FuNGI

C9SKW6

Protein Details

Accession

C9SKW6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
453-473	VNGKADKKAKKAKKALIQEVE	Hydrophilic
538-598	GQPVVFSKKELKKLRKAEEKADETPSKSDAEGKKKRKHEDAEEATPKKEKKQKKKRQSLGA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
457-466	ADKKAKKAKK
545-595	KKELKKLRKAEEKADETPSKSDAEGKKKRKHEDAEEATPKKEKKQKKKRQS

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13.166, cyto 13, nucl 12, cyto_mito 7.666, mito_nucl 7.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045056 Nop56/Nop58 IPR012974 NOP58/56_N IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf IPR012976 NOSIC
Gene Ontology	GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0030515 F:snoRNA binding GO:0042254 P:ribosome biogenesis
KEGG	val:VDBG_05443 -
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop PF08156 NOP5NT
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

MSLFVLAETPAGYGLFKAADKKLLKREELTSGPTSSEQINDMLKLKSFVKFDSSAIAVEEASGLREGRVPPMLANLLNEIKDEKKASLAVADVKLGAAIGKLPDLDIKAVSDAATLDLFRAVRENLSSLIPGLADETVDRMALGLSHSISRHKLKFSADKVDAMVVQAIKLLDDLDKELNVYAMRTKEWYGWHFPELAKILNDNLAYARLVDLVGMRENLADADLSDILPEELETPVKTAAEISMGTEITPDDLENIQLLARQVISYSEYRTQLSSYLETRMRALAPNLTALVGTLVGARLIAHAGSILSLAKAPSSTIQIYGAEKALFRALKTKHDTPKYGIIYHSSLVGQATGKNKGKIARSLAAKTALGLRVDALADFDGEDADEEERGMLGLTSRIKLENLLRKLEGKPPLPKGANIAPDGSLTAPAQFTLNEVRKYNADADGVDGAEVNGKADKKAKKAKKALIQEVEMKDADSEAEDSDDDMEDASGSPSIGSVSDDTDGEKPSDKAERQGPEGPSVTPRLPRGDVELGPDGQPVVFSKKELKKLRKAEEKADETPSKSDAEGKKKRKHEDAEEATPKKEKKQKKKRQSLGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.1
3	0.11
4	0.15
5	0.17
6	0.25
7	0.29
8	0.37
9	0.45
10	0.51
11	0.53
12	0.53
13	0.55
14	0.55
15	0.54
16	0.53
17	0.47
18	0.4
19	0.38
20	0.35
21	0.32
22	0.25
23	0.23
24	0.18
25	0.18
26	0.18
27	0.19
28	0.21
29	0.21
30	0.21
31	0.22
32	0.23
33	0.25
34	0.25
35	0.24
36	0.27
37	0.28
38	0.27
39	0.29
40	0.28
41	0.23
42	0.22
43	0.21
44	0.15
45	0.13
46	0.13
47	0.09
48	0.09
49	0.09
50	0.08
51	0.08
52	0.12
53	0.13
54	0.16
55	0.19
56	0.19
57	0.18
58	0.23
59	0.25
60	0.21
61	0.22
62	0.22
63	0.22
64	0.21
65	0.22
66	0.19
67	0.19
68	0.22
69	0.23
70	0.19
71	0.19
72	0.2
73	0.2
74	0.19
75	0.2
76	0.21
77	0.2
78	0.2
79	0.17
80	0.16
81	0.15
82	0.13
83	0.11
84	0.05
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.07
89	0.07
90	0.09
91	0.1
92	0.11
93	0.11
94	0.11
95	0.11
96	0.11
97	0.11
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.09
102	0.08
103	0.07
104	0.09
105	0.09
106	0.09
107	0.11
108	0.11
109	0.11
110	0.12
111	0.14
112	0.13
113	0.14
114	0.14
115	0.12
116	0.11
117	0.1
118	0.09
119	0.08
120	0.07
121	0.06
122	0.06
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.06
128	0.05
129	0.06
130	0.07
131	0.06
132	0.07
133	0.09
134	0.1
135	0.13
136	0.17
137	0.24
138	0.26
139	0.28
140	0.31
141	0.35
142	0.44
143	0.46
144	0.5
145	0.45
146	0.43
147	0.41
148	0.39
149	0.33
150	0.24
151	0.22
152	0.12
153	0.1
154	0.11
155	0.1
156	0.08
157	0.08
158	0.08
159	0.06
160	0.07
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.1
167	0.09
168	0.09
169	0.1
170	0.1
171	0.11
172	0.13
173	0.14
174	0.16
175	0.2
176	0.23
177	0.27
178	0.29
179	0.29
180	0.3
181	0.29
182	0.3
183	0.28
184	0.26
185	0.19
186	0.17
187	0.16
188	0.16
189	0.16
190	0.12
