Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SN90

Protein Details
Accession C9SN90    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-306EKAAEEKKKEEEKKKRPPQPPSYNSTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-170IRRKRR
277-298KAAEEKAAEEKKKEEEKKKRPP
Subcellular Location(s) cyto 12, nucl 10, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021056  Mt_import_IM_translocase_Tim54  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
KEGG val:VDBG_06365  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11711  Tim54  
Amino Acid Sequences MADAKPPVEPAPASAATPGTAPAASTSTTHTKAPGYKVPERNPALRMLGIPNLPKKLPSRNWTIFLTITTAFSAAVIYDKREKKRATARWARAVAPLATEPIDNPSQLPRKLTVLLEAPPGEGLRVAQDHFIEYVKPVLAASGLDWDFVQGRQQGDVRAAVAEKIRRKRRLAERPDEELLPTEENVRDAVRAKNQIPEYQGDAGDIVIGRNAWKEYIRGLHEGWLGPLDAPAQPEPETKPEPVLSAEPVVTPVADAIAETVEEAERKAADAKAAEEKAAEEKAAEEKKKEEEKKKRPPQPPSYNSTADYAAAHLPPTLPEQLAPAAPIQFPHILGFFNTFTRLKRFLNRRALADDIGREVAAACFAAHREWREGEPGVSSDDDELKLEQQRVLAHEEKNWVKSVWEEEKAPEEGKEAEPPREKVWPESMVLDTRIASRMRRFEVQPEDEARARAIVVPEEEIEGFIKGSLRSIAQWGMSAFAAENKGPNVGNLDDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.19
4 0.19
5 0.17
6 0.11
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.12
13 0.17
14 0.22
15 0.24
16 0.25
17 0.26
18 0.29
19 0.34
20 0.4
21 0.42
22 0.43
23 0.5
24 0.59
25 0.64
26 0.68
27 0.68
28 0.66
29 0.61
30 0.58
31 0.51
32 0.43
33 0.38
34 0.32
35 0.32
36 0.31
37 0.34
38 0.34
39 0.35
40 0.34
41 0.36
42 0.38
43 0.43
44 0.49
45 0.49
46 0.54
47 0.56
48 0.6
49 0.58
50 0.56
51 0.47
52 0.39
53 0.37
54 0.27
55 0.22
56 0.18
57 0.16
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.07
62 0.1
63 0.09
64 0.13
65 0.21
66 0.29
67 0.34
68 0.42
69 0.44
70 0.49
71 0.59
72 0.65
73 0.67
74 0.71
75 0.74
76 0.75
77 0.77
78 0.69
79 0.63
80 0.57
81 0.46
82 0.38
83 0.31
84 0.22
85 0.2
86 0.18
87 0.14
88 0.15
89 0.16
90 0.13
91 0.14
92 0.2
93 0.26
94 0.28
95 0.3
96 0.28
97 0.3
98 0.33
99 0.32
100 0.28
101 0.24
102 0.24
103 0.25
104 0.24
105 0.21
106 0.18
107 0.18
108 0.14
109 0.11
110 0.09
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.1
121 0.12
122 0.1
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.15
137 0.12
138 0.12
139 0.14
140 0.16
141 0.16
142 0.17
143 0.17
144 0.14
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.14
149 0.18
150 0.24
151 0.33
152 0.41
153 0.47
154 0.5
155 0.59
156 0.66
157 0.72
158 0.74
159 0.75
160 0.72
161 0.72
162 0.71
163 0.61
164 0.51
165 0.41
166 0.33
167 0.24
168 0.18
169 0.14
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.1
175 0.12
176 0.15
177 0.17
178 0.22
179 0.23
180 0.28
181 0.3
182 0.31
183 0.31
184 0.29
185 0.28
186 0.25
187 0.24
188 0.17
189 0.16
190 0.13
191 0.11
192 0.1
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.09
203 0.14
204 0.16
205 0.17
206 0.17
207 0.2
208 0.2
209 0.2
210 0.18
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.07
216 0.06
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.16
224 0.17
225 0.16
226 0.18
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.05
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.1
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.07
268 0.07
269 0.14
270 0.19
271 0.19
272 0.18
273 0.2
274 0.27
275 0.36
276 0.43
277 0.47
278 0.53
279 0.63
280 0.74
281 0.82
282 0.85
283 0.85
284 0.87
285 0.87
286 0.87
287 0.82
288 0.77
289 0.73
290 0.66
291 0.58
292 0.5
293 0.4
294 0.29
295 0.23
296 0.19
297 0.14
298 0.12
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.11
305 0.09
306 0.09
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.13
323 0.11
324 0.11
325 0.14
326 0.15
327 0.16
328 0.21
329 0.24
330 0.24
331 0.32
332 0.41
333 0.47
334 0.57
335 0.58
336 0.56
337 0.56
338 0.55
339 0.48
340 0.41
341 0.33
342 0.24
343 0.21
344 0.17
345 0.14
346 0.12
347 0.1
348 0.08
349 0.07
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.08
354 0.11
355 0.13
356 0.16
357 0.18
358 0.19
359 0.23
360 0.23
361 0.22
362 0.21
363 0.19
364 0.18
365 0.16
366 0.15
367 0.13
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.14
373 0.17
374 0.18
375 0.18
376 0.18
377 0.19
378 0.21
379 0.26
380 0.28
381 0.26
382 0.28
383 0.35
384 0.36
385 0.37
386 0.37
387 0.3
388 0.26
389 0.27
390 0.32
391 0.31
392 0.3
393 0.29
394 0.29
395 0.34
396 0.35
397 0.33
398 0.26
399 0.21
400 0.21
401 0.21
402 0.28
403 0.26
404 0.32
405 0.37
406 0.39
407 0.4
408 0.44
409 0.44
410 0.4
411 0.44
412 0.39
413 0.35
414 0.35
415 0.35
416 0.31
417 0.31
418 0.27
419 0.21
420 0.2
421 0.23
422 0.21
423 0.23
424 0.27
425 0.32
426 0.36
427 0.41
428 0.42
429 0.46
430 0.54
431 0.55
432 0.54
433 0.5
434 0.5
435 0.47
436 0.46
437 0.38
438 0.29
439 0.25
440 0.22
441 0.2
442 0.18
443 0.17
444 0.18
445 0.17
446 0.19
447 0.18
448 0.16
449 0.15
450 0.12
451 0.11
452 0.1
453 0.12
454 0.1
455 0.12
456 0.13
457 0.13
458 0.14
459 0.17
460 0.19
461 0.17
462 0.2
463 0.18
464 0.18
465 0.17
466 0.16
467 0.13
468 0.14
469 0.16
470 0.15
471 0.17
472 0.16
473 0.19
474 0.18
475 0.19
476 0.2