Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R448

Protein Details
Accession C4R448    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-306AATAESSNKKKQKQRRKKGAMTDTSSFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-298NKKKQKQRRKKG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0031902  C:late endosome membrane  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0071986  C:Ragulator complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:1904669  P:ATP export  
GO:0034599  P:cellular response to oxidative stress  
GO:0032456  P:endocytic recycling  
GO:0006970  P:response to osmotic stress  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
KEGG ppa:PAS_chr3_1176  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MGRKKFDKKSAQTFKLVYRSREDPLYYDEDAPDLVLKPLPKGDEAKRPNLRLKTKKELDEELKDQVRKNEGEAALYGIIYDDSSYDYMQHLKPIGEQQGVFIPKKEEPVKKKASDIVIKEPQEFLDPKLFQSDSIKEYDHRTQQDVPDEIKGFKPDMDPRLREVLIALEDEAYIDAEQDAEEGDIFDDLLKSGAAEDQEFENQDFDEWDIDNYADELAEYDSDNNNAEFDWQKDFQKFKIAQKQGKIANTWDSDDDFDSDEEEGDIVGELPDLSKEPKIAATAESSNKKKQKQRRKKGAMTDTSSFSMSSSASYRSEGLELLDDKFELIKRQYEEEDEDEDEEYQPFDMKEERQDLEGMIDDLLGNYELQRGGRRLAKKSEDLAAFKRGADSVSKGRAGRSFKKEQSQVDSLSNGVSSLKLSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.72
3 0.69
4 0.61
5 0.57
6 0.55
7 0.51
8 0.53
9 0.47
10 0.39
11 0.39
12 0.41
13 0.37
14 0.35
15 0.32
16 0.27
17 0.25
18 0.22
19 0.18
20 0.13
21 0.12
22 0.13
23 0.13
24 0.15
25 0.18
26 0.19
27 0.21
28 0.26
29 0.31
30 0.39
31 0.45
32 0.53
33 0.58
34 0.62
35 0.67
36 0.7
37 0.75
38 0.74
39 0.77
40 0.78
41 0.77
42 0.79
43 0.76
44 0.75
45 0.72
46 0.7
47 0.65
48 0.62
49 0.6
50 0.56
51 0.53
52 0.49
53 0.48
54 0.4
55 0.39
56 0.4
57 0.34
58 0.32
59 0.3
60 0.27
61 0.22
62 0.21
63 0.18
64 0.1
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.04
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.14
75 0.14
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.19
80 0.24
81 0.27
82 0.26
83 0.25
84 0.23
85 0.28
86 0.31
87 0.29
88 0.25
89 0.24
90 0.23
91 0.3
92 0.37
93 0.39
94 0.42
95 0.51
96 0.58
97 0.57
98 0.59
99 0.58
100 0.58
101 0.56
102 0.53
103 0.53
104 0.52
105 0.51
106 0.49
107 0.44
108 0.36
109 0.34
110 0.3
111 0.23
112 0.24
113 0.23
114 0.22
115 0.26
116 0.26
117 0.22
118 0.26
119 0.27
120 0.21
121 0.23
122 0.23
123 0.2
124 0.25
125 0.31
126 0.33
127 0.31
128 0.33
129 0.34
130 0.37
131 0.41
132 0.39
133 0.34
134 0.31
135 0.31
136 0.28
137 0.26
138 0.24
139 0.19
140 0.17
141 0.2
142 0.21
143 0.27
144 0.32
145 0.32
146 0.34
147 0.38
148 0.37
149 0.33
150 0.28
151 0.22
152 0.17
153 0.15
154 0.12
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.12
218 0.13
219 0.15
220 0.19
221 0.21
222 0.2
223 0.28
224 0.3
225 0.34
226 0.43
227 0.48
228 0.49
229 0.51
230 0.57
231 0.53
232 0.51
233 0.45
234 0.37
235 0.35
236 0.32
237 0.29
238 0.24
239 0.2
240 0.18
241 0.18
242 0.17
243 0.12
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.17
270 0.23
271 0.29
272 0.32
273 0.39
274 0.45
275 0.51
276 0.57
277 0.63
278 0.69
279 0.73
280 0.81
281 0.84
282 0.88
283 0.89
284 0.91
285 0.91
286 0.88
287 0.82
288 0.74
289 0.65
290 0.56
291 0.48
292 0.37
293 0.27
294 0.2
295 0.14
296 0.12
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.14
301 0.14
302 0.14
303 0.15
304 0.13
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.13
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.19
317 0.21
318 0.25
319 0.26
320 0.28
321 0.31
322 0.3
323 0.31
324 0.27
325 0.26
326 0.23
327 0.22
328 0.19
329 0.16
330 0.13
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.1
335 0.13
336 0.14
337 0.2
338 0.25
339 0.26
340 0.25
341 0.26
342 0.25
343 0.23
344 0.22
345 0.16
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.08
355 0.09
356 0.1
357 0.15
358 0.16
359 0.21
360 0.28
361 0.34
362 0.38
363 0.47
364 0.52
365 0.53
366 0.54
367 0.57
368 0.56
369 0.54
370 0.52
371 0.49
372 0.43
373 0.38
374 0.36
375 0.29
376 0.25
377 0.23
378 0.25
379 0.26
380 0.31
381 0.36
382 0.35
383 0.38
384 0.43
385 0.48
386 0.52
387 0.53
388 0.57
389 0.6
390 0.69
391 0.73
392 0.72
393 0.72
394 0.68
395 0.64
396 0.57
397 0.51
398 0.41
399 0.35
400 0.29
401 0.21
402 0.16
403 0.12