FuNGI

C9SAH9

Protein Details

Accession

C9SAH9

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
200-223	ADDGKKSKRDRDGKSNKSPEKPKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
168-224	EKKANRAKEAAAAKSAKHARQESQSTKNSKANADDGKKSKRDRDGKSNKSPEKPKET
343-359	PKSGRSRRGGGGGKNSA

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	val:VDBG_01536 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MQDSQASRKANGVLPMPANSSATDAPSASRSNKSKTPVEGDKVSQDPAKSSRPGRLYLHVKKRESLAELDEIVQTRTWEDAKLTHNNPCLVGPPSLEYCIYKKIPGARKRSDARQGTIDQDPEFMSYLLSLTNPETEKEGETGEDPSAGESKPDTKVTTTPLIEYIKEKKANRAKEAAAAKSAKHARQESQSTKNSKANADDGKKSKRDRDGKSNKSPEKPKETVRILTKKATAEAAKAAESAASQINEATAAAASSSEAPKSRRANIAAAARLLQRDLGLSPGSAHRRARLNAAKTEAESKTSSIKEASTAASEATPAASSSTPSPATAAQSAEKPATPTAPKSGRSRRGGGGGKNSAEAKNKGAENTTAPAASAPAKTPVVLLRKKETAPAPQAAAATTAATTTSETATPAAAAAAAAAGPNRPRHPQGVTEALLKATLETFGVVTFVEIDRRKGFAYVDFADHASLVRAITGSPVTVAQGTVQVLERKEKKPAGGGGGGGGGGTAAAASSSAAASGTGTAAPAASTTTATPAASSSSGPAEKTEHTGSGEISRWPPFEQALPQSSSSSVDTPTSSQIHSHVSRVSGTLGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.36
3	0.35
4	0.32
5	0.29
6	0.25
7	0.25
8	0.21
9	0.2
10	0.19
11	0.16
12	0.17
13	0.19
14	0.23
15	0.23
16	0.3
17	0.33
18	0.39
19	0.44
20	0.49
21	0.52
22	0.54
23	0.59
24	0.59
25	0.6
26	0.59
27	0.56
28	0.56
29	0.51
30	0.48
31	0.42
32	0.35
33	0.33
34	0.33
35	0.36
36	0.36
37	0.37
38	0.42
39	0.43
40	0.48
41	0.48
42	0.52
43	0.56
44	0.6
45	0.68
46	0.69
47	0.68
48	0.65
49	0.66
50	0.61
51	0.54
52	0.48
53	0.41
54	0.35
55	0.34
56	0.32
57	0.3
58	0.26
59	0.23
60	0.2
61	0.16
62	0.13
63	0.15
64	0.14
65	0.13
66	0.14
67	0.18
68	0.23
69	0.32
70	0.34
71	0.38
72	0.42
73	0.42
74	0.42
75	0.37
76	0.35
77	0.29
78	0.27
79	0.21
80	0.2
81	0.21
82	0.21
83	0.22
84	0.2
85	0.2
86	0.26
87	0.26
88	0.24
89	0.25
90	0.33
91	0.42
92	0.48
93	0.55
94	0.55
95	0.63
96	0.68
97	0.73
98	0.74
99	0.7
100	0.66
101	0.63
102	0.58
103	0.54
104	0.51
105	0.45
106	0.35
107	0.3
108	0.27
109	0.21
110	0.2
111	0.15
112	0.11
113	0.09
114	0.09
115	0.08
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.11
120	0.12
121	0.13
122	0.15
123	0.16
124	0.17
125	0.17
126	0.16
127	0.13
128	0.13
129	0.14
130	0.12
131	0.12
132	0.1
133	0.1
134	0.12
135	0.11
136	0.1
137	0.1
138	0.13
139	0.16
140	0.18
141	0.18
142	0.18
143	0.21
144	0.25
145	0.3
146	0.28
147	0.25
148	0.28
149	0.28
150	0.27
151	0.29
152	0.31
153	0.31
154	0.38
155	0.38
156	0.43
157	0.49
158	0.56
159	0.56
160	0.56
161	0.5
162	0.5
163	0.54
164	0.46
165	0.44
166	0.38
167	0.33
168	0.35
169	0.39
170	0.34
171	0.36
172	0.37
173	0.35
174	0.41
175	0.5
176	0.48
177	0.52
178	0.56
179	0.54
180	0.57
181	0.57
182	0.52
183	0.45
184	0.42
185	0.39
186	0.4
187	0.4
188	0.42
189	0.45
190	0.49
191	0.53
192	0.54
193	0.54
194	0.56
195	0.61
196	0.61
197	0.66
198	0.7
199	0.73
200	0.8
201	0.83
202	0.8
203	0.79
204	0.8
205	0.76
206	0.74
207	0.69
208	0.64
209	0.63
210	0.61
211	0.59
212	0.59
213	0.6
214	0.53
215	0.53
216	0.51
217	0.43
218	0.4
219	0.37
220	0.29
221	0.22
222	0.22
223	0.19
224	0.16
225	0.15
226	0.14
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.08
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.05
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.05
