FuNGI

C9SYH6

Protein Details

Accession

C9SYH6

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
86-122	VIKIPVPGTRKARRKKGSGKLRELKPKSKKPMTEERS	Basic
287-310	SRDTSPVKKVSKRKKPRTITELAT	Hydrophilic
338-362	ATVAAKGKPKKKTAKSKRIQKVPEP	Hydrophilic
648-673	ATAPETSKRPRGRPRKHRTTEVIPDE	Hydrophilic
678-722	AQPPVASPKRPRGRPRKDAGSPAAASTTKSKPKVKPKASLQGTKK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
93-132	GTRKARRKKGSGKLRELKPKSKKPMTEERSKEKKPWMKYR
294-302	KKVSKRKKP
343-357	KGKPKKKTAKSKRIQ
654-665	SKRPRGRPRKHR
682-724	VASPKRPRGRPRKDAGSPAAASTTKSKPKVKPKASLQGTKKAA

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR000637 HMGI/Y_DNA-bd_CS IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
KEGG	val:VDBG_09951 -
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
PROSITE	View protein in PROSITE PS00354 HMGI_Y
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MASSTRSRGHVASSSPLPSVDEMFSRITKPPMQNDYVFKSATEFPERQSVGATSFIRPERVSVDLLTPNKPNPEAIEPDSDDSVCVIKIPVPGTRKARRKKGSGKLRELKPKSKKPMTEERSKEKKPWMKYRASESPNGKSKSHVTQESGKSTEKVRSHHFPTPVQTKQTDDDAEPRLLPQKEPLRDEPLDLAPASRRRANWTPPPPQQLGPEGSRSSDVEELLSSTLKNCNAAAARVSFESLLENYVCKEDASDGKRSETPEGIPDALKKRKLAQSIPTSDSATVSRDTSPVKKVSKRKKPRTITELATAAYAAPEEPEAAPAASLLAYLEQQTSGATVAAKGKPKKKTAKSKRIQKVPEPASILLSPGTAIKQVANQDFVFGTSSQLAREHSPNLLRDIQTAVRASNSTLDEPDPFTTPLNSDSIEPPPRKKLWEVGARDDDGRLVDLEIIDLVGTPAVSVPENGDSFGYLHVENAIQTRIRDLAEVDEEVVLPKLSPASAVSADASREIIPCLISSDIGNLGMAKISDVQQQTCTPPNSMHPSKTLEVLDIPAPEPVGTPIALVVEPAPAGPKRPRYELYTDIQLTKEVRKFGFKPIKRRTAMIALLGQCWESQNRPRVALSPLPSNQPLSTASGLTSSAAAPRATAPETSKRPRGRPRKHRTTEVIPDEPPPSAQPPVASPKRPRGRPRKDAGSPAAASTTKSKPKVKPKASLQGTKKAAKAEDAVAAAATSTSRLKVSRPRAVAAEVIEIPDSASDGSLLTSSPEMRSSSPPAVDVCLSLDENAEMSLAPSVASTQSNLMDHITKAVKAAPPTQDPNEPSWHEKMLMYDPVILEDLAAWLNSGQLSEAGHDGEVSASEVKQWCESKSICCLWRVNLSGKERKRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.33
3	0.32
4	0.29
5	0.25
6	0.25
7	0.2
8	0.18
9	0.18
10	0.21
11	0.22
12	0.23
13	0.25
14	0.27
15	0.33
16	0.37
17	0.44
18	0.48
19	0.51
20	0.54
21	0.57
22	0.59
23	0.55
24	0.49
25	0.4
26	0.37
27	0.37
28	0.37
29	0.38
30	0.32
31	0.31
32	0.4
33	0.41
34	0.37
35	0.34
36	0.3
37	0.25
38	0.3
39	0.3
40	0.22
41	0.28
42	0.3
43	0.31
44	0.29
45	0.29
46	0.25
47	0.26
48	0.26
49	0.21
50	0.25
51	0.29
52	0.32
53	0.33
54	0.34
55	0.34
56	0.36
57	0.36
58	0.32
59	0.29
60	0.32
61	0.35
62	0.35
63	0.39
64	0.37
65	0.38
66	0.38
67	0.33
68	0.28
69	0.22
70	0.2
71	0.13
72	0.11
73	0.09
74	0.11
75	0.15
76	0.16
77	0.22
78	0.24
79	0.32
80	0.4
81	0.5
82	0.57
83	0.63
84	0.72
85	0.74
86	0.81
87	0.84
88	0.86
89	0.87
90	0.88
91	0.89
92	0.88
93	0.89
94	0.9
95	0.87
96	0.86
97	0.86
98	0.86
99	0.85
100	0.84
101	0.82
102	0.79
103	0.82
104	0.79
105	0.79
106	0.77
107	0.77
108	0.78
109	0.75
110	0.74
111	0.73
112	0.74
113	0.73
114	0.76
115	0.74
116	0.73
117	0.75
118	0.78
119	0.77
120	0.74
121	0.72
122	0.67
123	0.68
124	0.67
125	0.66
126	0.57
127	0.51
128	0.51
129	0.52
130	0.54
131	0.49
132	0.44
133	0.49
134	0.55
135	0.57
136	0.56
137	0.48
138	0.42
139	0.41
140	0.44
141	0.39
142	0.37
143	0.38
144	0.43
145	0.48
146	0.53
147	0.55
148	0.52
149	0.55
150	0.6
151	0.57
152	0.54
153	0.48
154	0.45
155	0.43
156	0.43
157	0.38
158	0.31
159	0.32
160	0.31
161	0.31
162	0.28
163	0.27
