Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SNL2

Protein Details
Accession C9SNL2    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-73SKNVAKIREAAKKDKKKKKLNKDYKSYDPTKFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-62KIREAAKKDKKKKKLN
Subcellular Location(s) mito 23.5, mito_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
KEGG val:VDBG_06487  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MATSNQCLASMARLSLSAATRPQASALPRFLAPAVTQTRCASKNVAKIREAAKKDKKKKKLNKDYKSYDPTKFPQFSLCDAMRYLRAYEVGRSPTHIKYELSVRFKTPRNGPSVKGRIRFPNPVKTGDVRVAVICPDDSEVAVQALQAGAVLAGQDAIFEAIRNDKINFNRLLCHSSSEAALTKAGLGRILGPKGLMPNRRMKTITDNVVSAIRDNTGADTYREKMGALRLAVGQLGFTPKMLAANVKAFIESIKQDVEKLEGTHKEVQEVVLSSSHGPGFNLNGLFDPTDEKVTPAHLSQVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.19
4 0.18
5 0.18
6 0.2
7 0.21
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.24
12 0.27
13 0.28
14 0.28
15 0.27
16 0.28
17 0.27
18 0.24
19 0.21
20 0.23
21 0.26
22 0.25
23 0.28
24 0.28
25 0.34
26 0.33
27 0.35
28 0.34
29 0.34
30 0.41
31 0.48
32 0.52
33 0.47
34 0.5
35 0.56
36 0.58
37 0.57
38 0.59
39 0.6
40 0.66
41 0.75
42 0.81
43 0.84
44 0.86
45 0.91
46 0.92
47 0.93
48 0.93
49 0.93
50 0.93
51 0.9
52 0.89
53 0.86
54 0.81
55 0.74
56 0.69
57 0.63
58 0.62
59 0.57
60 0.47
61 0.45
62 0.42
63 0.4
64 0.4
65 0.36
66 0.28
67 0.27
68 0.28
69 0.23
70 0.22
71 0.2
72 0.14
73 0.17
74 0.16
75 0.18
76 0.21
77 0.23
78 0.21
79 0.24
80 0.27
81 0.26
82 0.28
83 0.28
84 0.23
85 0.22
86 0.3
87 0.33
88 0.35
89 0.34
90 0.33
91 0.37
92 0.41
93 0.45
94 0.45
95 0.43
96 0.45
97 0.47
98 0.46
99 0.51
100 0.56
101 0.56
102 0.52
103 0.5
104 0.5
105 0.52
106 0.59
107 0.54
108 0.54
109 0.5
110 0.5
111 0.49
112 0.43
113 0.41
114 0.35
115 0.31
116 0.22
117 0.19
118 0.17
119 0.14
120 0.12
121 0.09
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.05
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.13
153 0.15
154 0.2
155 0.21
156 0.2
157 0.22
158 0.23
159 0.25
160 0.21
161 0.22
162 0.18
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.14
167 0.11
168 0.11
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.07
174 0.06
175 0.09
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.16
182 0.22
183 0.23
184 0.24
185 0.34
186 0.35
187 0.39
188 0.4
189 0.36
190 0.4
191 0.42
192 0.44
193 0.36
194 0.34
195 0.32
196 0.33
197 0.31
198 0.23
199 0.17
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.14
208 0.16
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.15
213 0.18
214 0.2
215 0.18
216 0.17
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.11
222 0.08
223 0.11
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.16
236 0.15
237 0.15
238 0.16
239 0.15
240 0.13
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.17
245 0.19
246 0.18
247 0.19
248 0.23
249 0.23
250 0.28
251 0.34
252 0.34
253 0.32
254 0.3
255 0.3
256 0.26
257 0.25
258 0.21
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.17
263 0.18
264 0.15
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.19
269 0.19
270 0.17
271 0.17
272 0.18
273 0.18
274 0.17
275 0.18
276 0.15
277 0.19
278 0.19
279 0.19
280 0.18
281 0.21
282 0.23
283 0.2