Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SH89

Protein Details
Accession C9SH89    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-162TPEQTFHPKRNQARQKLSSLHydrophilic
842-866GCGRRLCRPSPSRLRGRPRSLCSGLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013724  GIT_SHD  
IPR039892  Spa2/Sph1  
Gene Ontology GO:0110165  C:cellular anatomical entity  
KEGG val:VDBG_03792  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08518  GIT_SHD  
Amino Acid Sequences MADDGFNRGNLVSPPNSGGSNGVMNGGFSSGPRSTGGPSPPPSIGRSSNGTNLYARSESGRSQREEHVEAVLGQHYIALKDYLSGRDGNTSKPLNKAQDKLLRLSAVQFLELSTDVFDELLRRQALARRPPGPNGQGPPPYLTPEQTFHPKRNQARQKLSSLGPPRFRDLATDVYVELERRYPRFAAGDIPRPGSNMSMRVPPSRSGTPLSGMQNGFPPRNQSRMRRPSDASSIRGAMPPQDPYGVPPSPGLPNGDYGRPMQKQFQSNTIVPNKSTMVEEDDDGSPDNDEDRDAFGLDKNGNRTSDKSQRTTETSEADKKMLEEYRNQVKDLTERLDIMEEAVKRKDDELAGVLDGERSRASANNMEKQEWTDLRTNLENQLADAQGLNDSLRQELDRAQGDQVHARNDYDRLRNEHDRIQDDMDRIRDGHANEIRDLRDQLEEMRQKSMNVNVMQASTSSNAPSDPELIQENQQLRQALEEQQQLRNFRASSLGLTIDQDAGKYVREKGFTEENGLVKDVHVTKFQISIDELLQRARADDPEKIIDAMKHVVVSVRRITKDMAESPPHDETVAQEQAKLKGKVSSTANAMITASKNFAASAGISPVSLLDAAASHLVAAVVDLLRTVKIRATPAGELEDDDDGTITPVDSTGFFSPRTNSIQQPISAQDLPPPPPFQGLGANRASVDSSAYSPVSSPRQSADPYGRRPVSRGANGMGNGTGNGMGYMGMNKAQPPAPANNYGGQSDSRYEDLKIYLEDQTAILVQNIQNLVGSIRSDATISQISSEIDGITNVVSKVVAETESTGNGNLTARLATCRDRLLEANDRGIDLSSSGPTNGTGGCGRRLCRPSPSRLRGRPRSLCSGLTDSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.25
4 0.23
5 0.22
6 0.19
7 0.19
8 0.17
9 0.17
10 0.15
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.11
15 0.09
16 0.14
17 0.12
18 0.14
19 0.15
20 0.16
21 0.18
22 0.25
23 0.3
24 0.33
25 0.37
26 0.39
27 0.41
28 0.42
29 0.42
30 0.42
31 0.4
32 0.36
33 0.37
34 0.37
35 0.4
36 0.4
37 0.4
38 0.36
39 0.34
40 0.34
41 0.3
42 0.27
43 0.24
44 0.24
45 0.27
46 0.34
47 0.4
48 0.39
49 0.42
50 0.48
51 0.51
52 0.51
53 0.47
54 0.4
55 0.34
56 0.31
57 0.28
58 0.23
59 0.16
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.12
65 0.1
66 0.09
67 0.12
68 0.15
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.17
73 0.25
74 0.26
75 0.26
76 0.31
77 0.35
78 0.35
79 0.41
80 0.47
81 0.48
82 0.53
83 0.54
84 0.56
85 0.59
86 0.59
87 0.57
88 0.54
89 0.46
90 0.4
91 0.39
92 0.35
93 0.27
94 0.25
95 0.2
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.14
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.15
108 0.14
109 0.15
110 0.17
111 0.23
112 0.32
113 0.39
114 0.45
115 0.47
116 0.5
117 0.54
118 0.6
119 0.59
120 0.58
121 0.53
122 0.53
123 0.51
124 0.49
125 0.49
126 0.42
127 0.41
128 0.36
129 0.34
130 0.3
131 0.27
132 0.31
133 0.37
134 0.4
135 0.4
136 0.48
137 0.54
138 0.59
139 0.68
140 0.74
141 0.74
142 0.8
143 0.8
144 0.76
145 0.73
146 0.66
147 0.64
148 0.62
149 0.6
150 0.57
151 0.54
152 0.53
153 0.5
154 0.48
155 0.43
156 0.38
157 0.36
158 0.3
159 0.28
160 0.23
161 0.23
162 0.24
163 0.21
164 0.18
165 0.17
166 0.18
167 0.19
168 0.22
169 0.21
170 0.22
171 0.24
172 0.24
173 0.27
174 0.3
175 0.37
176 0.36
177 0.39
178 0.36
179 0.35
180 0.35
181 0.29
182 0.26
183 0.21
184 0.21
185 0.24
186 0.26
187 0.3
188 0.32
189 0.32
190 0.35
191 0.33
192 0.34
193 0.31
194 0.3
195 0.29
196 0.32
197 0.32
198 0.31
199 0.29
200 0.27
201 0.3
202 0.31
203 0.3
204 0.26
205 0.3
206 0.28
207 0.36
208 0.42
209 0.44
210 0.52
211 0.61
212 0.66
213 0.65
214 0.66
215 0.63
216 0.67
217 0.63
218 0.54
219 0.47
220 0.43
221 0.37
222 0.35
223 0.3
224 0.24
225 0.21
226 0.2
227 0.18
228 0.18
229 0.17
230 0.18
231 0.24
232 0.2
233 0.19
234 0.17
235 0.19
236 0.19
237 0.2
238 0.2
239 0.15
240 0.19
241 0.2
242 0.21
243 0.2
244 0.2
245 0.26
246 0.26
247 0.27
248 0.29
249 0.33
250 0.38
251 0.39
252 0.43
253 0.42
254 0.4
255 0.46
256 0.47
257 0.43
258 0.36
259 0.37
260 0.31
261 0.26
262 0.26
263 0.19
264 0.16
265 0.15
266 0.15
267 0.16
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.12
284 0.13
285 0.15
286 0.18
287 0.2
288 0.21
289 0.22
290 0.25
291 0.29
292 0.36
293 0.39
294 0.4
295 0.41
296 0.43
297 0.45
298 0.46
299 0.42
300 0.36
301 0.35
302 0.37
303 0.35
304 0.32
305 0.28
306 0.25
307 0.26
308 0.26
309 0.23
310 0.21
311 0.26
312 0.35
313 0.36
314 0.36
315 0.33
316 0.3
317 0.32
318 0.31
319 0.28
320 0.19
321 0.18
322 0.18
323 0.17
324 0.16
325 0.14
326 0.14
327 0.12
328 0.13
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.16
334 0.12
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.08
348 0.1
349 0.16
350 0.2
351 0.26
352 0.28
353 0.29
354 0.28
355 0.28
356 0.3
357 0.24
358 0.24
359 0.22
360 0.21
361 0.23
362 0.24
363 0.24
364 0.22
365 0.23
366 0.19
367 0.15
368 0.16
369 0.13
370 0.11
371 0.1
372 0.08
373 0.06
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.09
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.14
387 0.15
388 0.16
389 0.19
390 0.18
391 0.17
392 0.16
393 0.15
394 0.16
395 0.17
396 0.21
397 0.22
398 0.23
399 0.25
400 0.31
401 0.35
402 0.37
403 0.38
404 0.38
405 0.36
406 0.35
407 0.33
408 0.3
409 0.26
410 0.26
411 0.22
412 0.18
413 0.16
414 0.16
415 0.16
416 0.13
417 0.19
418 0.2
419 0.2
420 0.21
421 0.23
422 0.23
423 0.21
424 0.21
425 0.15
426 0.13
427 0.12
428 0.12
429 0.18
430 0.2
431 0.2
432 0.23
433 0.22
434 0.22
435 0.23
436 0.25
437 0.23
438 0.2
439 0.2
440 0.17
441 0.17
442 0.16
443 0.15
444 0.13
445 0.09
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.09
453 0.08
454 0.09
455 0.1
456 0.11
457 0.12
458 0.16
459 0.16
460 0.16
461 0.18
462 0.17
463 0.15
464 0.16
465 0.16
466 0.17
467 0.2
468 0.23
469 0.23
470 0.27
471 0.3
472 0.3
473 0.29
474 0.28
475 0.24
476 0.19
477 0.2
478 0.16
479 0.14
480 0.14
481 0.13
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.08
488 0.08
489 0.07
490 0.08
491 0.09
492 0.12
493 0.13
494 0.15
495 0.16
496 0.19
497 0.25
498 0.24
499 0.27
500 0.26
501 0.24
502 0.23
503 0.23
504 0.19
505 0.13
506 0.17
507 0.15
508 0.14
509 0.14
510 0.14
511 0.14
512 0.17
513 0.17
514 0.15
515 0.13
516 0.14
517 0.13
518 0.15
519 0.14
520 0.12
521 0.13
522 0.11
523 0.12
524 0.11