164	0.29
165	0.28
166	0.27
167	0.29
168	0.34
169	0.38
170	0.44
171	0.47
172	0.47
173	0.46
174	0.47
175	0.43
176	0.36
177	0.32
178	0.26
179	0.23
180	0.21
181	0.26
182	0.28
183	0.28
184	0.27
185	0.33
186	0.41
187	0.47
188	0.52
189	0.56
190	0.62
191	0.66
192	0.71
193	0.66
194	0.62
195	0.57
196	0.51
197	0.47
198	0.4
199	0.37
200	0.31
201	0.29
202	0.28
203	0.26
204	0.23
205	0.2
206	0.17
207	0.13
208	0.13
209	0.13
210	0.12
211	0.12
212	0.09
213	0.09
214	0.12
215	0.12
216	0.13
217	0.12
218	0.15
219	0.16
220	0.17
221	0.18
222	0.16
223	0.17
224	0.16
225	0.17
226	0.13
227	0.12
228	0.12
229	0.1
230	0.11
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.1
235	0.11
236	0.09
237	0.09
238	0.1
239	0.17
240	0.2
241	0.26
242	0.26
243	0.29
244	0.31
245	0.33
246	0.32
247	0.27
248	0.25
249	0.22
250	0.23
251	0.21
252	0.2
253	0.23
254	0.28
255	0.32
256	0.33
257	0.32
258	0.36
259	0.4
260	0.45
261	0.45
262	0.46
263	0.5
264	0.53
265	0.54
266	0.5
267	0.45
268	0.4
269	0.36
270	0.28
271	0.21
272	0.16
273	0.14
274	0.13
275	0.14
276	0.16
277	0.19
278	0.22
279	0.27
280	0.32
281	0.39
282	0.48
283	0.57
284	0.66
285	0.73
286	0.8
287	0.84
288	0.87
289	0.88
290	0.87
291	0.82
292	0.75
293	0.69
294	0.6
295	0.49
296	0.4
297	0.3
298	0.22
299	0.15
300	0.11
301	0.06
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.06
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.1
328	0.14
329	0.2
330	0.25
331	0.32
332	0.38
333	0.47
334	0.56
335	0.61
336	0.7
337	0.75
338	0.8
339	0.83
340	0.87
341	0.88
342	0.87
343	0.83
344	0.78
345	0.77
346	0.7
347	0.65
348	0.58
349	0.49
350	0.42
351	0.36
352	0.3
353	0.2
354	0.16
355	0.11
356	0.08
357	0.08
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.09
362	0.13
363	0.13
364	0.16
365	0.15
366	0.16
367	0.15
368	0.15
369	0.14
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.1
376	0.11
377	0.11
378	0.13
379	0.13
380	0.15
381	0.17
382	0.18
383	0.21
384	0.23
385	0.21
386	0.2
387	0.21
388	0.2
389	0.19
390	0.18
391	0.15
392	0.12
393	0.12
394	0.12
395	0.13
396	0.13
397	0.11
398	0.12
399	0.12
400	0.12
401	0.13
402	0.14
403	0.12
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.1
411	0.1
412	0.11
413	0.16
414	0.22
415	0.22
416	0.23
417	0.28
418	0.29
419	0.3
420	0.29
421	0.3
422	0.32
423	0.38
424	0.39
425	0.4
426	0.41
427	0.4
428	0.39
429	0.33
430	0.25
431	0.17
432	0.14
433	0.08
434	0.06
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.04
439	0.04
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.02
444	0.02
445	0.02
446	0.02
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.04
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.08
458	0.08
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.08
466	0.07
467	0.07
468	0.08
469	0.09
470	0.09
471	0.09
472	0.08
473	0.09
474	0.1
475	0.1
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.06
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.07
489	0.07
490	0.08
491	0.08
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.06
501	0.06
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.06
506	0.07
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.04
515	0.05
516	0.06
517	0.11
518	0.12
519	0.12
520	0.14
521	0.16
522	0.18
523	0.23