191	0.11
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.09
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.08
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.05
209	0.04
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.06
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.07
230	0.06
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.05
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.08
253	0.08
254	0.11
255	0.14
256	0.15
257	0.16
258	0.16
259	0.16
260	0.16
261	0.16
262	0.16
263	0.14
264	0.17
265	0.18
266	0.18
267	0.18
268	0.17
269	0.16
270	0.15
271	0.14
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.09
278	0.08
279	0.07
280	0.04
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.05
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.09
307	0.11
308	0.11
309	0.12
310	0.12
311	0.1
312	0.09
313	0.09
314	0.11
315	0.1
316	0.1
317	0.16
318	0.17
319	0.24
320	0.3
321	0.37
322	0.42
323	0.46
324	0.49
325	0.45
326	0.52
327	0.47
328	0.43
329	0.36
330	0.31
331	0.28
332	0.26
333	0.23
334	0.14
335	0.12
336	0.1
337	0.11
338	0.08
339	0.09
340	0.12
341	0.18
342	0.21
343	0.22
344	0.24
345	0.28
346	0.3
347	0.32
348	0.35
349	0.33
350	0.35
351	0.35
352	0.35
353	0.33
354	0.3
355	0.26
356	0.24
357	0.2
358	0.16
359	0.14
360	0.13
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.08
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.03
381	0.03
382	0.07
383	0.08
384	0.09
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.14
389	0.2
390	0.26
391	0.28
392	0.31
393	0.31
394	0.33
395	0.35
396	0.39
397	0.39
398	0.35
399	0.39
400	0.41
401	0.48
402	0.46
403	0.44
404	0.43
405	0.41
406	0.41
407	0.35
408	0.31
409	0.24
410	0.22
411	0.23
412	0.18
413	0.14
414	0.09
415	0.09
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.09
421	0.16
422	0.21
423	0.23
424	0.24
425	0.26
426	0.26
427	0.29
428	0.3
429	0.24
430	0.19
431	0.16
432	0.18
433	0.17
434	0.16
435	0.13
436	0.11
437	0.08
438	0.1
439	0.09
440	0.08
441	0.1
442	0.1
443	0.12
444	0.19
445	0.24
446	0.31
447	0.42
448	0.5
449	0.57
450	0.67
451	0.74
452	0.76
453	0.8
454	0.81
455	0.77
456	0.72
457	0.69
458	0.61
459	0.56
460	0.47
461	0.37
462	0.27
463	0.21
464	0.18
465	0.11
466	0.1
467	0.07
468	0.08
469	0.07
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.05
483	0.06
484	0.06
485	0.07
486	0.07
487	0.08
488	0.09
489	0.1
490	0.12
491	0.13
492	0.15
493	0.15
494	0.17
495	0.15
496	0.18
497	0.26
498	0.25
499	0.29
500	0.35
501	0.38
502	0.41
503	0.48
504	0.46
505	0.43
506	0.44
507	0.39
508	0.35
509	0.35
510	0.33
511	0.3
512	0.31
513	0.32
514	0.32
515	0.32
516	0.35
517	0.37
518	0.35
519	0.36
520	0.37
521	0.32
522	0.31
523	0.3
524	0.23
525	0.17
526	0.17
527	0.14
528	0.16
529	0.15
530	0.17
531	0.26
532	0.34
533	0.44
534	0.54
535	0.61
536	0.65
537	0.75
538	0.83
539	0.84
540	0.82
541	0.82
542	0.82
543	0.79
544	0.74
545	0.72
546	0.66
547	0.58
548	0.55
549	0.47
550	0.38
551	0.31
552	0.36
553	0.35
554	0.42
555	0.5
556	0.58
557	0.65
558	0.73
559	0.81
560	0.82
561	0.83
562	0.82
563	0.82
564	0.81
565	0.82
566	0.83
567	0.77
568	0.7
569	0.68
570	0.61
571	0.59
572	0.6
573	0.6
574	0.62
575	0.71
576	0.79
577	0.84
578	0.93

C9SKW6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer