FuNGI

C9SX27

Protein Details

Accession

C9SX27

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
159-185	DQDPEERRRREGRRRYRERENNGYRGR	Basic
530-554	ISSERLRRHSLRRRPGQRRRAATSV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
165-177	RRRREGRRRYRER
536-549	RRHSLRRRPGQRRR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019416 NCBP3
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000340 F:RNA 7-methylguanosine cap binding
KEGG	val:VDBG_09327 -
Pfam	View protein in Pfam PF10309 NCBP3
CDD	cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MDFDMVMEDVAESPTRTEAATDDQMIAPAWDTAHDEPFADSESTAIVPNKVYIRGLDTLSTEDVKTFVEDHFGRVNKIEWINDESANLVFQSEDAARDALRALSAQPEAAAQTSAGETVPAKDIPSKPEVNLQIRIALQSDKKAPGAATRSRYYLFHPDQDPEERRRREGRRRYRERENNGYRGRDSYARDRRGSDEIEVFDASLYDDDEATLASRAAKSRTQQRRSRSRGSASGLGGSRRTNAEKELFPNRSSLGNKGSTRNRSASPLRDLLDSRPVVLQDVDSDWFRPRQPSSAHEPSLNNTYTTDNSNLKEGQASYKGHLPPAPAALEEIVDDRAHAWHHPTLDQTVDILYTLMMTKSVSTPLPVEFDPHIRHLLEGFSGLQTSLHETQQLLAEETETKRRSLDEFTTMSIDWGKKESDYKAEIRRLELLLARAAPEGVAAVVLARSGSVVDRSLAESRRFKARIRDLTDGAGVDPILSQHAQAGADVELGDVCCPTETRFRKPQRFASHRSLLTMRQDLAPDADVISSERLRRHSLRRRPGQRRRAATSVVNAGSSSQEPGVHQGCRPANLEHPKPGLYLGPGTGRLDNFLRSRLTDHLTAGSGAPNSSSTDQFDDLDRSEDEGVTETHHRRIFSFQAGDDRLPMVSHHCTSPSKQCCENSVIDRHKASTTSLTMSPAKRSQGEEVGEAAESTGYSSNEMVSEENAVSSSYKRTLTSGGNDVHEVTPTEKVSCQGLVMAPYEDFRSPQCRNRSASLPEDRCETTESGSRSGRKITTRTISDACQRLTLVDFGRQPGERPSMSRSSASYT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.11
4	0.11
5	0.12
6	0.18
7	0.21
8	0.22
9	0.23
10	0.22
11	0.23
12	0.23
13	0.21
14	0.15
15	0.11
16	0.1
17	0.09
18	0.13
19	0.15
20	0.18
21	0.18
22	0.18
23	0.17
24	0.18
25	0.2
26	0.16
27	0.14
28	0.11
29	0.12
30	0.12
31	0.15
32	0.15
33	0.13
34	0.13
35	0.17
36	0.2
37	0.2
38	0.21
39	0.19
40	0.22
41	0.24
42	0.25
43	0.22
44	0.21
45	0.22
46	0.24
47	0.24
48	0.19
49	0.17
50	0.16
51	0.15
52	0.15
53	0.13
54	0.11
55	0.17
56	0.18
57	0.21
58	0.28
59	0.28
60	0.28
61	0.29
62	0.3
63	0.29
64	0.32
65	0.3
66	0.26
67	0.31
68	0.32
69	0.31
70	0.3
71	0.24
72	0.21
73	0.2
74	0.16
75	0.1
76	0.07
77	0.06
78	0.1
79	0.09
80	0.1
81	0.11
82	0.12
83	0.11
84	0.12
85	0.13
86	0.1
87	0.1
88	0.09
89	0.09
90	0.12
91	0.13
92	0.12
93	0.11
94	0.12
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.07
99	0.08
100	0.08
101	0.09
102	0.08
103	0.08
104	0.07
105	0.09
106	0.12
107	0.11
108	0.12
109	0.18
110	0.21
111	0.25
112	0.31
113	0.31
114	0.3
115	0.37
116	0.44
117	0.42
118	0.45
119	0.41
120	0.38
121	0.36
122	0.36
123	0.3
124	0.27
125	0.24
126	0.24
127	0.28
128	0.26
129	0.26
130	0.27
131	0.26
132	0.28
133	0.33
134	0.35
135	0.37
136	0.36
137	0.39
138	0.39
139	0.39
140	0.38
141	0.41
142	0.38
143	0.38
144	0.38
145	0.38
146	0.41
147	0.48
148	0.49
149	0.46
150	0.52
151	0.49
152	0.53
153	0.6
154	0.65
155	0.68
156	0.74
157	0.77
158	0.78
159	0.86
160	0.88
161	0.9
162	0.9
163	0.88
164	0.88
165	0.85
166	0.84
167	0.79
168	0.75
169	0.65
170	0.57
171	0.52
172	0.46
173	0.42
174	0.43
175	0.47
176	0.5
177	0.51
178	0.5
179	0.51
180	0.5
181	0.48
182	0.4
183	0.34
184	0.29
185	0.29
186	0.26
187	0.22
188	0.17
189	0.15
190	0.12
191	0.08
192	0.07
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.08
203	0.1
204	0.13
205	0.17
206	0.21
207	0.31
208	0.42
209	0.5
210	0.55
211	0.63
212	0.71
213	0.76
214	0.8
215	0.76
216	0.71
217	0.69
218	0.68
219	0.63
220	0.53
221	0.5
222	0.43
223	0.37
224	0.32
225	0.26
226	0.23
227	0.2
228	0.22
229	0.18
230	0.2
231	0.23
232	0.24
233	0.29
234	0.36
235	0.36
236	0.34
237	0.34
238	0.31
239	0.32
240	0.31
241	0.3
242	0.26
243	0.3
244	0.32
245	0.37
246	0.44
247	0.43
248	0.46
249	0.46
250	0.43
251	0.42
252	0.45
253	0.44
254	0.42
255	0.41
256	0.37
257	0.37
258	0.36
259	0.32
260	0.35
261	0.29
262	0.25
263	0.21
264	0.2
265	0.19
266	0.18
267	0.15
268	0.09
269	0.1
270	0.11
271	0.1
272	0.11
273	0.12
274	0.14
275	0.15
276	0.18
277	0.17
278	0.22
279	0.24
280	0.28
281	0.35
282	0.41
283	0.41
284	0.41
285	0.4
286	0.37
287	0.4
288	0.36
289	0.27
290	0.2
291	0.2
292	0.18
293	0.2
294	0.21
295	0.18
296	0.18
297	0.21
298	0.2
299	0.18
300	0.19
301	0.17
302	0.17
303	0.19
304	0.19
305	0.18
306	0.24
307	0.24
308	0.24
309	0.25
310	0.23
311	0.19
312	0.2
313	0.19
314	0.13
315	0.12
316	0.11
317	0.1
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.09
328	0.1
329	0.12
330	0.13
331	0.13
332	0.14
333	0.14
334	0.13
335	0.11
336	0.09
337	0.08
338	0.07
339	0.06
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.05
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.09
352	0.09
353	0.12
354	0.11
355	0.13
356	0.12
357	0.16
358	0.17
359	0.18
360	0.19
361	0.16
362	0.16
363	0.14
364	0.14
365	0.1
366	0.09
367	0.08
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.05
372	0.05
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.14
380	0.14
381	0.11
382	0.09
383	0.1
384	0.11
385	0.12
386	0.18
387	0.16
388	0.16
389	0.15
390	0.16
391	0.18
392	0.19
393	0.21
394	0.19
395	0.19
396	0.2
397	0.21
398	0.2
399	0.18
400	0.17
401	0.15
402	0.1
403	0.11
404	0.1
405	0.1
406	0.12
407	0.13
408	0.15
409	0.18
410	0.23
411	0.28
412	0.33
413	0.33
414	0.31
415	0.33
416	0.29
417	0.27
418	0.23
419	0.18
420	0.14
421	0.13
422	0.12
423	0.1
424	0.09
425	0.08
426	0.06
427	0.05
428	0.03
429	0.03
430	0.02
431	0.02
432	0.02
433	0.02
434	0.02
435	0.02
436	0.02
437	0.03
438	0.03
439	0.04
440	0.04
441	0.05
442	0.06
443	0.08
444	0.12
445	0.15
446	0.19
447	0.21
448	0.23
449	0.31
450	0.32
451	0.32
452	0.38
453	0.45
454	0.49
455	0.52
456	0.54
457	0.47
458	0.47
459	0.46
460	0.36
461	0.27
462	0.18
463	0.12
464	0.07
465	0.06
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.06
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.06
487	0.16
488	0.19
489	0.27
490	0.37
491	0.47
492	0.56
493	0.62
494	0.69
495	0.71
496	0.74
497	0.74
498	0.73
499	0.71
500	0.62
501	0.6
502	0.52
503	0.45
504	0.42
505	0.37
506	0.29
507	0.23
508	0.23
509	0.2
510	0.19
511	0.16
512	0.12
513	0.1
514	0.08
515	0.07
516	0.08
517	0.09
518	0.1
519	0.12
520	0.14
521	0.16
522	0.22
523	0.27
524	0.37
525	0.45
526	0.54
527	0.62
528	0.7
529	0.78
530	0.84
531	0.9
532	0.9
533	0.88
534	0.86
535	0.82
536	0.75
537	0.68
538	0.6
539	0.53
540	0.48
541	0.4
542	0.32
543	0.26
544	0.22
545	0.19
546	0.17
547	0.14
548	0.09
549	0.09
550	0.09
551	0.14
552	0.16
553	0.16
554	0.16
555	0.22
556	0.23
557	0.25
558	0.27
559	0.24
560	0.3
561	0.37
562	0.4
563	0.38
564	0.39
565	0.37
566	0.35
567	0.34
568	0.26
569	0.2
570	0.17
571	0.14
572	0.14
573	0.15
574	0.16
575	0.17
576	0.16
577	0.17
578	0.17
579	0.19
580	0.18
581	0.2
582	0.19
583	0.18
584	0.21
585	0.22
586	0.25
587	0.22
588	0.22
589	0.21
590	0.21
591	0.2
592	0.18
593	0.16
594	0.13
595	0.11
596	0.1
597	0.1
598	0.12
599	0.13
600	0.13
601	0.14
602	0.16
603	0.17
604	0.18
605	0.19
606	0.19
607	0.17
608	0.19
609	0.17
610	0.16
611	0.16
612	0.15
613	0.14
614	0.13
615	0.12
616	0.12
617	0.18
618	0.18
619	0.24
620	0.26
621	0.26
622	0.26
623	0.31
624	0.33
625	0.33
626	0.34
627	0.29
628	0.34
629	0.36
630	0.35
631	0.31
632	0.27
633	0.21
634	0.18
635	0.17
636	0.14
637	0.16
638	0.17
639	0.17
640	0.21
641	0.23
642	0.27
643	0.37
644	0.4
645	0.41
646	0.46
647	0.47
648	0.47
649	0.49
650	0.51
651	0.47
652	0.49
653	0.49
654	0.48
655	0.47
656	0.45
657	0.42
658	0.38
659	0.34
660	0.3
661	0.26
662	0.26
663	0.25
664	0.28
665	0.31
666	0.32
667	0.36
668	0.34
669	0.36
670	0.35
671	0.37
672	0.37
673	0.38
674	0.38
675	0.34
676	0.31
677	0.28
678	0.25
679	0.21
680	0.17
681	0.1
682	0.08
683	0.08
684	0.09
685	0.08
686	0.09
687	0.1
688	0.1
689	0.11
690	0.12
691	0.11
692	0.09
693	0.11
694	0.1
695	0.1
696	0.1
697	0.1
698	0.1
699	0.11
700	0.15
701	0.16
702	0.18
703	0.18
704	0.2
705	0.24
706	0.28
707	0.32
708	0.35
709	0.35
710	0.35
711	0.35
712	0.35
713	0.31
714	0.27
715	0.23
716	0.18
717	0.2
718	0.19
719	0.2
720	0.19
721	0.2
722	0.21
723	0.2
724	0.18
725	0.16
726	0.16
727	0.16
728	0.17
729	0.17
730	0.15
731	0.15
732	0.18
733	0.16
734	0.15
735	0.17
736	0.23
737	0.28
738	0.36
739	0.44
740	0.48
741	0.53
742	0.57
743	0.62
744	0.6
745	0.63
746	0.66
747	0.61
748	0.56
749	0.56
750	0.51
751	0.45
752	0.43
753	0.35
754	0.28
755	0.3
756	0.31
757	0.32
758	0.37
759	0.39
760	0.38
761	0.42
762	0.44
763	0.45
764	0.47
765	0.5
766	0.53
767	0.54
768	0.57
769	0.55
770	0.54
771	0.56
772	0.57
773	0.5
774	0.43
775	0.39
776	0.34
777	0.33
778	0.33
779	0.27
780	0.27
781	0.28
782	0.28
783	0.33
784	0.32
785	0.32
786	0.34
787	0.38
788	0.33
789	0.34
790	0.38
791	0.4
792	0.43
793	0.43

C9SX27

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer