Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SJZ5

Protein Details
Accession C9SJZ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MKRKRRRESHNLVERRRRDNIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-8RKRRRE
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
KEGG val:VDBG_05122  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11387  bHLHzip_USF_MITF  
Amino Acid Sequences MKRKRRRESHNLVERRRRDNINERIQDLSRLVPSHRLEDEKIRKMIQNGTPLSPTLSGISSPSQATSGLAGPGARRATGGAAGNITTGLPLEDKDKGPNKGDILNGAVSWSRDLMWMLHLKLQQQEELMNIIAELGGHFPFELTDDEKRMQTELMEAISKNDALGYSRTAGSGLRVPNHTDLRGEPLNGSGNPSDGLGGSPLDNDDGTVTGDLTGANEFWNDPDDDVSLNFKGDDDFGMDLTQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.83
3 0.79
4 0.73
5 0.72
6 0.72
7 0.73
8 0.73
9 0.71
10 0.66
11 0.63
12 0.59
13 0.53
14 0.43
15 0.36
16 0.29
17 0.25
18 0.24
19 0.28
20 0.29
21 0.31
22 0.33
23 0.33
24 0.32
25 0.41
26 0.49
27 0.49
28 0.5
29 0.47
30 0.47
31 0.46
32 0.52
33 0.47
34 0.46
35 0.41
36 0.41
37 0.39
38 0.37
39 0.36
40 0.28
41 0.23
42 0.16
43 0.13
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.08
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.13
66 0.14
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.06
79 0.09
80 0.1
81 0.16
82 0.21
83 0.24
84 0.26
85 0.28
86 0.28
87 0.28
88 0.28
89 0.23
90 0.2
91 0.17
92 0.15
93 0.13
94 0.12
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.18
109 0.19
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.07
130 0.08
131 0.1
132 0.12
133 0.14
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.11
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.15
160 0.15
161 0.17
162 0.18
163 0.21
164 0.26
165 0.29
166 0.28
167 0.24
168 0.23
169 0.26
170 0.27
171 0.25
172 0.19
173 0.19
174 0.22
175 0.21
176 0.23
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.13
182 0.09
183 0.1
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.16
215 0.14
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.11