Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C9SWI3

Protein Details
Accession C9SWI3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-282HSGPRARRQGRRRPARQTATAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-277RRLQRARAAAADDGHSGPRARRQGRRRPAR
Subcellular Location(s) mito 10, extr 7, cyto 3, plas 3, pero 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG val:VDBG_09258  -  
Amino Acid Sequences MDPPPPYARRLLIALHNGLSRHVVSLPLGPSALAYCVASSALHVVVGSVFFDLVHCLAHHSGRSRNPLLRWLARSHIAHHQYFDRRLHFNPSFNRQNLLLHLPLELVCQAVGSLLSWQLTHVLFPHPQLQRQDLHLVLVFLTIRSGVVAWHEGRDSNHIAYTRLPKDPHAVLVGPEYHALHHVDPQGYFGSMVRLVDWLLGTATTLHGRRITITGARGALGRALADELGREKGRDGADGALRPRLDLRRLQRARAAAADDGHSGPRARRQGRRRPARQTATAPSPSFEGFSGARACLSPSSSSSSSSLLRPEVWYVGSEAELHGAWTDDMRAYTDAKRAFARCARAYCDDDDFTYRHVVPAAFSSAMGPALVSARWAAVVALWWIRRGARYVPVTYTGLAFLNFFRFYFWVTPSAVRKRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.37
4 0.34
5 0.32
6 0.31
7 0.24
8 0.19
9 0.17
10 0.15
11 0.15
12 0.2
13 0.2
14 0.18
15 0.18
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.1
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.06
36 0.05
37 0.05
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.1
44 0.12
45 0.14
46 0.18
47 0.21
48 0.27
49 0.33
50 0.41
51 0.44
52 0.47
53 0.47
54 0.51
55 0.55
56 0.55
57 0.53
58 0.48
59 0.47
60 0.48
61 0.47
62 0.43
63 0.45
64 0.44
65 0.41
66 0.4
67 0.44
68 0.44
69 0.49
70 0.5
71 0.45
72 0.43
73 0.43
74 0.5
75 0.47
76 0.47
77 0.48
78 0.52
79 0.56
80 0.53
81 0.54
82 0.45
83 0.43
84 0.39
85 0.37
86 0.29
87 0.21
88 0.2
89 0.18
90 0.17
91 0.16
92 0.13
93 0.08
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.23
113 0.22
114 0.27
115 0.29
116 0.32
117 0.3
118 0.32
119 0.35
120 0.27
121 0.26
122 0.22
123 0.19
124 0.16
125 0.14
126 0.11
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.12
140 0.12
141 0.17
142 0.18
143 0.15
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.2
148 0.27
149 0.26
150 0.28
151 0.28
152 0.27
153 0.31
154 0.31
155 0.28
156 0.23
157 0.2
158 0.16
159 0.18
160 0.17
161 0.13
162 0.13
163 0.11
164 0.09
165 0.1
166 0.11
167 0.09
168 0.12
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.16
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.1
206 0.09
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.16
225 0.18
226 0.18
227 0.17
228 0.17
229 0.16
230 0.19
231 0.19
232 0.19
233 0.24
234 0.28
235 0.36
236 0.38
237 0.4
238 0.4
239 0.39
240 0.38
241 0.34
242 0.31
243 0.21
244 0.2
245 0.19
246 0.17
247 0.15
248 0.14
249 0.13
250 0.12
251 0.11
252 0.17
253 0.24
254 0.28
255 0.37
256 0.46
257 0.56
258 0.66
259 0.76
260 0.78
261 0.8
262 0.84
263 0.82
264 0.79
265 0.74
266 0.69
267 0.65
268 0.62
269 0.53
270 0.43
271 0.38
272 0.32
273 0.27
274 0.21
275 0.16
276 0.11
277 0.13
278 0.14
279 0.13
280 0.13
281 0.12
282 0.13
283 0.11
284 0.13
285 0.11
286 0.12
287 0.18
288 0.18
289 0.2
290 0.21
291 0.22
292 0.22
293 0.22
294 0.23
295 0.18
296 0.18
297 0.18
298 0.18
299 0.17
300 0.15
301 0.15
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.09
318 0.11
319 0.13
320 0.15
321 0.21
322 0.22
323 0.23
324 0.28
325 0.27
326 0.33
327 0.36
328 0.41
329 0.41
330 0.43
331 0.46
332 0.47
333 0.48
334 0.44
335 0.44
336 0.37
337 0.34
338 0.33
339 0.29
340 0.25
341 0.27
342 0.24
343 0.2
344 0.21
345 0.19
346 0.16
347 0.19
348 0.2
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.09
356 0.07
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.07
367 0.09
368 0.14
369 0.15
370 0.15
371 0.17
372 0.19
373 0.2
374 0.22
375 0.24
376 0.28
377 0.33
378 0.35
379 0.37
380 0.4
381 0.39
382 0.36
383 0.33
384 0.26
385 0.21
386 0.19
387 0.16
388 0.13
389 0.16
390 0.16
391 0.15
392 0.16
393 0.16
394 0.2
395 0.22
396 0.23
397 0.23
398 0.24
399 0.31
400 0.38