Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHF3

Protein Details
Accession C9SHF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-69ASPVSQKSKAPKPALRRREKHTKSRSGCKTCKKRKVKVGAFLRGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-61KSKAPKPALRRREKHTKSRSGCKTCKKRKVK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021858  Fun_TF  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG val:VDBG_04485  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11951  Fungal_trans_2  
PF00172  Zn_clus  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MSEAIESCSSDDRSCLASPNSQPYASPVSQKSKAPKPALRRREKHTKSRSGCKTCKKRKVKVGAFLRGMASSIAKLTKSQCDESRPICTRCERMGVSCLYLPEIGRTRRQHGQPGQHTQPPATILRSQPDDNQHLDMPSLELLCSYTEYTSSTLPSASMLRGFWKTTVPRLALKHDYLMHALFALTALHKAQFRIEEREHYLSIAMRHHHHASKSARILLDNITPENGNALFLFSIFTCIVGMCQVTARTASSRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.22
4 0.27
5 0.31
6 0.39
7 0.4
8 0.36
9 0.36
10 0.35
11 0.41
12 0.35
13 0.37
14 0.35
15 0.39
16 0.43
17 0.48
18 0.52
19 0.53
20 0.61
21 0.63
22 0.65
23 0.68
24 0.74
25 0.8
26 0.83
27 0.8
28 0.79
29 0.82
30 0.83
31 0.83
32 0.82
33 0.82
34 0.79
35 0.83
36 0.86
37 0.85
38 0.86
39 0.86
40 0.87
41 0.87
42 0.9
43 0.89
44 0.88
45 0.88
46 0.9
47 0.87
48 0.86
49 0.85
50 0.83
51 0.74
52 0.66
53 0.57
54 0.45
55 0.38
56 0.28
57 0.19
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.11
63 0.13
64 0.19
65 0.22
66 0.26
67 0.28
68 0.33
69 0.37
70 0.38
71 0.45
72 0.44
73 0.42
74 0.41
75 0.41
76 0.4
77 0.37
78 0.4
79 0.32
80 0.28
81 0.31
82 0.28
83 0.26
84 0.23
85 0.21
86 0.16
87 0.16
88 0.14
89 0.13
90 0.17
91 0.18
92 0.24
93 0.26
94 0.3
95 0.36
96 0.38
97 0.44
98 0.45
99 0.52
100 0.52
101 0.57
102 0.56
103 0.52
104 0.5
105 0.42
106 0.36
107 0.29
108 0.23
109 0.18
110 0.17
111 0.15
112 0.17
113 0.2
114 0.19
115 0.2
116 0.23
117 0.24
118 0.23
119 0.24
120 0.22
121 0.19
122 0.18
123 0.15
124 0.11
125 0.09
126 0.08
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.12
149 0.13
150 0.12
151 0.17
152 0.18
153 0.22
154 0.26
155 0.26
156 0.29
157 0.31
158 0.36
159 0.35
160 0.35
161 0.33
162 0.3
163 0.3
164 0.26
165 0.24
166 0.18
167 0.14
168 0.13
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.12
179 0.18
180 0.21
181 0.28
182 0.29
183 0.33
184 0.38
185 0.41
186 0.39
187 0.34
188 0.32
189 0.26
190 0.27
191 0.25
192 0.23
193 0.21
194 0.26
195 0.3
196 0.33
197 0.32
198 0.38
199 0.39
200 0.45
201 0.46
202 0.46
203 0.42
204 0.39
205 0.39
206 0.34
207 0.34
208 0.28
209 0.24
210 0.21
211 0.2
212 0.19
213 0.2
214 0.17
215 0.13
216 0.1
217 0.11
218 0.09
219 0.09
220 0.11
221 0.08
222 0.11
223 0.1
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.07
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.13
235 0.15