Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SVT5

Protein Details
Accession C9SVT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-41LEEIRKSRKRAATKFSKRRKTFLRRAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-36RKSRKRAATKFSKRRKTF
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
KEGG val:VDBG_09010  -  
Amino Acid Sequences MSERQQITPLKPYDLEEIRKSRKRAATKFSKRRKTFLRRAHDLSQDCQAKVYTFIEYNRRTWVFTSEPDQASFPPTKDEILRIYPLPEIFIPSMFSTLPQVHNDKHDVVDSALSDRFDTHAADQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.42
4 0.48
5 0.54
6 0.6
7 0.6
8 0.61
9 0.63
10 0.68
11 0.69
12 0.7
13 0.72
14 0.76
15 0.84
16 0.86
17 0.88
18 0.82
19 0.82
20 0.82
21 0.81
22 0.8
23 0.79
24 0.78
25 0.75
26 0.78
27 0.75
28 0.73
29 0.64
30 0.56
31 0.54
32 0.47
33 0.4
34 0.34
35 0.29
36 0.21
37 0.21
38 0.2
39 0.13
40 0.12
41 0.14
42 0.22
43 0.23
44 0.24
45 0.26
46 0.26
47 0.25
48 0.24
49 0.26
50 0.2
51 0.19
52 0.23
53 0.23
54 0.23
55 0.23
56 0.23
57 0.19
58 0.2
59 0.2
60 0.16
61 0.13
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.19
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.17
74 0.14
75 0.15
76 0.13
77 0.13
78 0.14
79 0.13
80 0.14
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.15
85 0.17
86 0.19
87 0.22
88 0.23
89 0.27
90 0.3
91 0.28
92 0.27
93 0.26
94 0.23
95 0.2
96 0.21
97 0.18
98 0.17
99 0.18
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.15