Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SKL0

Protein Details
Accession C9SKL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-366LEWQWRQKQMDREERPEKKRARKAVKTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
353-365RPEKKRARKAVKT
Subcellular Location(s) mito 10.5, nucl 9, cyto_mito 8.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001441  UPP_synth-like  
IPR018520  UPP_synth-like_CS  
IPR036424  UPP_synth-like_sf  
Gene Ontology GO:0016765  F:transferase activity, transferring alkyl or aryl (other than methyl) groups  
GO:0019408  P:dolichol biosynthetic process  
KEGG val:VDBG_05337  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01255  Prenyltransf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01066  UPP_SYNTHASE  
CDD cd00475  Cis_IPPS  
Amino Acid Sequences MAEIFQNISKWLLRSPPSEWAINQLRELLIGALKQGPVPQHVAFEMDGNRRYARGKRMETIEGHHHGFEALARVLEICYKSGVKVVTVYAFSIENFNRPQYEVDGLMELAKVKLEQLTHHGDLLDKYGAAVRVLGQRDLLREDVLEVVDRAVEMTKNNKKNALNICLPYTSREEMATAIRSTVEDYMTPPEPKFTAFPASRITQKILSKQLDEKDQKDWPAVHEITPIPSSPTPSSRSVADDDTASSATLPPGSPSPPHITHHEPGQSLLKNPETITAETLNNHMYTAGDPPLDIFVRTSGVERLSDFMLWQAHQDTQIFFLKCLWPEFDLQHWLPVLLEWQWRQKQMDREERPEKKRARKAVKTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.41
4 0.42
5 0.43
6 0.4
7 0.42
8 0.46
9 0.44
10 0.42
11 0.35
12 0.31
13 0.28
14 0.29
15 0.21
16 0.14
17 0.12
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.17
25 0.22
26 0.21
27 0.21
28 0.21
29 0.22
30 0.2
31 0.22
32 0.24
33 0.25
34 0.27
35 0.27
36 0.28
37 0.27
38 0.31
39 0.34
40 0.38
41 0.42
42 0.45
43 0.49
44 0.54
45 0.58
46 0.55
47 0.54
48 0.53
49 0.48
50 0.44
51 0.37
52 0.32
53 0.26
54 0.24
55 0.2
56 0.16
57 0.12
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.14
63 0.13
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.16
69 0.16
70 0.13
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.15
80 0.14
81 0.16
82 0.17
83 0.18
84 0.18
85 0.19
86 0.2
87 0.18
88 0.2
89 0.16
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.1
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.13
104 0.2
105 0.2
106 0.21
107 0.21
108 0.2
109 0.19
110 0.21
111 0.16
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.11
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.14
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.18
126 0.17
127 0.11
128 0.1
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.14
142 0.23
143 0.28
144 0.29
145 0.35
146 0.35
147 0.41
148 0.46
149 0.44
150 0.4
151 0.36
152 0.37
153 0.33
154 0.32
155 0.27
156 0.24
157 0.19
158 0.16
159 0.15
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.07
173 0.1
174 0.12
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.17
183 0.16
184 0.18
185 0.21
186 0.22
187 0.25
188 0.25
189 0.26
190 0.24
191 0.26
192 0.29
193 0.34
194 0.33
195 0.32
196 0.35
197 0.36
198 0.4
199 0.41
200 0.37
201 0.34
202 0.35
203 0.34
204 0.32
205 0.3
206 0.23
207 0.27
208 0.26
209 0.22
210 0.22
211 0.22
212 0.21
213 0.21
214 0.19
215 0.15
216 0.15
217 0.18
218 0.17
219 0.21
220 0.22
221 0.25
222 0.26
223 0.24
224 0.26
225 0.25
226 0.24
227 0.21
228 0.17
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.11
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.15
243 0.21
244 0.23
245 0.26
246 0.3
247 0.34
248 0.34
249 0.4
250 0.4
251 0.33
252 0.32
253 0.36
254 0.32
255 0.29
256 0.31
257 0.27
258 0.24
259 0.24
260 0.27
261 0.24
262 0.24
263 0.24
264 0.23
265 0.22
266 0.21
267 0.23
268 0.19
269 0.16
270 0.15
271 0.12
272 0.1
273 0.1
274 0.12
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.14
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.13
288 0.14
289 0.15
290 0.14
291 0.16
292 0.15
293 0.15
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.17
302 0.18
303 0.16
304 0.18
305 0.25
306 0.24
307 0.22
308 0.25
309 0.27
310 0.28
311 0.3
312 0.28
313 0.23
314 0.25
315 0.27
316 0.28
317 0.31
318 0.29
319 0.3
320 0.28
321 0.26
322 0.23
323 0.21
324 0.19
325 0.15
326 0.21
327 0.21
328 0.3
329 0.35
330 0.4
331 0.44
332 0.49
333 0.55
334 0.59
335 0.67
336 0.66
337 0.7
338 0.76
339 0.82
340 0.81
341 0.82
342 0.82
343 0.81
344 0.83
345 0.84
346 0.85