Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S697

Protein Details
Accession C9S697    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-150AASKKVEKPQPKTPRAPKEAHydrophilic
461-480LTGLVRKKKKDDDAQPAEQTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 13.333, nucl 10.5, mito_nucl 6.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG val:VDBG_00517  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MADAPEKQQEQQPPVPAEEAPLVLPPINEAVAAIIDEAKTGASTPSSIGAQSDHDILSKKVTLADLTAKATAMYARKEYDEAAEVFAAAAELQADINGEENQPDNAEILFLYGRTLFKVGQTKSDVLGGQAASKKVEKPQPKTPRAPKEAPAEAAAAEDAKTTEQKVTQEGLAVVAEQTDGAKKAETVDNKKPLFQFEGDENFEDSDDEVAEGEGEEDGEEEVDDLQAAFDILEMARISLEKKLEQVKQQESEDPTKGKEVSEGDSGILRHVKERLADTHDLLAEISLENERFPAAVRDSRISLQFKKELYPQESEVIAEAHFKLSLALEFASATTTQEDGAAEGEQAPFDEKLREEAITELEAAIQSTKLKLQAKEVELAEMANPEENVATKAQISDVRDIIDDMEQRLTEMRKPQVDFKAALEAAAGTAIQGIMGSALGESASETQARVEEAKKNATDLTGLVRKKKKDDDAQPAEQTNVQRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.48
3 0.42
4 0.37
5 0.31
6 0.26
7 0.19
8 0.17
9 0.16
10 0.15
11 0.15
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.11
16 0.1
17 0.09
18 0.08
19 0.09
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.09
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.14
38 0.15
39 0.16
40 0.14
41 0.15
42 0.17
43 0.17
44 0.2
45 0.19
46 0.18
47 0.18
48 0.19
49 0.17
50 0.18
51 0.24
52 0.23
53 0.23
54 0.23
55 0.21
56 0.2
57 0.19
58 0.2
59 0.18
60 0.18
61 0.19
62 0.2
63 0.22
64 0.23
65 0.23
66 0.22
67 0.22
68 0.2
69 0.19
70 0.17
71 0.15
72 0.14
73 0.13
74 0.1
75 0.06
76 0.05
77 0.03
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.06
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.07
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.11
103 0.1
104 0.15
105 0.23
106 0.23
107 0.27
108 0.31
109 0.31
110 0.31
111 0.33
112 0.28
113 0.2
114 0.22
115 0.16
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.19
121 0.2
122 0.24
123 0.32
124 0.37
125 0.41
126 0.51
127 0.6
128 0.66
129 0.75
130 0.78
131 0.8
132 0.79
133 0.78
134 0.73
135 0.7
136 0.66
137 0.57
138 0.49
139 0.39
140 0.3
141 0.26
142 0.2
143 0.12
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.09
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.16
155 0.15
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.11
160 0.1
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.09
172 0.14
173 0.2
174 0.26
175 0.33
176 0.42
177 0.42
178 0.45
179 0.43
180 0.41
181 0.38
182 0.32
183 0.26
184 0.21
185 0.26
186 0.24
187 0.24
188 0.22
189 0.19
190 0.18
191 0.16
192 0.12
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.02
217 0.02
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.11
230 0.17
231 0.2
232 0.24
233 0.3
234 0.32
235 0.34
236 0.35
237 0.36
238 0.34
239 0.35
240 0.33
241 0.28
242 0.24
243 0.23
244 0.22
245 0.18
246 0.18
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.13
255 0.14
256 0.11
257 0.1
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.15
262 0.17
263 0.2
264 0.22
265 0.21
266 0.22
267 0.21
268 0.19
269 0.17
270 0.13
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.08
282 0.1
283 0.13
284 0.15
285 0.17
286 0.19
287 0.21
288 0.25
289 0.27
290 0.27
291 0.29
292 0.31
293 0.3
294 0.31
295 0.35
296 0.36
297 0.36
298 0.36
299 0.33
300 0.31
301 0.3
302 0.28
303 0.23
304 0.17
305 0.13
306 0.11
307 0.1
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.1
339 0.1
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.13
344 0.14
345 0.15
346 0.13
347 0.13
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.09
357 0.15
358 0.2
359 0.21
360 0.28
361 0.35
362 0.37
363 0.42
364 0.4
365 0.36
366 0.3
367 0.3
368 0.23
369 0.16
370 0.14
371 0.09
372 0.09
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.12
382 0.15
383 0.17
384 0.19
385 0.2
386 0.2
387 0.2
388 0.2
389 0.19
390 0.19
391 0.17
392 0.15
393 0.16
394 0.15
395 0.15
396 0.19
397 0.19
398 0.2
399 0.26
400 0.31
401 0.35
402 0.38
403 0.45
404 0.5
405 0.52
406 0.49
407 0.44
408 0.46
409 0.39
410 0.37
411 0.29
412 0.21
413 0.17
414 0.16
415 0.13
416 0.04
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.05
430 0.06
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.09
435 0.11
436 0.13
437 0.15
438 0.17
439 0.23
440 0.28
441 0.35
442 0.34
443 0.35
444 0.34
445 0.32
446 0.29
447 0.23
448 0.27
449 0.28
450 0.3
451 0.38
452 0.44
453 0.48
454 0.55
455 0.64
456 0.65
457 0.68
458 0.75
459 0.77
460 0.79
461 0.82
462 0.79
463 0.72
464 0.64
465 0.57