Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHV5

Protein Details
Accession C9SHV5    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-63GRDHEPGTRSSRRRRRRKTIKPDAGLVKKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-55RSSRRRRRRKTIKP
Subcellular Location(s) plas 21, nucl 2.5, cyto_nucl 2, mito 1, E.R. 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038967  Dsc4-like  
IPR013715  DUF1746  
Gene Ontology GO:0044695  C:Dsc E3 ubiquitin ligase complex  
KEGG val:VDBG_04637  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08508  DUF1746  
Amino Acid Sequences MNDASPPISPASRTNSTANQRDETHVPNGPSSVGRDHEPGTRSSRRRRRRKTIKPDAGLVKKFDFVTHLLKNLDMLVYAELAAQYYMECSAVRFFMRAWCQQNFLSPKPDDWPIPLPAIQAQILSVFFPALLCVLAHIFESLPTAAETSRGYLHGGMIVDFIGQRPPASRLTLLALDLVILAVQGLMLAGHVERERLRLITRPKRSRLITALSEDLGAADSISEGREHHSDENHAAGVADGEENGGIEMQSLRRNDSQPLGAEGDTEERRPFLSDTPIALPTRRIALVDVMNSGNGMLRDLDVFHTLRNSTPDFWGAVGHALQSIGYQATLARIAGRARTLAFGSNQTAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.43
3 0.51
4 0.57
5 0.57
6 0.53
7 0.51
8 0.52
9 0.52
10 0.47
11 0.44
12 0.41
13 0.37
14 0.34
15 0.32
16 0.29
17 0.26
18 0.25
19 0.23
20 0.21
21 0.22
22 0.24
23 0.25
24 0.29
25 0.3
26 0.3
27 0.34
28 0.42
29 0.47
30 0.55
31 0.64
32 0.69
33 0.79
34 0.86
35 0.89
36 0.91
37 0.94
38 0.95
39 0.96
40 0.95
41 0.89
42 0.86
43 0.85
44 0.82
45 0.74
46 0.66
47 0.56
48 0.49
49 0.44
50 0.36
51 0.29
52 0.24
53 0.28
54 0.26
55 0.28
56 0.26
57 0.25
58 0.25
59 0.23
60 0.2
61 0.12
62 0.11
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.04
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.16
83 0.21
84 0.27
85 0.3
86 0.3
87 0.33
88 0.33
89 0.4
90 0.39
91 0.37
92 0.37
93 0.33
94 0.33
95 0.32
96 0.35
97 0.28
98 0.26
99 0.28
100 0.23
101 0.24
102 0.24
103 0.21
104 0.2
105 0.21
106 0.17
107 0.13
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.07
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.09
154 0.1
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.1
162 0.09
163 0.07
164 0.07
165 0.05
166 0.03
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.02
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.03
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.11
185 0.15
186 0.25
187 0.34
188 0.44
189 0.5
190 0.54
191 0.6
192 0.61
193 0.6
194 0.55
195 0.52
196 0.44
197 0.4
198 0.36
199 0.29
200 0.27
201 0.22
202 0.17
203 0.11
204 0.08
205 0.05
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.07
213 0.08
214 0.11
215 0.13
216 0.14
217 0.16
218 0.17
219 0.18
220 0.16
221 0.14
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.05
236 0.07
237 0.11
238 0.12
239 0.16
240 0.19
241 0.21
242 0.23
243 0.26
244 0.27
245 0.24
246 0.27
247 0.26
248 0.22
249 0.2
250 0.18
251 0.21
252 0.19
253 0.19
254 0.16
255 0.14
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.15
260 0.2
261 0.21
262 0.24
263 0.26
264 0.3
265 0.28
266 0.28
267 0.26
268 0.21
269 0.23
270 0.2
271 0.17
272 0.15
273 0.18
274 0.21
275 0.2
276 0.21
277 0.18
278 0.17
279 0.17
280 0.15
281 0.13
282 0.1
283 0.09
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.11
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.16
293 0.16
294 0.18
295 0.22
296 0.23
297 0.22
298 0.24
299 0.25
300 0.23
301 0.22
302 0.21
303 0.17
304 0.16
305 0.14
306 0.12
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.12
321 0.14
322 0.17
323 0.18
324 0.18
325 0.18
326 0.21
327 0.21
328 0.22
329 0.23
330 0.24