244	0.05
245	0.06
246	0.08
247	0.1
248	0.17
249	0.2
250	0.24
251	0.27
252	0.29
253	0.3
254	0.33
255	0.36
256	0.31
257	0.28
258	0.25
259	0.22
260	0.19
261	0.17
262	0.12
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.11
271	0.14
272	0.17
273	0.17
274	0.19
275	0.23
276	0.24
277	0.32
278	0.34
279	0.35
280	0.35
281	0.38
282	0.35
283	0.31
284	0.35
285	0.27
286	0.23
287	0.2
288	0.18
289	0.19
290	0.18
291	0.19
292	0.14
293	0.14
294	0.13
295	0.13
296	0.13
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.08
302	0.07
303	0.06
304	0.05
305	0.04
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.07
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.11
314	0.1
315	0.12
316	0.13
317	0.13
318	0.11
319	0.12
320	0.13
321	0.13
322	0.13
323	0.12
324	0.11
325	0.13
326	0.14
327	0.14
328	0.2
329	0.24
330	0.27
331	0.34
332	0.43
333	0.48
334	0.51
335	0.54
336	0.48
337	0.52
338	0.54
339	0.49
340	0.48
341	0.42
342	0.39
343	0.37
344	0.36
345	0.31
346	0.3
347	0.28
348	0.22
349	0.23
350	0.23
351	0.22
352	0.22
353	0.2
354	0.18
355	0.19
356	0.18
357	0.13
358	0.12
359	0.11
360	0.11
361	0.12
362	0.11
363	0.09
364	0.12
365	0.12
366	0.12
367	0.13
368	0.17
369	0.23
370	0.26
371	0.29
372	0.3
373	0.34
374	0.34
375	0.38
376	0.37
377	0.36
378	0.37
379	0.36
380	0.33
381	0.31
382	0.3
383	0.26
384	0.23
385	0.16
386	0.11
387	0.09
388	0.07
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.08
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.04
402	0.04
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.05
409	0.07
410	0.11
411	0.14
412	0.18
413	0.2
414	0.24
415	0.27
416	0.3
417	0.33
418	0.36
419	0.35
420	0.34
421	0.32
422	0.28
423	0.26
424	0.21
425	0.16
426	0.1
427	0.08
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.06
436	0.06
437	0.12
438	0.13
439	0.16
440	0.18
441	0.19
442	0.2
443	0.2
444	0.21
445	0.18
446	0.23
447	0.22
448	0.23
449	0.22
450	0.22
451	0.21
452	0.2
453	0.16
454	0.11
455	0.1
456	0.07
457	0.07
458	0.06
459	0.06
460	0.08
461	0.08
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.07
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.13
473	0.16
474	0.17
475	0.25
476	0.31
477	0.31
478	0.39
479	0.4
480	0.4
481	0.43
482	0.45
483	0.43
484	0.38
485	0.36
486	0.29
487	0.26
488	0.24
489	0.17
490	0.12
491	0.06
492	0.04
493	0.03
494	0.02
495	0.02
496	0.02
497	0.02
498	0.02
499	0.03
500	0.03
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.05
506	0.06
507	0.05
508	0.06
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.06
514	0.06
515	0.07
516	0.07
517	0.1
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.11
522	0.13
523	0.13
524	0.13
525	0.12
526	0.16
527	0.18
528	0.18
529	0.19
530	0.2
531	0.21
532	0.26
533	0.27
534	0.24
535	0.24
536	0.25
537	0.25
538	0.26
539	0.27
540	0.25
541	0.26
542	0.27
543	0.27
544	0.27
545	0.28
546	0.25
547	0.27
548	0.3
549	0.34
550	0.35
551	0.37
552	0.37
553	0.36
554	0.35
555	0.34
556	0.3
557	0.24
558	0.21
559	0.19
560	0.2
561	0.2
562	0.25
563	0.25
564	0.23
565	0.23
566	0.24
567	0.3
568	0.3
569	0.32
570	0.29
571	0.28
572	0.29
573	0.29

C9SAH9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer