Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SWN3

Protein Details
Accession C9SWN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-190LEGRKAMQRRRHPDKAARGKQRKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
169-190GRKAMQRRRHPDKAARGKQRKG
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, extr 2, cyto 1, plas 1, pero 1, vacu 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013654  PAS_2  
Gene Ontology GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG val:VDBG_09308  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08446  PAS_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50112  PAS  
Amino Acid Sequences MLQASRARRGLAHVASLHAHDAMKQVVRFWVPKKAKAGGPIARPIALYLPIFCLVERMGICNVPLEITTLPSRPKRKTESTAPQAPQGPSSWAACPLPLHLSFLPCIVLFLAHRSAFVPDAPPETAEEMDRENRRERGAAVARAKSNTRPVHWGGGWGGEEGTRGQLEGRKAMQRRRHPDKAARGKQRKGAQGTAEPSSLPSGISHGPRGQCCPRLEERLMVQPQQTAGTMNDQPSPSEVDESPLSGGAMDGSSQSTLQPVESPIPLIPPPSSAATQDAGHDPVPQQTPSARSSWSASSGRQPGHSPDLSDRVFPIRSVVSVNPAGRTSGEHGYFPRMPDHGQYTAARPDAPRPRRSDSVSQPAASAVTSPTDDRQTARNRRKHTSSGPISSIQADAARHANSMPLPIFESDACGSEGGHSSRLDRSNTSQPSHAQPVSTPAGSVPDSHGLILPRFRHVTTDDGHAVITGPDAVLQHCEDEPIHTPGAVQGFGLLLALREDQEGGFSVRYTSENSERIIGYSPKQLFNLASFLDILSEEQQDNLLDHIDFIRDEDADPATNGPEVFSLTVRSSGRKSTKLWCAIHINPAHPDLIICEFELDDDHLYPLRPADGGRSRRRLKDTLRSDPTMEGSFPAAPRYSANR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.34
4 0.3
5 0.23
6 0.2
7 0.16
8 0.17
9 0.19
10 0.22
11 0.22
12 0.22
13 0.25
14 0.29
15 0.34
16 0.34
17 0.41
18 0.42
19 0.48
20 0.52
21 0.54
22 0.53
23 0.55
24 0.61
25 0.57
26 0.57
27 0.58
28 0.54
29 0.48
30 0.45
31 0.38
32 0.32
33 0.28
34 0.23
35 0.17
36 0.18
37 0.18
38 0.19
39 0.17
40 0.17
41 0.13
42 0.18
43 0.17
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.18
48 0.17
49 0.17
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.13
55 0.16
56 0.18
57 0.24
58 0.32
59 0.4
60 0.43
61 0.52
62 0.57
63 0.63
64 0.68
65 0.72
66 0.75
67 0.76
68 0.8
69 0.73
70 0.7
71 0.67
72 0.6
73 0.51
74 0.42
75 0.36
76 0.29
77 0.29
78 0.25
79 0.22
80 0.22
81 0.21
82 0.2
83 0.18
84 0.21
85 0.2
86 0.23
87 0.21
88 0.23
89 0.22
90 0.22
91 0.21
92 0.15
93 0.15
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.12
98 0.17
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.18
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.14
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.18
112 0.18
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.22
117 0.25
118 0.27
119 0.3
120 0.32
121 0.33
122 0.34
123 0.31
124 0.34
125 0.37
126 0.41
127 0.43
128 0.45
129 0.45
130 0.47
131 0.48
132 0.42
133 0.44
134 0.41
135 0.37
136 0.38
137 0.39
138 0.43
139 0.41
140 0.4
141 0.31
142 0.3
143 0.28
144 0.22
145 0.19
146 0.12
147 0.13
148 0.1
149 0.11
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.12
154 0.13
155 0.17
156 0.2
157 0.26
158 0.32
159 0.4
160 0.47
161 0.54
162 0.62
163 0.68
164 0.73
165 0.74
166 0.78
167 0.81
168 0.83
169 0.83
170 0.84
171 0.83
172 0.79
173 0.79
174 0.77
175 0.74
176 0.67
177 0.62
178 0.55
179 0.53
180 0.51
181 0.45
182 0.39
183 0.31
184 0.26
185 0.22
186 0.18
187 0.12
188 0.09
189 0.1
190 0.13
191 0.14
192 0.16
193 0.19
194 0.22
195 0.23
196 0.29
197 0.31
198 0.34
199 0.34
200 0.38
201 0.39
202 0.42
203 0.43
204 0.4
205 0.37
206 0.4
207 0.41
208 0.36
209 0.32
210 0.26
211 0.25
212 0.23
213 0.21
214 0.13
215 0.11
216 0.14
217 0.15
218 0.16
219 0.18
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.2
224 0.16
225 0.16
226 0.15
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.14
231 0.11
232 0.1
233 0.07
234 0.07
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.09
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.11
258 0.12
259 0.13
260 0.11
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.13
271 0.15
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.16
276 0.17
277 0.18
278 0.15
279 0.14
280 0.17
281 0.17
282 0.21
283 0.19
284 0.18
285 0.23
286 0.26
287 0.26
288 0.25
289 0.25
290 0.23
291 0.27
292 0.26
293 0.21
294 0.19
295 0.25
296 0.24
297 0.23
298 0.2
299 0.18
300 0.17
301 0.16
302 0.16
303 0.1
304 0.1
305 0.12
306 0.11
307 0.12
308 0.15
309 0.16
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.13
314 0.14
315 0.13
316 0.14
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.2
321 0.21
322 0.21
323 0.19
324 0.15
325 0.15
326 0.17
327 0.2
328 0.16
329 0.17
330 0.17
331 0.18
332 0.2
333 0.2
334 0.19
335 0.15
336 0.22
337 0.29
338 0.35
339 0.38
340 0.41
341 0.46
342 0.49
343 0.54
344 0.54
345 0.51
346 0.54
347 0.51
348 0.46
349 0.4
350 0.36
351 0.31
352 0.23
353 0.17
354 0.08
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.1
360 0.11
361 0.11
362 0.18
363 0.27
364 0.37
365 0.46
366 0.51
367 0.55
368 0.61
369 0.65
370 0.65
371 0.62
372 0.62
373 0.58
374 0.56
375 0.53
376 0.48
377 0.43
378 0.37
379 0.31
380 0.21
381 0.16
382 0.12
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.11
387 0.11
388 0.12
389 0.1
390 0.13
391 0.11
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.1
397 0.13
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.13
405 0.11
406 0.13
407 0.12
408 0.13
409 0.18
410 0.22
411 0.22
412 0.22
413 0.26
414 0.33
415 0.37
416 0.37
417 0.35
418 0.34
419 0.38
420 0.42
421 0.37
422 0.28
423 0.24
424 0.28
425 0.28
426 0.25
427 0.2
428 0.14
429 0.17
430 0.16
431 0.17
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.15
436 0.16
437 0.15
438 0.16
439 0.2
440 0.19
441 0.19
442 0.21
443 0.21
444 0.21
445 0.22
446 0.24
447 0.21
448 0.26
449 0.23
450 0.22
451 0.22
452 0.19
453 0.17
454 0.13
455 0.12
456 0.06
457 0.04
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.09
465 0.11
466 0.1
467 0.12
468 0.16
469 0.17
470 0.17
471 0.15
472 0.15
473 0.16
474 0.18
475 0.15
476 0.11
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.06
482 0.04
483 0.05
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.08
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.12
497 0.14
498 0.17
499 0.21
500 0.23
501 0.24
502 0.27
503 0.25
504 0.26
505 0.27
506 0.25
507 0.22
508 0.28
509 0.3
510 0.29
511 0.3
512 0.3
513 0.27
514 0.26
515 0.27
516 0.19
517 0.17
518 0.14
519 0.14
520 0.12
521 0.12
522 0.11
523 0.1
524 0.11
525 0.1
526 0.1
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.11
531 0.1
532 0.08
533 0.09
534 0.09
535 0.1
536 0.09
537 0.1
538 0.11
539 0.1
540 0.1
541 0.11
542 0.12
543 0.12
544 0.13
545 0.12
546 0.12
547 0.13
548 0.12
549 0.11
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.11
554 0.13
555 0.12
556 0.18
557 0.19
558 0.22
559 0.23
560 0.31
561 0.37
562 0.4
563 0.42
564 0.45
565 0.54
566 0.6
567 0.59
568 0.56
569 0.57
570 0.55
571 0.6
572 0.55
573 0.48
574 0.42
575 0.42
576 0.36
577 0.28
578 0.26
579 0.2
580 0.2
581 0.18
582 0.15
583 0.14
584 0.13
585 0.14
586 0.15
587 0.14
588 0.12
589 0.12
590 0.13
591 0.13
592 0.14
593 0.15
594 0.14
595 0.13
596 0.12
597 0.12
598 0.2
599 0.28
600 0.37
601 0.46
602 0.55
603 0.61
604 0.69
605 0.75
606 0.75
607 0.74
608 0.76
609 0.76
610 0.76
611 0.77
612 0.73
613 0.68
614 0.62
615 0.57
616 0.49
617 0.4
618 0.3
619 0.25
620 0.25
621 0.24
622 0.24
623 0.21
624 0.19