
656	0.24
657	0.29
658	0.31
659	0.33
660	0.31
661	0.27
662	0.25
663	0.26
664	0.26
665	0.25
666	0.27
667	0.29
668	0.32
669	0.34
670	0.34
671	0.33
672	0.32
673	0.3
674	0.27
675	0.27
676	0.26
677	0.32
678	0.31
679	0.36
680	0.35
681	0.34
682	0.34
683	0.32
684	0.3
685	0.25
686	0.28
687	0.24
688	0.26
689	0.31
690	0.31
691	0.29
692	0.26
693	0.22
694	0.17
695	0.18
696	0.18
697	0.14
698	0.15
699	0.18
700	0.19
701	0.25
702	0.29
703	0.34
704	0.39
705	0.48
706	0.53
707	0.59
708	0.58
709	0.55
710	0.58
711	0.53
712	0.5
713	0.48
714	0.42
715	0.4
716	0.41
717	0.46
718	0.43
719	0.46
720	0.5
721	0.47
722	0.52
723	0.52
724	0.58
725	0.6
726	0.67
727	0.7
728	0.7
729	0.73
730	0.73
731	0.68
732	0.58
733	0.49
734	0.43
735	0.34
736	0.28
737	0.22
738	0.15
739	0.14
740	0.16
741	0.17
742	0.14
743	0.14
744	0.11
745	0.13
746	0.13
747	0.15
748	0.2
749	0.23
750	0.27
751	0.3
752	0.39
753	0.4
754	0.42
755	0.45
756	0.47
757	0.5
758	0.53
759	0.59
760	0.61
761	0.7
762	0.76
763	0.81
764	0.81
765	0.75
766	0.68
767	0.61
768	0.56
769	0.5
770	0.48
771	0.45
772	0.43
773	0.45
774	0.45
775	0.45
776	0.45
777	0.43
778	0.44
779	0.48
780	0.47
781	0.48
782	0.53
783	0.53
784	0.52
785	0.5
786	0.43
787	0.39
788	0.36
789	0.33
790	0.37
791	0.36
792	0.32
793	0.34
794	0.39
795	0.43
796	0.5
797	0.58
798	0.59
799	0.67
800	0.75
801	0.82
802	0.86
803	0.85
804	0.8
805	0.8
806	0.79
807	0.73
808	0.69
809	0.6
810	0.54
811	0.51
812	0.47
813	0.37
814	0.34
815	0.39
816	0.41
817	0.42
818	0.43
819	0.4
820	0.42
821	0.45
822	0.47
823	0.46
824	0.45
825	0.47
826	0.47
827	0.48
828	0.46
829	0.47
830	0.42
831	0.36
832	0.33
833	0.31
834	0.26
835	0.25
836	0.25
837	0.22
838	0.22
839	0.19
840	0.18
841	0.15
842	0.17
843	0.18
844	0.18
845	0.18
846	0.2
847	0.22
848	0.22
849	0.24
850	0.26
851	0.29
852	0.32
853	0.29
854	0.32
855	0.3
856	0.31
857	0.33
858	0.35
859	0.34
860	0.32
861	0.35
862	0.32
863	0.33
864	0.36
865	0.41
866	0.38
867	0.39
868	0.45
869	0.44
870	0.43
871	0.43
872	0.44
873	0.42
874	0.48
875	0.49
876	0.49
877	0.49
878	0.53
879	0.58
880	0.62
881	0.61
882	0.55
883	0.49
884	0.42
885	0.45
886	0.45
887	0.41

E3Q5N8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer