FuNGI

C9SJH6

Protein Details

Accession

C9SJH6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
47-67	LQGRPSRITKPNKRSMPPAFS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
50-59	RPSRITKPNK

Subcellular Location(s)

cyto 13, nucl 10, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036420 BRCT_dom_sf IPR002054 DNA-dir_DNA_pol_X IPR028207 DNA_pol_B_palm_palm IPR018944 DNA_pol_lambd_fingers_domain IPR037160 DNA_Pol_thumb_sf IPR022312 DNA_pol_X IPR002008 DNA_pol_X_beta-like IPR043519 NT_sf IPR029398 PolB_thumb
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0006281 P:DNA repair
KEGG	val:VDBG_04447 -
Pfam	View protein in Pfam PF14792 DNA_pol_B_palm PF14791 DNA_pol_B_thumb PF10391 DNA_pol_lambd_f
CDD	cd00141 NT_POLXc

Amino Acid Sequences

MSSREPSLADKEVFFAELWALGADLNSEEDAIDEVEAERGRRSRLALQGRPSRITKPNKRSMPPAFSVSKSPVSASHPRRTASSPLPAKEPPTAKTIERTPLAAMRRPGKEAAEDSPSVVEETPIPDSTRAPCQPIHLLRTTSTPNPPMRQLHPPPHRDESPSLNATVKKRKRDAPVKLVPAQQQIFREQHFFFIPNDDIAPARRIRIRKAQEYGASWTRSLDRASHVIVDKGLSWKNIEPIVTSAGGAGTAVVVNETYPLDCIQFRSVLNPKQKQYLVTGYPSEQLVEAPGVAAPSDVSVPAGSPASLQLKPPPNNPKRFGYVPPPSTCSQSEQSAEEAQNELAVPGAPETSAAHEAEMEDELAELISQMQEFRDVPSDSDDDNGDGDAPIAGSSEPLSDAEHSDGEPSGKKQRPVRATRPHGRLLWPHQRHVATHCLPQGHPRSSSGRRAKYRRLPTPSVCPVSVRARRQDEEIVTTDRLRRLEHAERDPADETLQRFVRIYGVGNAQASRWIAQGHRTLDDLRARAVLSANQRIGIDHYDDLNTRIPRREVEALAAVVRSAAAALDPSVELIVGGSYRRGAASSGDIDLIVTREGTTSARELLPFLTRLTRTLEARGFLVAALATSRDDDAGGGTKWHGCCVLPEPEAARLHLGEGVGSERGSDPGAPSPATPYRPVWRRIDFLVVPAAELGAALLYFTGNDIFNRSMRLLAARKGMRLNQRGLYRDVLRGPDRAKVTDGALLEGRDERRIFALLNVTWREPHERWC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.18
3	0.12
4	0.11
5	0.11
6	0.09
7	0.08
8	0.07
9	0.07
10	0.07
11	0.07
12	0.07
13	0.07
14	0.07
15	0.07
16	0.07
17	0.08
18	0.08
19	0.07
20	0.06
21	0.07
22	0.11
23	0.12
24	0.13
25	0.16
26	0.18
27	0.21
28	0.23
29	0.27
30	0.31
31	0.4
32	0.49
33	0.52
34	0.59
35	0.66
36	0.68
37	0.69
38	0.64
39	0.62
40	0.61
41	0.65
42	0.66
43	0.67
44	0.73
45	0.77
46	0.79
47	0.81
48	0.81
49	0.78
50	0.71
51	0.68
52	0.61
53	0.54
54	0.54
55	0.5
56	0.45
57	0.37
58	0.34
59	0.31
60	0.34
61	0.42
62	0.45
63	0.49
64	0.49
65	0.5
66	0.53
67	0.53
68	0.54
69	0.5
70	0.53
71	0.51
72	0.48
73	0.52
74	0.51
75	0.5
76	0.5
77	0.47
78	0.39
79	0.36
80	0.37
81	0.33
82	0.37
83	0.4
84	0.39
85	0.37
86	0.36
87	0.34
88	0.37
89	0.4
90	0.39
91	0.4
92	0.4
93	0.42
94	0.43
95	0.43
96	0.39
97	0.38
98	0.36
99	0.34
100	0.32
101	0.29
102	0.27
103	0.26
104	0.24
105	0.21
106	0.18
107	0.14
108	0.1
109	0.12
110	0.14
111	0.15
112	0.16
113	0.16
114	0.18
115	0.2
116	0.28
117	0.28
118	0.28
119	0.27
120	0.3
121	0.38
122	0.42
123	0.44
124	0.4
125	0.4
126	0.38
127	0.41
128	0.42
129	0.37
130	0.38
131	0.39
132	0.4
133	0.42
134	0.47
135	0.47
136	0.47
137	0.53
138	0.55
139	0.59
140	0.62
141	0.64
142	0.65
143	0.67
144	0.65
145	0.6
146	0.56
147	0.52
148	0.51
149	0.47
150	0.42
151	0.38
152	0.41
153	0.42
154	0.49
155	0.49
156	0.5
157	0.55
158	0.61
159	0.67
160	0.73
161	0.76
162	0.75
163	0.78
164	0.76
165	0.75
166	0.73
167	0.66
168	0.63
169	0.55
170	0.48
171	0.41
172	0.39
173	0.37
174	0.33
175	0.34
176	0.27
177	0.28
178	0.26
179	0.26
180	0.21
181	0.22
182	0.22
183	0.18
184	0.18
185	0.15
186	0.14
187	0.15
188	0.18
189	0.14
190	0.16
191	0.21
192	0.23
193	0.28
194	0.38
195	0.44
196	0.48
197	0.51
198	0.54
199	0.53
200	0.54
201	0.54
202	0.5
203	0.44
204	0.36
205	0.33
206	0.29
207	0.27
208	0.25
209	0.2
210	0.17
211	0.19
212	0.2
213	0.22
214	0.21
215	0.2
216	0.19
217	0.18
218	0.16
219	0.17
220	0.18
221	0.15
222	0.16
223	0.17
224	0.19
225	0.2
226	0.19
227	0.16
228	0.16
229	0.18
230	0.15
231	0.14
232	0.11
233	0.09
234	0.09
235	0.07
236	0.06
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.1
251	0.1
252	0.13
253	0.13
254	0.18
255	0.24
256	0.3
257	0.39
258	0.43
259	0.43
260	0.47
261	0.48
262	0.44
263	0.42
264	0.41
265	0.35
266	0.31
267	0.31
268	0.26
269	0.26
270	0.24
271	0.2
272	0.14
273	0.11
274	0.09
275	0.08
276	0.06
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.03
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.07
294	0.11
295	0.12
296	0.12
297	0.18
298	0.27
299	0.29
300	0.36
301	0.45
302	0.49
303	0.56
304	0.59
305	0.57
306	0.53
307	0.55
308	0.51
309	0.49
310	0.49
311	0.47
312	0.45
313	0.45
314	0.4
315	0.4
316	0.38
317	0.33
318	0.27
319	0.25
320	0.24
321	0.21
322	0.22
323	0.22
324	0.22
325	0.18
326	0.16
327	0.13
328	0.12
329	0.11
330	0.09
331	0.06
332	0.05
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.03
337	0.04
338	0.04
339	0.06
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.06
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.1
363	0.1
364	0.1
365	0.13
366	0.15
367	0.13
368	0.14
369	0.13
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.06
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.08
396	0.1
397	0.18
398	0.21
399	0.25
400	0.3
401	0.38
402	0.46
403	0.53
404	0.61
405	0.62
406	0.69
407	0.73
408	0.73
409	0.7
410	0.62
411	0.57
412	0.52
413	0.5
414	0.52
415	0.46
416	0.43
417	0.44
418	0.43
419	0.41
420	0.39
421	0.39
422	0.3
423	0.31
424	0.31
425	0.28
426	0.27
427	0.33
428	0.37
429	0.31
430	0.3
431	0.29
432	0.34
433	0.36
434	0.46
435	0.48
436	0.5
437	0.56
438	0.61
439	0.68
440	0.7
441	0.75
442	0.74
443	0.73
444	0.71
445	0.66
446	0.69
447	0.67
448	0.6
449	0.51
450	0.43
451	0.39
452	0.42
453	0.45
454	0.4
455	0.41
456	0.43
457	0.43
458	0.46