525 0.13
526 0.13
527 0.14
528 0.16
529 0.17
530 0.18
531 0.17
532 0.17
533 0.15
534 0.15
535 0.14
536 0.12
537 0.1
538 0.09
539 0.12
540 0.12
541 0.15
542 0.18
543 0.22
544 0.22
545 0.23
546 0.24
547 0.24
548 0.28
549 0.29
550 0.29
551 0.27
552 0.28
553 0.32
554 0.32
555 0.29
556 0.25
557 0.2
558 0.17
559 0.2
560 0.24
561 0.2
562 0.21
563 0.22
564 0.28
565 0.36
566 0.34
567 0.28
568 0.27
569 0.28
570 0.32
571 0.33
572 0.3
573 0.26
574 0.29
575 0.28
576 0.24
577 0.24
578 0.19
579 0.17
580 0.15
581 0.13
582 0.1
583 0.1
584 0.09
585 0.09
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.09
590 0.08
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.07
595 0.06
596 0.05
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.05
601 0.05
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.05
613 0.06
614 0.07
615 0.08
616 0.11
617 0.13
618 0.16
619 0.19
620 0.19
621 0.2
622 0.22
623 0.2
624 0.18
625 0.17
626 0.16
627 0.12
628 0.11
629 0.09
630 0.07
631 0.07
632 0.07
633 0.05
634 0.04
635 0.05
636 0.05
637 0.06
638 0.09
639 0.11
640 0.12
641 0.13
642 0.15
643 0.17
644 0.2
645 0.25
646 0.25
647 0.25
648 0.29
649 0.32
650 0.31
651 0.32
652 0.3
653 0.29
654 0.27
655 0.25
656 0.26
657 0.26
658 0.3
659 0.3
660 0.3
661 0.25
662 0.26
663 0.27
664 0.22
665 0.26
666 0.25
667 0.28
668 0.27
669 0.27
670 0.25
671 0.25
672 0.24
673 0.15
674 0.15
675 0.1
676 0.1
677 0.12
678 0.12
679 0.12
680 0.12
681 0.16
682 0.2
683 0.2
684 0.2
685 0.2
686 0.24
687 0.25
688 0.31
689 0.37
690 0.39
691 0.43
692 0.51
693 0.53
694 0.49
695 0.51
696 0.53
697 0.51
698 0.48
699 0.45
700 0.39
701 0.39
702 0.39
703 0.38
704 0.3
705 0.22
706 0.17
707 0.14
708 0.12
709 0.07
710 0.07
711 0.06
712 0.05
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.08
717 0.08
718 0.09
719 0.12
720 0.14
721 0.16
722 0.19
723 0.25
724 0.28
725 0.32
726 0.34
727 0.36
728 0.35
729 0.34
730 0.32
731 0.26
732 0.24
733 0.22
734 0.22
735 0.19
736 0.19
737 0.19
738 0.2
739 0.2
740 0.2
741 0.19
742 0.19
743 0.19
744 0.18
745 0.18
746 0.16
747 0.15
748 0.14
749 0.13
750 0.11
751 0.11
752 0.11
753 0.15
754 0.15
755 0.14
756 0.13
757 0.13
758 0.13
759 0.12
760 0.12
761 0.09
762 0.09
763 0.1
764 0.1
765 0.1
766 0.13
767 0.15
768 0.15
769 0.15
770 0.15
771 0.15
772 0.16
773 0.16
774 0.13
775 0.1
776 0.1
777 0.09
778 0.08
779 0.1
780 0.09
781 0.08
782 0.08
783 0.08
784 0.09
785 0.09
786 0.1
787 0.08
788 0.11
789 0.13
790 0.15
791 0.15
792 0.15
793 0.14
794 0.15
795 0.15
796 0.12
797 0.12
798 0.11
799 0.11
800 0.14
801 0.17
802 0.2
803 0.22
804 0.25
805 0.26
806 0.28
807 0.31
808 0.35
809 0.41
810 0.4
811 0.44
812 0.41
813 0.4
814 0.37
815 0.34
816 0.27
817 0.18
818 0.17
819 0.12
820 0.13
821 0.13
822 0.12
823 0.12
824 0.13
825 0.12
826 0.13
827 0.16
828 0.17
829 0.24
830 0.28
831 0.3
832 0.38
833 0.43
834 0.44
835 0.5
836 0.55
837 0.59
838 0.65
839 0.74
840 0.75
841 0.8
842 0.87
843 0.87
844 0.9
845 0.89
846 0.85
847 0.85
848 0.78
849 0.71
850 0.66