Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SPS1

Protein Details
Accession C9SPS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MSDVNGRKRKRDGEGKSKPKKKTAIDBasic
64-86ITFRTYQKRQTAGRKSSRRHASEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-22RKRKRDGEGKSKPKKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG val:VDBG_06896  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MSDVNGRKRKRDGEGKSKPKKKTAIDGDVTEVPGTPIRIKSVKKAKYCPPVIVSAPGVRLDEDITFRTYQKRQTAGRKSSRRHASEQEITLHSTKHRTVDFTAREEEVDTRGEPYQQEYVALYNPKTGGLEVIAAKKMVVRGTVRAKQADEDAMIAPADIKDRKVDLGQTFGTRKAKKIIESNRINAIGPKRGEQDADGNAITAKLDSAEKATLSHIGQVTSTMASRDELQAAIDESKPVPRANLEADEVADVYDPKVIIGTDVLKAVPVRDWQEAVEKNENIDLASRYVARRIGRVGKQEKPLEKLRIMRYLYFLILFYVTAKDGRQRGTKRVPPKDQLAKNLSPAPQSVIDSIRRKFSDGGEIRKFHMDLIMTHCAALSCIIDNFETEPRDLREDLRLDSKTMNQYFQEIGAKIGQRKAAGEAKAQPVAKLAMPLVFPKMSRGAPMRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.86
3 0.89
4 0.9
5 0.87
6 0.85
7 0.84
8 0.79
9 0.79
10 0.78
11 0.77
12 0.74
13 0.69
14 0.65
15 0.59
16 0.53
17 0.42
18 0.32
19 0.23
20 0.2
21 0.19
22 0.18
23 0.17
24 0.22
25 0.28
26 0.31
27 0.39
28 0.48
29 0.54
30 0.59
31 0.65
32 0.69
33 0.73
34 0.75
35 0.71
36 0.64
37 0.61
38 0.55
39 0.51
40 0.45
41 0.37
42 0.35
43 0.3
44 0.27
45 0.22
46 0.2
47 0.18
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.26
55 0.29
56 0.35
57 0.4
58 0.45
59 0.5
60 0.59
61 0.68
62 0.72
63 0.78
64 0.8
65 0.78
66 0.81
67 0.83
68 0.78
69 0.74
70 0.71
71 0.69
72 0.67
73 0.65
74 0.6
75 0.52
76 0.5
77 0.44
78 0.38
79 0.31
80 0.28
81 0.27
82 0.27
83 0.26
84 0.27
85 0.29
86 0.38
87 0.4
88 0.39
89 0.4
90 0.35
91 0.34
92 0.32
93 0.29
94 0.21
95 0.19
96 0.15
97 0.14
98 0.15
99 0.16
100 0.15
101 0.17
102 0.18
103 0.16
104 0.17
105 0.15
106 0.15
107 0.18
108 0.2
109 0.17
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.16
114 0.14
115 0.11
116 0.09
117 0.11
118 0.11
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.14
124 0.15
125 0.13
126 0.15
127 0.13
128 0.19
129 0.27
130 0.33
131 0.35
132 0.35
133 0.35
134 0.33
135 0.33
136 0.28
137 0.21
138 0.16
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.08
144 0.07
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.18
153 0.16
154 0.19
155 0.2
156 0.22
157 0.22
158 0.26
159 0.32
160 0.28
161 0.29
162 0.32
163 0.34
164 0.34
165 0.42
166 0.46
167 0.49
168 0.53
169 0.54
170 0.51
171 0.49
172 0.46
173 0.4
174 0.34
175 0.3
176 0.26
177 0.26
178 0.24
179 0.23
180 0.24
181 0.21
182 0.22
183 0.17
184 0.19
185 0.16
186 0.14
187 0.13
188 0.13
189 0.11
190 0.07
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.1
201 0.1
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.11
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.12
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.1
238 0.08
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.13
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.21
262 0.24
263 0.27
264 0.3
265 0.27
266 0.26
267 0.27
268 0.26
269 0.19
270 0.18
271 0.14
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.13
277 0.17
278 0.16
279 0.17
280 0.21
281 0.28
282 0.31
283 0.4
284 0.44
285 0.46
286 0.53
287 0.58
288 0.57
289 0.54
290 0.56
291 0.52
292 0.5
293 0.51
294 0.48
295 0.5
296 0.48
297 0.44
298 0.4
299 0.37
300 0.33
301 0.26
302 0.22
303 0.15
304 0.13
305 0.11
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.14
312 0.17
313 0.21
314 0.29
315 0.32
316 0.4
317 0.5
318 0.57
319 0.62
320 0.69
321 0.72
322 0.69
323 0.75
324 0.76
325 0.71
326 0.72
327 0.69
328 0.61
329 0.57
330 0.57
331 0.49
332 0.41
333 0.37
334 0.31
335 0.26
336 0.25
337 0.24
338 0.22
339 0.28
340 0.33
341 0.33
342 0.37
343 0.36
344 0.37
345 0.37
346 0.35
347 0.38
348 0.38
349 0.46
350 0.46
351 0.47
352 0.47
353 0.48
354 0.46
355 0.35
356 0.33
357 0.25
358 0.2
359 0.25
360 0.28
361 0.24
362 0.24
363 0.24
364 0.21
365 0.2
366 0.18
367 0.12
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.13
374 0.16
375 0.17
376 0.16
377 0.2
378 0.21
379 0.25
380 0.26
381 0.25
382 0.28
383 0.29
384 0.32
385 0.36
386 0.34
387 0.33
388 0.34
389 0.38
390 0.4
391 0.4
392 0.4
393 0.33
394 0.35
395 0.34
396 0.34
397 0.33
398 0.24
399 0.24
400 0.26
401 0.3
402 0.31
403 0.34
404 0.33
405 0.29
406 0.3
407 0.34
408 0.36
409 0.34
410 0.35
411 0.38
412 0.41
413 0.46
414 0.45
415 0.39
416 0.35
417 0.35
418 0.3
419 0.26
420 0.21
421 0.18
422 0.19
423 0.21
424 0.23
425 0.23
426 0.22
427 0.23
428 0.27
429 0.25
430 0.3