459	0.46
460	0.38
461	0.35
462	0.34
463	0.3
464	0.25
465	0.26
466	0.26
467	0.24
468	0.23
469	0.2
470	0.2
471	0.24
472	0.31
473	0.37
474	0.39
475	0.42
476	0.42
477	0.44
478	0.43
479	0.36
480	0.29
481	0.25
482	0.21
483	0.21
484	0.21
485	0.18
486	0.17
487	0.17
488	0.18
489	0.16
490	0.16
491	0.13
492	0.14
493	0.15
494	0.15
495	0.15
496	0.13
497	0.15
498	0.14
499	0.12
500	0.1
501	0.1
502	0.1
503	0.15
504	0.21
505	0.21
506	0.21
507	0.22
508	0.22
509	0.26
510	0.3
511	0.26
512	0.21
513	0.2
514	0.19
515	0.18
516	0.18
517	0.18
518	0.19
519	0.24
520	0.23
521	0.23
522	0.23
523	0.22
524	0.23
525	0.21
526	0.18
527	0.13
528	0.14
529	0.14
530	0.15
531	0.16
532	0.21
533	0.21
534	0.21
535	0.25
536	0.25
537	0.25
538	0.3
539	0.32
540	0.27
541	0.27
542	0.27
543	0.24
544	0.23
545	0.22
546	0.16
547	0.11
548	0.1
549	0.07
550	0.04
551	0.03
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.04
556	0.04
557	0.05
558	0.05
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.07
571	0.08
572	0.12
573	0.13
574	0.13
575	0.13
576	0.13
577	0.12
578	0.12
579	0.11
580	0.08
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.08
586	0.09
587	0.1
588	0.12
589	0.13
590	0.13
591	0.13
592	0.14
593	0.17
594	0.16
595	0.16
596	0.19
597	0.18
598	0.2
599	0.25
600	0.27
601	0.26
602	0.31
603	0.32
604	0.28
605	0.28
606	0.27
607	0.21
608	0.17
609	0.15
610	0.09
611	0.07
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.08
621	0.1
622	0.1
623	0.1
624	0.11
625	0.16
626	0.16
627	0.17
628	0.16
629	0.13
630	0.16
631	0.2
632	0.26
633	0.22
634	0.24
635	0.25
636	0.3
637	0.31
638	0.29
639	0.26
640	0.19
641	0.19
642	0.19
643	0.17
644	0.11
645	0.1
646	0.11
647	0.1
648	0.1
649	0.1
650	0.09
651	0.1
652	0.11
653	0.1
654	0.11
655	0.15
656	0.18
657	0.17
658	0.17
659	0.22
660	0.27
661	0.29
662	0.31
663	0.3
664	0.38
665	0.45
666	0.51
667	0.52
668	0.52
669	0.53
670	0.52
671	0.56
672	0.46
673	0.41
674	0.42
675	0.34
676	0.29
677	0.25
678	0.22
679	0.13
680	0.13
681	0.1
682	0.04
683	0.03
684	0.03
685	0.03
686	0.03
687	0.03
688	0.04
689	0.06
690	0.06
691	0.07
692	0.11
693	0.14
694	0.15
695	0.18
696	0.18
697	0.18
698	0.18
699	0.26
700	0.26
701	0.28
702	0.37
703	0.36
704	0.39
705	0.43
706	0.49
707	0.52
708	0.54
709	0.55
710	0.52
711	0.57
712	0.57
713	0.55
714	0.55
715	0.48
716	0.47
717	0.46
718	0.46
719	0.42
720	0.44
721	0.42
722	0.42
723	0.42
724	0.39
725	0.38
726	0.33
727	0.32
728	0.31
729	0.29
730	0.26
731	0.24
732	0.22
733	0.21
734	0.24
735	0.24
736	0.25
737	0.25
738	0.23
739	0.23
740	0.25
741	0.24
742	0.22
743	0.28
744	0.25
745	0.32
746	0.34
747	0.33
748	0.33
749	0.35
750	0.4

C9SJH6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer