Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SBX0

Protein Details
Accession C9SBX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-399EEDVQRARKRRKINANDRGDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
385-390ARKRRK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 11, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR044635  UBP14-like  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
KEGG val:VDBG_01963  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00240  ubiquitin  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50053  UBIQUITIN_2  
PS00972  USP_1  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
CDD cd16104  Ubl_USP14_like  
Amino Acid Sequences MATIPIVVKHSGKKYDVEVDTTANGETLKYQLYSLTGVEPERQKILVRGGPLKDEADMSKLAFKPGQVIMMMGSPADGSATLTRPKEAIKFVEDMTEAEAAQQEGATPAGLINLGNTCYLNSTLQTLRSIPELQQSLTTYKAKGPAPRPVQGSLGLQPVSQADLATPLVDLYKMMAETQDSVAPHTFLTVLRSVYPQFAEKSKQGNGFAQQDAEEAWSQIVSQLKQRLGEGEDSSFIDKYMAGAMTSTLEADEQDARDGGEETSKSTETFFKLNCHIDGTINHLRDGIAAGLTEKIEKRSAVLDRDTNFTKKSQISRLPKYLTVHFVRFFWRRDTQKKAKIMRKVVFPHELDAVEFCNDELKSMLIPVRDKVREIRKDEEDVQRARKRRKINANDRGDVAGSSGAPQEKTALEKANEKKAPVSQLPKVSGDGDTEMTETYKTDAEFDAERDASLLTLKKELDGLINPALRQDEGANQSGLYELRGVVTHQGSSADSGHYTASARCHRHPSMAGGWWRVSLCAHPVVQGHSPADSRGAEQLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.49
3 0.48
4 0.45
5 0.4
6 0.36
7 0.35
8 0.32
9 0.27
10 0.19
11 0.16
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.14
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.23
26 0.26
27 0.26
28 0.27
29 0.27
30 0.26
31 0.28
32 0.34
33 0.31
34 0.33
35 0.37
36 0.37
37 0.39
38 0.4
39 0.37
40 0.3
41 0.29
42 0.24
43 0.2
44 0.2
45 0.17
46 0.22
47 0.22
48 0.24
49 0.23
50 0.22
51 0.24
52 0.24
53 0.25
54 0.18
55 0.18
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.1
60 0.09
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.06
66 0.09
67 0.12
68 0.17
69 0.18
70 0.19
71 0.2
72 0.23
73 0.25
74 0.27
75 0.28
76 0.26
77 0.28
78 0.27
79 0.3
80 0.28
81 0.24
82 0.22
83 0.19
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.13
110 0.15
111 0.16
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.2
117 0.17
118 0.22
119 0.22
120 0.2
121 0.22
122 0.24
123 0.22
124 0.25
125 0.26
126 0.2
127 0.21
128 0.27
129 0.27
130 0.33
131 0.36
132 0.42
133 0.45
134 0.5
135 0.5
136 0.46
137 0.44
138 0.39
139 0.37
140 0.3
141 0.28
142 0.23
143 0.19
144 0.18
145 0.16
146 0.15
147 0.13
148 0.1
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.13
180 0.14
181 0.14
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.16
186 0.19
187 0.21
188 0.24
189 0.27
190 0.3
191 0.3
192 0.31
193 0.32
194 0.33
195 0.3
196 0.26
197 0.22
198 0.18
199 0.16
200 0.15
201 0.11
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.08
207 0.1
208 0.09
209 0.13
210 0.18
211 0.19
212 0.2
213 0.2
214 0.2
215 0.19
216 0.21
217 0.18
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.13
223 0.11
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.13
255 0.12
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.19
260 0.2
261 0.2
262 0.19
263 0.18
264 0.16
265 0.16
266 0.21
267 0.23
268 0.22
269 0.21
270 0.2
271 0.19
272 0.18
273 0.18
274 0.1
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.14
287 0.17
288 0.18
289 0.21
290 0.23
291 0.23
292 0.27
293 0.29
294 0.26
295 0.24
296 0.22
297 0.24
298 0.24
299 0.27
300 0.31
301 0.38
302 0.45
303 0.5
304 0.56
305 0.54
306 0.54
307 0.52
308 0.47
309 0.45
310 0.4
311 0.36
312 0.31
313 0.29
314 0.31
315 0.32
316 0.31
317 0.3
318 0.34
319 0.39
320 0.45
321 0.54
322 0.58
323 0.62
324 0.68
325 0.72
326 0.72
327 0.73
328 0.75
329 0.7
330 0.69
331 0.66
332 0.62
333 0.59
334 0.53
335 0.46
336 0.39
337 0.34
338 0.26
339 0.22
340 0.18
341 0.11
342 0.11
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.1
351 0.12
352 0.11
353 0.12
354 0.14
355 0.21
356 0.21
357 0.23
358 0.29
359 0.37
360 0.43
361 0.47
362 0.51
363 0.47
364 0.52
365 0.57
366 0.58
367 0.54
368 0.51
369 0.55
370 0.55
371 0.59
372 0.62
373 0.62
374 0.62
375 0.66
376 0.72
377 0.74
378 0.79
379 0.82
380 0.82
381 0.78
382 0.71
383 0.62
384 0.51
385 0.4
386 0.29
387 0.2
388 0.11
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.15
397 0.17
398 0.2
399 0.2
400 0.29
401 0.34
402 0.42
403 0.43
404 0.41
405 0.41
406 0.4
407 0.45
408 0.43
409 0.45
410 0.41
411 0.45
412 0.48
413 0.46
414 0.43
415 0.38
416 0.32
417 0.27
418 0.23
419 0.18
420 0.15
421 0.15
422 0.13
423 0.12
424 0.12
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.11
430 0.12
431 0.14
432 0.15
433 0.16
434 0.19
435 0.17
436 0.17
437 0.16
438 0.15
439 0.13
440 0.14
441 0.16
442 0.12
443 0.16
444 0.16
445 0.16
446 0.17
447 0.17
448 0.18
449 0.17
450 0.2
451 0.22
452 0.24
453 0.24
454 0.24
455 0.25
456 0.21
457 0.2
458 0.17
459 0.19
460 0.21
461 0.24
462 0.22
463 0.21
464 0.21
465 0.21
466 0.2
467 0.13
468 0.1
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.14
474 0.15
475 0.15
476 0.15
477 0.16
478 0.15
479 0.17
480 0.18
481 0.14
482 0.13
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.14
487 0.14
488 0.2
489 0.27
490 0.33
491 0.37
492 0.45
493 0.46
494 0.52
495 0.53
496 0.51
497 0.49
498 0.52
499 0.52
500 0.48
501 0.46
502 0.43
503 0.4
504 0.34
505 0.28
506 0.23
507 0.22
508 0.23
509 0.22
510 0.23
511 0.24
512 0.28
513 0.31
514 0.33
515 0.29
516 0.27
517 0.28
518 0.25
519 0.28
520 0.24
521 0.22