524	0.23
525	0.19
526	0.19
527	0.23
528	0.3
529	0.32
530	0.31
531	0.28
532	0.32
533	0.31
534	0.34
535	0.29
536	0.21
537	0.19
538	0.19
539	0.17
540	0.13
541	0.13
542	0.1
543	0.09
544	0.09
545	0.08
546	0.08
547	0.07
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.07
559	0.06
560	0.1
561	0.15
562	0.23
563	0.26
564	0.31
565	0.34
566	0.37
567	0.42
568	0.44
569	0.43
570	0.42
571	0.4
572	0.36
573	0.34
574	0.31
575	0.27
576	0.28
577	0.27
578	0.23
579	0.23
580	0.28
581	0.29
582	0.38
583	0.47
584	0.46
585	0.54
586	0.6
587	0.69
588	0.64
589	0.64
590	0.58
591	0.55
592	0.51
593	0.44
594	0.39
595	0.3
596	0.29
597	0.28
598	0.23
599	0.16
600	0.15
601	0.14
602	0.13
603	0.19
604	0.26
605	0.28
606	0.29
607	0.3
608	0.32
609	0.35
610	0.36
611	0.33
612	0.32
613	0.32
614	0.34
615	0.34
616	0.33
617	0.29
618	0.25
619	0.24
620	0.19
621	0.19
622	0.15
623	0.14
624	0.13
625	0.13
626	0.12
627	0.11
628	0.08
629	0.08
630	0.1
631	0.1
632	0.09
633	0.1
634	0.13
635	0.13
636	0.15
637	0.17
638	0.24
639	0.32
640	0.37
641	0.45
642	0.49
643	0.57
644	0.65
645	0.73
646	0.76
647	0.79
648	0.84
649	0.87
650	0.88
651	0.88
652	0.85
653	0.83
654	0.82
655	0.78
656	0.71
657	0.6
658	0.56
659	0.48
660	0.41
661	0.32
662	0.25
663	0.19
664	0.17
665	0.17
666	0.15
667	0.18
668	0.28
669	0.33
670	0.38
671	0.41
672	0.5
673	0.58
674	0.66
675	0.72
676	0.74
677	0.78
678	0.82
679	0.85
680	0.85
681	0.81
682	0.8
683	0.75
684	0.71
685	0.61
686	0.51
687	0.46
688	0.36
689	0.32
690	0.29
691	0.31
692	0.32
693	0.38
694	0.45
695	0.5
696	0.61
697	0.71
698	0.73
699	0.76
700	0.77
701	0.81
702	0.81
703	0.82
704	0.77
705	0.75
706	0.74
707	0.69
708	0.62
709	0.55
710	0.48
711	0.42
712	0.39
713	0.31
714	0.28
715	0.24
716	0.22
717	0.17
718	0.16
719	0.13
720	0.1
721	0.08
722	0.06
723	0.06
724	0.07
725	0.09
726	0.1
727	0.15
728	0.25
729	0.34
730	0.41
731	0.44
732	0.45
733	0.46
734	0.47
735	0.45
736	0.37
737	0.32
738	0.24
739	0.21
740	0.19
741	0.16
742	0.14
743	0.12
744	0.1
745	0.06
746	0.06
747	0.05
748	0.05
749	0.05
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.08
754	0.09
755	0.1
756	0.12
757	0.14
758	0.16
759	0.21
760	0.26
761	0.29
762	0.29
763	0.29
764	0.28
765	0.29
766	0.26
767	0.22
768	0.18
769	0.16
770	0.16
771	0.15
772	0.14
773	0.12
774	0.12
775	0.11
776	0.09
777	0.06
778	0.06
779	0.07
780	0.06
781	0.06
782	0.05
783	0.07
784	0.08
785	0.09
786	0.1
787	0.11
788	0.14
789	0.15
790	0.16
791	0.17
792	0.17
793	0.17
794	0.22
795	0.21
796	0.19
797	0.19
798	0.23
799	0.24
800	0.25
801	0.31
802	0.32
803	0.37
804	0.42
805	0.45
806	0.48
807	0.47
808	0.48
809	0.5
810	0.47
811	0.45
812	0.44
813	0.42
814	0.37
815	0.35
816	0.35
817	0.32
818	0.33
819	0.29
820	0.28
821	0.26
822	0.26
823	0.26
824	0.21
825	0.16
826	0.11
827	0.11
828	0.09
829	0.08
830	0.07
831	0.06
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.07
836	0.07
837	0.08
838	0.09
839	0.1
840	0.1
841	0.1
842	0.1
843	0.09
844	0.09
845	0.09
846	0.09
847	0.1
848	0.09
849	0.13
850	0.16
851	0.18
852	0.24
853	0.26
854	0.26
855	0.31
856	0.33
857	0.34
858	0.4
859	0.45
860	0.42
861	0.45
862	0.47
863	0.45
864	0.51
865	0.51
866	0.5
867	0.51
868	0.57
869	0.62

C9SYH6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer